Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  74  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22362095--22362235
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3.6
39
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0
201
36
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22362087--22362233
78
1.9
78
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0
222
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25
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14
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33
3
0
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1.10
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20
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100
0
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2.00
22402955--22403139
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2.3
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10
5.0
10
86
13
68
20
8
2
70
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2.5
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20
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2.7
26
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2.0
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125
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13
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27
27
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30
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0
0
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3.2
132
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1.97
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2.4
44
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16
25
27
1.97
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198
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201
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30
1.97
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3.0
28
71
19
79
33
4
0
62
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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1.17
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22
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0
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1.60
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1
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0
21
1.02
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14
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1.31
22568063--22568120
20
2.9
20
84
7
73
53
17
13
15
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22568205--22568243
20
2.0
20
94
0
69
51
20
7
20
1.72
22569113--22569204
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2.0
45
95
0
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36
17
13
32
1.88
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15
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1.70
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0
0
70
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18
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53
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41
1.21
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56
0
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41
1.13
22590891--22590935
10
4.4
10
82
2
54
64
0
4
31
1.13
22592857--22592897
16
2.6
16
96
0
73
39
4
21
34
1.75
22593630--22593737
26
4.2
26
91
0
171
34
7
22
36
1.82
22596852--22596967
7
16.4
7
79
5
117
49
33
0
17
1.47
22601393--22601422
9
3.4
9
95
4
53
53
0
0
46
1.00
22615857--22615896
14
2.9
14
84
0
53
32
7
17
42
1.77
22615865--22615931
35
1.9
35
87
3
100
31
10
13
44
1.77
22615880--22615919
20
2.0
20
85
0
53
27
12
12
47
1.77
22617458--22617483
13
2.0
13
100
0
52
46
15
15
23
1.83
22618814--22618860
24
2.0
24
87
8
69
42
6
8
42
1.60
22620478--22620525
22
2.2
22
85
7
62
58
4
8
29
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22624220--22624290
34
2.1
34
86
0
97
35
28
5
30
1.80
22625541--22625567
13
2.1
13
100
0
54
44
22
0
33
1.53
22625743--22625856
34
3.4
34
85
2
149
33
28
16
21
1.95
22632178--22632221
17
2.5
17
82
10
54
31
15
2
50
1.57
22632426--22632745
46
7.0
46
90
0
388
20
24
15
40
1.91
22632404--22632743
138
2.5
137
84
2
430
20
24
15
40
1.90
22634908--22634944
20
1.9
20
88
5
58
51
8
0
40
1.32
22639907--22640071
82
2.0
82
94
1
287
55
8
11
24
1.63
22649250--22649321
25
3.0
24
81
4
74
43
19
20
16
1.89
22652131--22652174
21
2.1
21
80
15
56
27
4
2
65
1.23
22652132--22652174
20
2.2
20
87
8
61
27
4
2
65
1.25
22652149--22652183
18
1.9
18
88
0
52
28
2
2
65
1.21
22652178--22652271
47
2.0
46
91
4
154
37
10
12
39
1.78
22660440--22660474
19
1.9
18
88
11
54
45
2
0
51
1.16
22663997--22664041
19
2.4
19
88
3
65
33
0
20
46
1.51
22664254--22664511
41
6.3
41
90
0
408
29
20
28
22
1.98
22664254--22664505
82
3.1
82
99
0
495
28
19
28
22
1.98
22671687--22671724
19
2.0
19
89
0
58
36
0
15
47
1.46
22671937--22672194
41
6.3
41
90
0
408
29
20
28
22
1.98
22671937--22672188
82
3.1
82
99
0
495
28
19
28
22
1.98
22673880--22674011
57
2.3
57
93
0
219
39
23
19
17
1.92
22676440--22676482
16
2.7
15
79
10
50
41
23
0
34
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22676675--22676810
41
3.4
41
76
9
138
33
24
16
25
1.95
22706218--22706344
3
42.7
3
78
1
130
29
6
1
62
1.29
22706507--22706553
3
15.3
3
82
12
60
31
2
2
63
1.18
22711436--22711460
8
3.1
8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
22711433--22711501
29
2.3
31
80
9
81
60
4
0
34
1.16
22711714--22711781
30
2.3
30
82
10
77
27
17
7
47
1.74
22712892--22712926
18
1.9
18
100
0
70
54
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11
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9
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0
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29
9
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1.80
22717761--22717794
12
2.8
12
86
0
50
50
17
23
8
1.74
22734390--22734423
17
1.9
18
88
5
52
70
17
0
11
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290