Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  95  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29131089--29131819
147
4.9
148
86
5
938
32
20
17
30
1.95
29144739--29144775
3
12.3
3
100
0
74
67
0
0
32
0.91
29145252--29145289
11
3.3
12
89
10
62
47
0
52
0
1.00
29145254--29145297
22
2.0
22
86
8
63
43
0
56
0
0.99
29145390--29145432
8
5.1
8
78
10
50
13
2
4
79
1.00
29145805--29145873
35
2.0
35
100
0
138
20
11
50
17
1.76
29146768--29146794
13
2.1
13
100
0
54
22
14
7
55
1.64
29148831--29148908
41
1.9
41
84
5
104
20
17
30
30
1.96
29150824--29150864
18
2.3
18
87
4
57
51
2
2
43
1.28
29154265--29154303
20
2.0
20
94
0
69
64
2
10
23
1.37
29160951--29160986
19
1.9
19
88
5
56
44
11
0
44
1.39
29167026--29167076
24
2.1
24
81
0
57
41
7
21
29
1.81
29173160--29173237
27
2.9
27
90
0
111
20
23
28
28
1.99
29176637--29176699
33
1.9
33
93
0
108
28
12
42
15
1.84
29179162--29179218
29
1.9
30
82
3
71
54
1
1
42
1.21
29182840--29182918
40
2.0
40
85
5
106
29
18
20
31
1.97
29183995--29184033
20
2.0
19
90
5
60
41
2
2
53
1.28
29186144--29186169
11
2.4
11
100
0
52
76
7
0
15
0.99
29187633--29187716
30
2.7
31
87
7
127
26
22
16
34
1.95
29187935--29188030
26
3.8
26
91
2
135
26
22
25
26
2.00
29188163--29188210
25
1.9
25
82
0
60
31
16
20
31
1.95
29195427--29195496
6
11.2
6
74
17
54
75
5
18
0
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29198332--29198363
16
1.9
17
93
6
57
81
0
3
15
0.82
29201670--29201756
33
2.7
31
77
6
93
14
33
27
24
1.95
29202337--29202397
20
3.2
20
73
13
56
55
3
13
27
1.53
29202385--29202416
16
1.9
17
93
6
57
81
0
3
15
0.82
29207106--29207354
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99
29207105--29207354
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
26
1.99
29207449--29207480
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
29207692--29207749
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
29220676--29220704
3
9.7
3
100
0
58
68
0
31
0
0.89
29221694--29221731
20
1.9
20
89
10
60
34
26
7
31
1.85
29225588--29225637
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
29230226--29230275
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
29237894--29237972
25
3.3
25
61
10
65
32
5
29
32
1.79
29237878--29238300
47
9.1
47
93
2
665
32
9
29
28
1.88
29237878--29238300
92
4.5
94
92
1
656
32
9
29
28
1.88
29238014--29238086
22
3.3
22
62
11
58
31
10
27
30
1.91
29237878--29238243
186
2.0
185
95
1
653
32
8
28
30
1.87
29237878--29238300
139
3.0
140
90
2
663
32
9
29
28
1.88
29237896--29238300
186
2.2
185
90
1
623
32
8
29
28
1.87
29238419--29238497
37
2.1
37
88
4
115
25
18
30
25
1.98
29243559--29243596
20
1.9
20
89
10
60
39
5
7
47
1.55
29245219--29245487
137
2.0
137
89
1
414
30
8
21
39
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29245992--29246057
2
34.0
2
83
6
64
43
0
56
0
0.99
29248033--29248064
16
2.0
16
93
0
55
28
0
0
71
0.86
29248145--29248188
23
1.9
23
86
9
63
34
13
6
45
1.70
29248211--29248307
31
3.1
31
80
5
90
53
2
5
39
1.35
29251287--29251372
42
2.0
42
93
0
145
50
15
5
29
1.67
29251397--29251436
19
2.2
18
90
4
62
42
12
2
42
1.56
29255675--29255763
42
2.1
42
95
0
160
51
14
5
28
1.65
29255676--29255785
42
2.6
42
85
7
107
51
13
5
29
1.63
29255788--29255827
19
2.2
19
90
4
64
42
12
2
42
1.56
29267173--29267247
36
2.1
36
100
0
150
26
21
17
34
1.95
29279830--29279858
15
1.9
15
100
0
58
34
34
13
17
1.89
29283352--29283476
43
2.9
42
84
2
151
26
13
24
35
1.93
29286667--29286702
14
2.5
15
86
4
56
44
5
2
47
1.41
29290517--29290711
93
2.1
92
88
4
286
44
4
4
47
1.41
29290744--29290777
17
2.0
17
94
0
59
44
5
0
50
1.26
29290793--29290971
54
3.1
54
65
22
137
41
2
7
48
1.43
29290836--29290870
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
29290786--29291008
120
1.9
120
96
0
410
42
2
6
48
1.40
29290957--29290991
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
29290945--29291216
144
1.9
147
94
3
487
47
2
3
46
1.34
29291101--29291135
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
29291297--29291391
45
2.1
45
88
1
138
32
27
5
34
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29291370--29291402
16
2.1
16
94
0
57
30
36
0
33
1.58
29291383--29291425
21
2.0
21
95
0
77
34
37
0
27
1.57
29291564--29291678
58
1.9
60
84
5
153
22
16
9
51
1.73
29291562--29291699
58
2.3
58
81
7
152
23
16
10
48
1.78
29292119--29292240
31
3.9
30
84
9
147
41
10
21
26
1.85
29292361--29292399
14
2.7
14
88
4
60
33
0
2
64
1.08
29292507--29292532
12
2.2
12
100
0
52
38
0
0
61
0.96
29293216--29293366
82
1.8
82
97
0
284
45
11
10
32
1.75
29297173--29297247
38
2.0
38
84
10
100
69
0
4
26
1.06
29297162--29297256
39
2.4
39
79
10
122
64
0
3
32
1.10
29297727--29297758
6
5.2
6
96
3
55
3
31
0
65
1.08
29302813--29302863
20
2.5
22
78
15
56
35
3
3
56
1.36
29309805--29309846
21
2.0
20
86
4
57
38
7
0
54
1.28
29314005--29314031
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
29318782--29318870
38
2.2
40
84
5
110
51
5
2
40
1.38
29319846--29319877
7
4.6
7
100
0
64
0
12
0
87
0.54
29320436--29320475
14
2.9
14
84
0
53
32
7
17
42
1.77
29320459--29320497
20
2.0
20
89
0
60
28
10
12
48
1.74
29325934--29325974
6
6.8
6
97
0
64
21
0
0
78
0.76
29325930--29325974
18
2.5
18
88
0
72
24
0
0
75
0.80
29325930--29325977
6
8.0
6
95
0
60
25
0
0
75
0.81
29327007--29327134
48
2.7
47
83
4
152
21
13
30
35
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29334179--29334305
48
2.7
46
82
4
139
23
14
28
33
1.94
29335658--29335719
27
2.3
26
76
13
63
48
11
1
38
1.49
29336289--29336317
11
2.7
11
94
5
51
0
10
0
89
0.48
29338837--29338901
5
12.6
5
82
9
51
73
4
0
21
1.00
29345346--29345407
27
2.3
26
76
13
63
48
11
1
38
1.49
29347387--29347423
18
2.0
18
89
5
56
29
0
10
59
1.31
29348909--29349191
18
15.3
18
71
11
169
36
15
12
35
1.86
29348909--29349191
36
7.6
36
71
12
196
36
15
12
35
1.86
29348990--29349191
72
2.8
71
81
5
228
36
15
12
35
1.86
29349359--29349643
45
6.3
45
92
0
428
40
21
19
18
1.92
29349794--29349831
16
2.4
16
84
16
53
36
7
0
55
1.29
29349783--29349848
23
3.1
23
75
20
63
31
9
0
59
1.29
29351287--29351321
9
4.0
9
88
7
54
17
11
0
71
1.14
29351287--29351333
17
2.7
18
86
6
69
17
10
0
72
1.12
29351287--29351329
13
3.3
13
83
9
52
16
11
0
72
1.13
29351355--29351392
20
1.9
20
88
0
58
34
5
7
52
1.53
29351438--29351479
16
2.6
16
100
0
84
61
0
0
38
0.96
29351432--29351483
5
10.4
5
82
10
54
59
0
0
40
0.97
29352563--29352622
14
4.4
14
82
4
77
48
3
11
36
1.56
29352557--29352608
27
1.9
27
100
0
104
44
3
13
38
1.62
29353154--29353189
13
2.8
13
88
12
56
47
2
0
50
1.15
29353276--29353327
13
4.2
12
76
13
61
46
0
1
51
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29354466--29354578
57
2.0
56
94
3
201
36
0
26
36
1.63
29356237--29356274
17
2.2
18
85
4
51
23
34
18
23
1.96
29359825--29359857
15
2.2
15
94
0
57
24
9
21
45
1.80
29367542--29367573
12
2.7
12
100
0
64
31
15
0
53
1.43
29367601--29367652
25
2.0
27
85
11
72
28
19
1
50
1.58
29385493--29385533
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
29391421--29391544
47
2.6
47
84
5
144
30
25
15
29
1.96
29391568--29391838
31
8.7
31
92
0
389
25
26
19
28
1.99
29391816--29391944
50
2.5
51
87
5
181
26
22
17
34
1.96
29398115--29398157
19
2.2
20
91
4
70
51
9
2
37
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290