Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  42  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13814832--13814857
3
8.7
3
100
0
52
30
0
0
69
0.89
13821015--13821048
16
2.1
16
88
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50
32
14
0
52
1.42
13821336--13821645
138
2.2
138
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0
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21
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13
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1.89
13821343--13821647
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6.6
46
84
0
360
21
23
13
41
1.88
13823488--13823535
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4.2
11
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62
2
0
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1.07
13824646--13824767
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2.3
54
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0
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29
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1.84
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4.4
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52
61
0
2
35
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13856374--13856461
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4
108
23
20
22
32
1.98
13860495--13860570
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15
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2
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2.0
13
100
0
52
23
7
30
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1.83
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17
2.3
17
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0
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58
2
2
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1
1276
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23
18
30
1.98
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2.3
43
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105
27
24
16
30
1.97
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2.2
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3
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26
23
14
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13887722--13887841
46
2.6
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25
22
15
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19
2.1
19
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9
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156
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19
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1.98
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1.8
93
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0
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20
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1.98
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4.6
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0
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11
17
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2.7
30
82
7
99
11
17
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7.8
47
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0
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28
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13902440--13902518
37
2.1
37
88
0
113
24
17
31
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13904369--13904813
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5.6
78
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4
388
24
20
28
26
1.99
13904449--13904866
79
5.3
80
90
2
571
23
21
28
25
1.99
13904449--13904879
119
3.6
119
87
3
557
23
21
29
25
1.99
13904369--13904866
40
12.6
40
88
3
554
24
21
28
25
1.99
13907761--13908289
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11.3
47
97
0
977
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30
29
1.87
13908408--13908486
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
13910163--13910381
40
5.6
38
78
10
162
25
21
27
25
1.99
13910318--13910658
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91
1
533
23
22
28
25
1.99
13913558--13913993
47
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47
97
0
800
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1.87
13914112--13914190
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2.1
37
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0
122
24
18
31
25
1.98
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12.6
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2
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23
21
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26
1.99
13918426--13918601
46
3.8
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4
156
23
20
26
29
1.99
13918422--13918593
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1.8
93
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0
254
23
20
27
28
1.99
13922744--13922993
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6.3
40
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2
312
27
26
22
24
2.00
13926509--13926607
49
2.0
49
100
0
198
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4
10
26
1.47
13926533--13926614
23
3.5
22
68
22
67
60
3
9
25
1.44
13932597--13932653
25
2.2
25
84
3
78
3
24
1
70
1.13
13935687--13935853
46
3.5
45
73
13
136
28
28
16
26
1.97
13936915--13936979
23
3.0
21
82
12
87
38
24
20
16
1.93
13937164--13937243
28
2.8
29
86
3
117
47
31
3
17
1.65
13945597--13945621
9
2.8
9
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0
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20
0
0
80
0.72
13946913--13947033
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2.6
46
82
5
145
28
19
27
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13955918--13955947
15
2.0
15
93
0
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20
26
23
30
1.98
13961512--13961964
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3.0
153
90
0
694
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9
11
39
1.76
13964407--13964504
27
3.5
28
90
2
135
26
13
28
31
1.94
13964435--13964517
27
3.0
27
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5
96
30
12
25
32
1.92
13964407--13964518
28
4.0
27
83
6
98
28
12
25
33
1.92
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11.6
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19
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0
1
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13973292--13973340
6
8.5
6
76
17
50
83
14
0
2
0.73
13973289--13973344
22
2.6
23
81
13
66
83
14
0
1
0.72
13974835--13974894
30
2.0
30
86
0
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40
5
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31
1.76
13984129--13984215
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2.0
44
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0
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9
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2
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23
27
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1.99
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21
2.4
21
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57
56
0
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0
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0
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2.1
27
96
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103
28
1
17
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1.56
14024632--14024691
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2.2
27
87
0
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3
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46
1.64
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0
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21
14
0
64
1.28
14026161--14026207
14
3.4
14
71
11
51
21
10
0
68
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14027489--14027571
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2.0
41
95
0
148
39
15
10
33
1.82
14028941--14028982
16
2.6
16
77
7
50
35
0
2
61
1.09
14032607--14032669
27
2.3
27
77
0
63
25
15
19
39
1.91
14035638--14035690
26
2.0
26
96
0
97
28
33
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15
1.94
14035740--14035791
26
2.0
26
96
0
95
28
34
23
13
1.92
14035607--14035970
101
3.6
102
92
5
569
30
30
20
18
1.97
14036300--14036359
30
2.0
29
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3
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31
25
6
36
1.82
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30
2.2
29
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10
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29
28
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35
1.82
14042074--14042130
30
1.9
30
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80
29
24
7
38
1.82
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2.1
12
100
0
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8
16
28
1.74
14051658--14051720
31
2.1
31
90
3
101
41
6
15
36
1.73
14051781--14051816
17
2.1
17
94
0
63
8
22
22
47
1.77
14058808--14058850
18
2.4
19
80
11
54
67
0
0
32
0.91
14059066--14059105
14
2.9
14
84
0
53
32
7
17
42
1.77
14059088--14059127
20
2.0
20
85
0
53
32
12
12
42
1.80
14059075--14059140
35
1.9
34
90
3
105
31
10
15
42
1.81
14060278--14060312
18
1.9
18
88
0
52
45
0
54
0
0.99
14063073--14063099
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
14065418--14065482
31
2.1
32
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2
105
33
10
20
35
1.87
14073031--14073075
14
3.3
14
84
6
56
51
0
0
48
1.00
14073033--14073070
16
2.3
17
81
9
51
44
0
0
55
0.99
14072985--14073075
14
6.0
14
67
22
51
48
1
3
47
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14073087--14073131
24
1.9
24
86
4
65
51
2
4
42
1.34
14078591--14078945
46
7.7
46
91
2
489
37
15
25
21
1.93
14083983--14084039
15
3.9
15
83
2
80
35
1
12
50
1.50
14084411--14084518
21
5.0
22
75
10
98
14
23
25
37
1.93
14084423--14084518
21
4.5
21
86
2
120
13
22
26
37
1.91
14084410--14084518
42
2.5
42
85
8
157
15
22
24
36
1.93
14088261--14088387
63
2.0
63
92
3
211
35
17
10
37
1.84
14092772--14092887
62
1.9
59
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5
178
52
3
2
41
1.32
14096467--14096495
14
2.1
14
100
0
58
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13
0
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1.42
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21
3.3
21
87
2
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11
24
8
55
1.64
14101796--14101853
21
2.8
21
75
12
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0
1
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0.99
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7.0
46
92
0
453
39
14
24
21
1.91
14107630--14107689
22
2.9
21
80
9
61
36
0
1
61
1.06
14108323--14108376
22
2.4
23
75
9
58
55
1
1
40
1.21
14110030--14110110
39
2.1
39
100
0
162
34
7
23
34
1.83
14114592--14114633
11
3.7
11
84
6
57
76
0
0
23
0.79
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13
1.9
13
100
0
50
20
40
24
16
1.91
14123006--14123048
21
2.0
21
82
8
52
23
20
4
51
1.66
14124092--14124184
39
2.5
37
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7
98
27
29
22
20
1.98
14124539--14124586
3
16.0
3
82
0
60
58
6
0
35
1.23
14124540--14124588
18
2.7
18
93
0
80
55
8
0
36
1.30
14124539--14124586
12
4.0
12
91
0
69
58
6
0
35
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14125293--14125332
20
2.0
20
85
9
55
2
15
5
77
1.04
14125463--14125530
31
2.3
28
78
9
73
41
2
1
54
1.24
14125509--14125547
21
1.9
20
84
5
51
46
2
0
51
1.14
14130647--14130698
6
8.5
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78
3
0
17
0.89
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19
3.9
19
81
6
80
74
4
0
21
0.98
14130647--14130698
25
2.1
25
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79
78
3
0
17
0.89
14130718--14130786
9
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9
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7
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1.75
14130718--14130786
27
2.6
27
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27
7
18
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1.75
14134269--14134407
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1.9
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1
253
41
9
9
39
1.69
14150154--14150192
18
2.2
18
86
9
53
64
7
5
23
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290