Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  36  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11539829--11539871
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3.8
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3
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2.7
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1
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2.2
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36
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1.82
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3.6
11
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12
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59
4
0
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2.0
40
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3
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3
1
61
1.24
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73
0
0
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3
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1.14
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2.0
22
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0
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0
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78
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5
12
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10
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1.04
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3.0
49
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10
162
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10
2
58
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2.1
99
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238
29
8
3
58
1.47
11605428--11605909
26
19.0
24
71
17
241
28
6
3
61
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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182
28
3
3
64
1.27
11605547--11605911
26
14.2
26
74
10
284
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4
3
62
1.32
11605858--11605923
24
2.8
24
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1
1
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1.10
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2.8
12
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4
52
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2
17
0
0.84
11610527--11610578
8
6.4
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6
61
82
1
13
1
0.84
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2.0
46
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143
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18
26
24
1.98
11612156--11612287
50
2.6
50
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0
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28
17
22
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1.97
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19
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26
1.98
11612259--11612868
89
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8
404
30
18
23
28
1.97
11612260--11612869
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4.5
134
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511
30
18
23
28
1.97
11612693--11612869
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4.0
44
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15
26
31
1.96
11614214--11614366
49
3.1
49
79
6
182
28
9
2
59
1.42
11614301--11614725
103
4.2
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73
16
309
29
5
4
61
1.36
11614374--11614730
26
13.9
25
67
11
98
29
4
3
62
1.34
11614665--11614730
24
2.8
24
84
9
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30
1
1
66
1.10
11622844--11622874
10
3.1
10
90
0
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16
29
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51
1.59
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55
1.9
55
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189
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18
13
33
1.89
11630278--11630311
15
2.3
15
89
0
50
64
0
26
8
1.22
11630970--11631113
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1.8
78
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2
245
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9
22
40
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27
2.0
27
100
0
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11633640--11633682
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2.3
18
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2
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1.9
36
93
0
120
40
20
4
34
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
23
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0
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28
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1.9
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10
0
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2.0
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1
5
33
1.31
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30
92
0
194
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1.65
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0
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0
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1.03
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19
1.14
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0
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1.15
11676968--11677003
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63
47
0
2
50
1.15
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2.0
62
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1
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238
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16
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24
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18
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1.93
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1.22
11712398--11712435
3
13.0
3
94
5
69
34
34
0
31
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11716226--11716251
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2.2
12
100
0
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7
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26
1.83
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1.9
18
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0
52
28
2
0
68
1.04
11727082--11727158
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2.5
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1
1
35
1.12
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2.7
21
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15
19
15
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1.80
11739647--11739699
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1
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2.7
18
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53
51
10
4
34
1.55
11745196--11745257
25
2.5
25
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0
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22
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0
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22
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0
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54
11
40
28
20
1.87
11758678--11758775
33
3.0
33
83
5
119
16
28
7
47
1.72
11763309--11763629
46
7.0
46
90
2
448
38
14
24
21
1.92
11763919--11763952
16
2.1
16
88
5
50
50
0
17
32
1.47
11763917--11763966
25
2.0
25
81
14
59
48
0
18
34
1.48
11768236--11768260
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
11770808--11770839
15
2.1
15
94
0
55
50
6
3
40
1.43
11778320--11778425
53
2.0
53
94
0
185
41
8
22
27
1.83
11778900--11778944
3
15.0
3
100
0
90
33
0
0
66
0.92
11779155--11779180
13
2.0
13
100
0
52
69
0
0
30
0.89
11784783--11784891
46
2.4
46
83
6
132
28
18
31
22
1.97
11787079--11787231
51
3.0
51
84
0
189
40
17
23
18
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11790760--11790880
48
2.5
48
91
0
188
28
31
15
23
1.96
11799999--11800023
10
2.5
10
100
0
50
8
20
8
64
1.46
11801618--11801666
22
2.2
23
88
3
73
20
0
32
46
1.51
11802155--11802537
126
3.0
126
91
0
606
34
18
19
27
1.95
11805253--11805475
41
5.5
41
94
2
344
32
24
24
18
1.97
11806027--11806080
22
2.5
22
82
11
67
27
1
20
50
1.59
11806106--11806170
22
3.0
22
71
10
62
26
1
26
46
1.62
11806463--11806507
6
7.0
6
85
10
54
77
4
0
17
0.92
11806468--11806509
13
3.4
12
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15
50
78
2
0
19
0.86
11806468--11806507
19
2.1
19
95
0
71
80
2
0
17
0.83
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43
4.1
43
85
1
226
26
16
26
29
1.97
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18
2.1
18
95
0
67
44
10
21
23
1.83
11816090--11816224
48
2.8
48
80
4
121
51
7
8
31
1.61
11816357--11816388
11
2.9
11
100
0
64
37
0
18
43
1.51
11819691--11819785
44
2.2
44
88
3
138
28
18
20
32
1.96
11824835--11824883
24
2.1
23
81
11
64
71
16
12
0
1.14
11824837--11824881
22
2.0
24
91
8
76
68
17
13
0
1.20
11830393--11830438
24
1.9
24
81
0
56
15
21
15
47
1.81
11834317--11834419
52
1.9
54
81
11
124
60
3
6
29
1.40
11834533--11834562
11
2.7
11
94
0
51
73
0
13
13
1.10
11838898--11838944
21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
11847944--11848297
177
2.0
177
90
0
555
28
18
16
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11849864--11849906
22
2.0
22
81
9
52
18
46
18
16
1.84
11850545--11850573
14
2.1
14
100
0
58
55
0
0
44
0.99
11850705--11850738
13
2.7
13
90
4
52
79
5
0
14
0.91
11850569--11851886
146
9.2
144
86
7
1668
59
7
5
27
1.48
11851126--11851166
15
2.8
15
82
14
50
65
2
2
29
1.18
11850569--11851888
287
4.6
288
85
6
1702
59
7
5
27
1.48
11858187--11858342
78
2.0
77
98
1
303
50
13
0
35
1.42
11858477--11858534
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27
96
0
107
8
37
31
22
1.84
11859334--11859358
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
11859437--11859504
31
2.2
31
89
2
102
30
4
16
48
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290