Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  73  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22097762--22097825
32
2.0
32
81
0
74
48
3
0
48
1.17
22101142--22101347
54
3.8
54
76
3
173
28
20
13
37
1.90
22101138--22101394
54
4.8
52
72
8
167
27
19
13
39
1.89
22103125--22103171
10
4.7
10
89
7
69
27
8
0
63
1.23
22103898--22103972
39
2.0
39
84
7
102
26
12
2
58
1.47
22108536--22109114
120
4.8
120
93
0
901
30
18
16
34
1.93
22109062--22109197
42
3.1
42
64
25
111
34
20
13
31
1.91
22109018--22109202
88
2.1
88
100
0
370
31
20
14
33
1.93
22108900--22109321
208
2.0
205
94
1
727
31
19
15
33
1.92
22117322--22117369
15
3.3
15
81
16
57
39
12
25
22
1.89
22119573--22119598
13
2.0
13
100
0
52
38
15
7
38
1.76
22119394--22119800
202
2.0
202
99
0
796
33
20
14
31
1.93
22119775--22119800
13
2.0
13
100
0
52
38
15
7
38
1.76
22121562--22121641
34
2.4
35
78
16
89
55
3
10
31
1.51
22127691--22127732
16
2.5
17
85
14
61
33
0
0
66
0.92
22127689--22127735
7
6.6
7
77
22
53
31
0
0
68
0.90
22127689--22127735
18
2.6
18
84
15
62
31
0
0
68
0.90
22129631--22129828
96
2.1
96
90
1
308
25
11
28
34
1.90
22130483--22130531
10
4.9
10
82
12
57
22
8
2
67
1.28
22131254--22131338
39
2.2
39
85
10
113
27
14
3
55
1.55
22134333--22136116
595
3.0
595
93
0
3052
23
31
17
26
1.97
22151302--22151345
19
2.3
19
84
7
54
50
2
11
36
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22152102--22152134
3
11.0
3
100
0
66
33
0
0
66
0.92
22157405--22157460
25
2.2
25
100
0
112
35
28
0
35
1.58
22157357--22157507
72
2.1
72
87
2
214
29
29
6
33
1.83
22157434--22157692
47
5.4
49
92
5
431
30
27
7
33
1.85
22161267--22161427
40
4.1
40
77
11
129
29
25
20
24
1.99
22161452--22161580
41
3.1
41
76
14
138
27
25
20
25
1.99
22161754--22162269
42
12.7
40
73
14
393
25
26
22
26
2.00
22164624--22164825
49
4.1
49
93
5
356
31
27
7
33
1.85
22164624--22164825
97
2.1
98
93
5
356
31
27
7
33
1.85
22167539--22167911
78
4.8
76
78
14
306
31
19
18
30
1.96
22167564--22167911
74
4.5
76
76
14
288
31
19
18
30
1.96
22167662--22167974
151
2.1
146
83
12
397
30
18
19
30
1.96
22172980--22173122
39
3.7
38
77
8
146
30
24
19
25
1.98
22173009--22173126
38
3.0
39
75
13
127
27
25
20
26
1.99
22173035--22173211
92
1.9
95
88
8
274
27
25
20
25
1.99
22173142--22173376
39
6.1
39
79
7
232
28
25
20
25
1.99
22173131--22173376
79
3.2
79
86
5
324
28
25
20
25
1.99
22173389--22173913
40
13.2
40
82
6
640
27
26
20
25
1.99
22173284--22173471
95
2.0
95
90
4
299
26
25
23
25
2.00
22173380--22173909
79
6.7
79
88
5
734
27
25
20
26
1.99
22173389--22173909
159
3.3
157
89
5
773
27
26
20
25
1.99
22175183--22175217
18
2.1
17
89
10
54
28
17
0
54
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22176214--22176472
51
5.4
49
87
8
372
30
28
7
33
1.84
22176171--22176463
98
3.0
97
85
8
402
29
29
8
33
1.87
22194544--22194586
16
2.8
16
86
6
63
41
0
58
0
0.98
22209812--22210157
172
2.0
172
96
0
638
18
28
9
43
1.81
22210417--22210464
21
2.3
20
92
3
78
25
12
0
62
1.30
22218221--22218258
7
5.4
7
93
0
67
18
0
39
42
1.50
22219778--22219816
20
2.1
19
85
9
53
2
28
17
51
1.59
22227024--22227062
8
5.0
8
84
6
53
58
2
0
38
1.12
22227025--22227055
15
2.1
15
93
0
53
61
0
0
38
0.96
22227106--22227164
20
3.1
19
83
9
75
28
5
0
66
1.13
22227112--22227172
20
3.0
20
73
17
56
31
3
0
65
1.09
22227329--22227378
21
2.4
21
76
6
57
40
28
12
20
1.87
22229039--22229071
17
1.9
17
93
0
57
6
18
12
63
1.48
22229598--22229673
28
2.9
26
84
5
82
43
9
17
30
1.80
22233435--22233492
18
3.2
18
68
18
57
63
3
6
25
1.35
22233430--22233509
37
2.2
37
97
2
153
65
2
7
25
1.32
22234403--22234427
13
1.9
13
100
0
50
52
16
16
16
1.76
22236420--22236578
44
3.7
43
73
12
139
23
15
27
33
1.95
22236420--22236578
43
3.7
43
76
9
155
23
15
27
33
1.95
22238922--22238988
35
1.9
35
81
6
82
35
2
7
53
1.44
22240616--22240653
20
1.9
20
94
0
67
31
0
10
57
1.32
22240799--22240823
12
2.1
12
100
0
50
44
0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22241257--22241308
23
2.4
21
77
6
50
34
3
0
61
1.14
22243226--22243413
93
2.0
93
98
0
367
19
18
7
54
1.66
22243743--22243777
17
2.1
17
88
0
52
28
31
25
14
1.95
22243956--22243996
21
2.0
21
85
9
57
21
34
21
21
1.97
22245123--22245180
30
1.9
30
85
0
80
17
32
32
17
1.93
22247008--22247072
5
11.6
5
79
20
67
75
3
3
18
1.07
22247008--22247072
12
5.8
10
81
18
67
75
3
3
18
1.07
22247007--22247072
18
3.9
16
79
16
71
75
3
3
18
1.06
22251848--22251891
12
3.7
11
85
11
52
77
2
6
13
1.07
22253708--22253745
18
2.1
19
90
5
60
73
0
7
18
1.06
22253699--22253751
18
3.1
17
78
10
54
69
0
11
18
1.17
22272116--22272166
19
2.7
18
77
17
59
76
5
1
15
1.07
22272116--22272167
18
2.8
19
85
8
72
75
5
1
17
1.10
22278833--22278888
26
2.2
25
84
9
69
66
1
1
30
1.12
22280286--22280324
15
2.4
17
83
16
55
33
0
0
66
0.92
22280283--22280319
16
2.4
16
91
8
60
32
0
0
67
0.91
22280376--22280510
5
29.0
5
69
20
80
36
2
0
60
1.14
22280342--22280451
50
2.2
51
83
9
136
31
1
1
64
1.14
22280473--22280528
28
2.0
27
83
10
69
35
7
0
57
1.26
22280709--22280759
22
2.3
23
80
12
61
33
3
13
49
1.61
22292696--22292834
47
3.0
47
67
16
124
32
19
20
28
1.97
22292643--22292834
94
2.1
94
89
1
296
32
18
21
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22294553--22294589
16
2.4
16
91
8
60
32
0
0
67
0.91
22294563--22294656
20
4.6
20
68
19
59
35
2
2
60
1.20
22294643--22294784
5
30.0
5
72
17
90
35
2
0
61
1.13
22294608--22294720
52
2.2
51
83
13
133
32
1
1
63
1.15
22294613--22294784
32
5.7
31
73
22
109
34
2
1
61
1.19
22294647--22294769
34
3.5
35
71
21
105
34
1
0
62
1.11
22294607--22294771
10
15.7
10
68
22
81
33
1
1
63
1.16
22294649--22294784
39
3.5
40
77
16
119
36
2
0
61
1.14
22294904--22294956
17
3.1
17
81
13
56
33
0
1
64
1.05
22294906--22294960
9
6.0
10
71
25
50
36
0
1
61
1.06
22294985--22295035
22
2.3
23
80
12
61
33
3
13
49
1.61
22306396--22306434
17
2.2
18
90
4
62
17
46
23
12
1.83
22307607--22307682
38
2.0
38
89
0
116
48
15
11
23
1.78
22310043--22310086
20
2.3
19
84
4
52
43
6
6
43
1.57
22312573--22312681
41
2.7
41
82
2
132
36
21
16
25
1.94
22312595--22312705
41
2.8
40
83
5
138
36
22
18
23
1.95
22312855--22312960
50
2.1
51
92
3
187
41
18
1
37
1.62
22312875--22312960
24
3.5
24
66
17
68
40
20
1
37
1.61
22321000--22321139
55
2.5
55
78
4
165
26
30
29
13
1.94
22325716--22325751
18
2.0
18
89
10
56
55
13
0
30
1.39
22327182--22327211
15
2.0
15
93
0
51
63
23
0
13
1.29
22328425--22328466
2
21.0
2
100
0
84
50
0
50
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22329506--22329622
60
2.0
59
81
5
137
41
5
3
49
1.41
22331164--22331224
20
3.1
19
81
9
68
1
21
1
75
0.98
22331158--22331246
46
2.0
45
85
10
121
1
21
3
74
1.03
22346404--22346533
50
2.6
50
87
2
181
21
27
20
30
1.98
22352712--22352802
43
2.1
43
97
0
173
43
20
12
23
1.85
22354053--22354181
50
2.7
48
82
10
158
25
27
20
26
1.99
22357495--22357524
13
2.3
13
94
0
51
23
0
3
73
0.98
22357495--22357535
19
2.1
21
86
13
61
26
0
2
70
0.99
22360730--22360791
28
2.1
28
91
5
97
41
1
6
50
1.38
22362097--22362163
18
3.6
18
75
11
62
40
5
14
38
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290