Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  8  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2763068--2763342
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54
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0
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2.4
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0
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0
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0
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2.5
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1
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21
1.25
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11
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61
68
1
7
22
1.22
2767534--2767616
23
3.7
22
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78
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1
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21
1.23
2767572--2767611
17
2.2
17
91
8
62
70
0
7
22
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2767557--2767616
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4.1
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70
0
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1.14
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19
4.1
19
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22
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67
0
10
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1.20
2767611--2767660
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2
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60
0
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20
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150
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107
4.7
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553
29
20
16
34
1.94
2769251--2769806
212
2.6
211
80
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532
29
20
16
33
1.94
2769483--2769918
54
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183
29
19
16
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1.94
2769575--2769918
160
2.1
162
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430
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19
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1.94
2769735--2769985
112
2.3
108
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2.0
25
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2.0
38
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0
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26
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152
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445
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14
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1.9
65
94
0
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16
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16
90
0
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28
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33
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3.1
13
92
0
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0
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0
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2.0
20
82
17
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36
2
0
60
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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102
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0
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2
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13
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0
0
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2.0
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12
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11
14
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12
12
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21
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59
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20
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13
20
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2.1
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0
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100
0
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20
2.5
21
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9
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47
1
5
45
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2901940--2901966
4
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4
100
0
54
25
0
22
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1.48
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2.4
16
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60
31
0
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60
1.25
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19
2.6
19
81
12
66
60
8
0
32
1.26
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12
2.1
12
100
0
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24
0
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68
1.16
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30
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16
69
45
0
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51
1.17
2914478--2914530
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2.8
19
73
21
58
52
3
0
43
1.19
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15
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16
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14
52
64
0
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33
1.07
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41
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99
60
2
3
33
1.28
2918321--2918395
20
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20
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1
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83
16
52
61
0
2
35
1.09
2927160--2927193
16
2.1
16
88
0
50
35
0
0
64
0.94
2932281--2932349
27
2.4
28
79
15
79
39
36
5
18
1.75
2933398--2933446
25
2.0
24
84
11
64
22
8
0
69
1.14
2935574--2935617
9
4.9
9
85
0
61
54
2
0
43
1.12
2935608--2935640
17
1.9
18
88
11
52
42
12
0
45
1.41
2936624--2936688
21
3.2
21
74
12
73
41
20
26
12
1.87
2936618--2936706
39
2.3
39
96
0
160
39
22
24
13
1.90
2943441--2943488
22
2.1
23
84
7
62
45
8
2
43
1.45
2949256--2949290
15
2.2
16
90
5
54
68
0
2
28
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2951522--2951562
16
2.6
16
80
0
55
53
0
29
17
1.44
2953526--2953558
13
2.4
14
90
10
50
45
0
3
51
1.16
2953823--2953868
22
2.0
22
84
12
58
41
6
2
50
1.40
2955526--2955661
68
2.0
69
88
5
206
46
4
3
45
1.40
2955955--2955997
20
2.2
19
83
4
50
55
0
4
39
1.20
2958976--2959003
9
3.1
9
100
0
56
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0
0
35
0.94
2962766--2962825
31
2.0
29
87
12
86
41
0
0
58
0.98
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20
2.0
21
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13
52
50
0
11
38
1.40
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13
2.6
13
80
0
50
26
0
2
70
1.01
2969259--2969289
8
3.8
8
95
4
53
9
9
0
80
0.90
2969258--2969289
9
3.7
9
91
8
57
9
9
0
81
0.88
2969251--2969289
17
2.5
15
91
8
60
7
10
0
82
0.86
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22
3.2
20
76
19
66
44
0
1
54
1.09
2969394--2969461
23
2.9
23
80
12
68
39
0
1
58
1.07
2969375--2969461
21
3.9
23
76
13
83
42
0
1
56
1.07
2969374--2969465
22
4.2
22
69
14
64
41
0
1
57
1.06
2969596--2969637
22
1.9
22
85
9
59
23
2
2
71
1.10
2969673--2969697
13
1.9
13
100
0
50
12
8
0
80
0.92
2970216--2970314
10
10.4
9
75
10
65
51
3
1
44
1.23
2970206--2970268
29
2.2
29
91
2
101
55
3
0
41
1.16
2970207--2970314
39
2.8
39
74
12
100
52
2
0
43
1.22
2970419--2970584
87
1.9
87
96
2
309
54
10
16
17
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2973244--2973361
51
2.3
51
89
2
175
27
21
11
39
1.88
2974205--2974270
33
2.1
32
88
5
98
45
21
0
33
1.52
2974214--2974282
33
2.1
33
97
0
129
47
20
0
31
1.50
2976689--2976776
29
3.0
30
81
3
106
29
25
20
25
1.99
2978624--2978661
20
1.9
20
84
10
51
44
13
21
21
1.85
2980562--2980928
46
8.0
46
92
0
556
37
14
24
23
1.93
2983465--2983579
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
2983465--2983598
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
2986005--2986055
18
2.8
19
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17
63
39
0
0
60
0.97
2986157--2986200
22
2.1
21
84
16
56
61
0
2
36
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290