Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  7  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2432399--2432443
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14
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0
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0
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2.0
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0
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19
19
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2.1
26
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0
99
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2.1
24
92
0
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44
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2
38
1.59
2443859--2443889
16
2.0
15
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53
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1.41
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30
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2.0
42
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0
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6
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96
2.7
96
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10
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2.0
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11
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1.72
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3.1
16
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18
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1
0
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2
0
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0
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52
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3.0
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25
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1.77
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2468495--2468548
27
2.0
28
82
10
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59
1
5
33
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
33
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3
8
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3.9
11
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0
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60
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0
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100
0
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0
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1.12
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8
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5
0
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1.17
2472914--2472947
15
2.3
15
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10
52
64
5
0
29
1.17
2473054--2473113
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2.9
20
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23
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106
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6
35
1.40
2473090--2473307
25
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25
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15
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6
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24
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0
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4
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4
100
0
50
24
0
24
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3.8
11
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3
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7
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43
1.53
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2.3
11
100
0
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20
0
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1.52
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2.1
29
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93
27
6
3
62
1.37
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27
2.4
27
81
7
67
26
7
7
57
1.55
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2.1
21
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31
0
0
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2.2
22
81
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13
100
0
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0
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2.0
30
90
0
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26
1
13
58
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.33
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16
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53
17
0
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1.48
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32
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3
106
17
0
33
48
1.48
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21
2.1
21
82
0
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43
2
4
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1.35
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11
4.7
11
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13
63
64
1
32
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1.15
2527802--2527872
3
25.3
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29
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1.07
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2.0
24
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0
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29
22
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2.0
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2
0
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1.9
25
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4
0
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12
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16
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0
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2.5
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25
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11
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2.0
34
100
0
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17
5
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1.70
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12
3.2
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16
50
24
0
2
73
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2588826--2588890
31
2.1
30
82
2
76
52
10
6
30
1.61
2592288--2592429
60
2.4
59
76
6
144
27
15
8
48
1.74
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3
100
0
52
34
0
0
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300
81
6
708
39
10
14
36
1.79
2597123--2597654
285
1.9
280
78
8
585
39
10
13
35
1.80
2597894--2597947
26
2.1
26
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0
72
27
5
7
59
1.47
2601209--2601235
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0
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18
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0
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0
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1.56
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18
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2
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100
0
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0
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16
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1.18
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20
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20
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6
0
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2.0
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28
4
3
64
1.28
2620531--2620589
25
2.5
23
75
8
66
61
1
0
37
1.07
2622286--2622326
21
2.0
21
85
9
57
26
0
17
56
1.41
2622357--2622390
11
3.0
11
86
4
50
55
0
2
41
1.15
2622632--2622672
20
2.1
20
95
4
75
51
0
0
48
1.00
2622630--2622674
19
2.4
18
89
10
72
51
0
0
48
1.00
2622630--2622686
20
2.8
21
78
10
73
52
0
0
47
1.00
2622806--2622859
25
2.1
27
82
6
67
40
5
0
53
1.24
2629305--2629368
29
2.2
30
81
13
80
75
3
10
10
1.17
2632277--2632335
15
3.8
15
72
14
57
49
1
3
45
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2632269--2632339
31
2.3
31
90
0
106
50
1
4
43
1.30
2632855--2632927
36
2.0
36
83
0
92
32
19
17
30
1.95
2639304--2639335
16
2.0
16
93
0
55
50
15
21
12
1.77
2646642--2646698
25
2.2
25
96
3
105
28
14
7
50
1.68
2647829--2647897
36
1.9
36
96
0
129
27
20
8
43
1.81
2657398--2657447
23
2.1
25
85
14
70
70
4
0
26
1.05
2658029--2658076
23
2.2
21
82
14
53
72
2
2
22
1.05
2661168--2661230
32
2.0
31
84
9
83
38
6
1
53
1.36
2662338--2662378
20
2.0
20
100
0
82
41
4
14
39
1.67
2669602--2669642
20
2.0
20
95
0
73
58
0
0
41
0.98
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16
2.9
16
84
12
53
47
2
0
50
1.12
2709148--2709221
29
2.6
28
76
14
73
29
4
8
58
1.46
2709849--2709981
68
2.0
68
81
3
160
47
11
16
24
1.79
2710551--2710631
31
2.5
31
74
18
85
46
12
11
29
1.76
2713482--2713556
11
6.3
11
71
21
53
26
2
0
70
1.00
2713483--2713556
38
1.9
38
89
5
114
27
2
0
70
1.01
2713481--2713556
23
3.5
23
72
15
72
27
2
0
69
1.01
2713713--2713758
15
3.0
15
80
3
56
30
4
4
60
1.35
2715209--2715249
22
1.9
21
85
5
55
39
2
2
56
1.26
2716572--2716625
17
3.2
17
70
15
58
61
3
3
31
1.31
2716584--2716641
16
3.6
16
71
13
55
65
6
1
25
1.27
2716571--2716646
33
2.3
33
100
0
152
61
5
2
30
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2719578--2719621
23
1.9
23
81
9
54
40
11
9
38
1.73
2725338--2725377
21
2.0
20
85
5
53
52
2
0
45
1.14
2727663--2727700
20
1.9
20
88
0
58
36
18
5
39
1.73
2728898--2729325
174
2.5
173
87
1
615
27
16
19
36
1.93
2729255--2729323
31
2.3
31
82
12
81
23
10
21
44
1.82
2734462--2734514
26
2.0
26
100
0
106
43
11
11
33
1.76
2736539--2736592
25
2.2
25
96
0
99
29
5
27
37
1.80
2760765--2760789
7
3.6
7
100
0
50
28
16
12
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1.83
2761133--2761202
31
2.3
31
84
0
95
25
27
18
28
1.98
2763008--2763201
64
3.1
64
77
15
237
35
15
16
32
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290