Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A07 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  90  of  290  ( 34756 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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(0-2)
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12
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2.00
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1.94
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19
1.9
19
89
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58
52
15
0
31
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27799871--27799939
7
10.0
7
73
3
50
28
1
26
43
1.63
27799875--27799937
28
2.2
28
83
5
74
28
1
26
42
1.65
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2.1
44
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1
1
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1.13
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33
3.1
33
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42
1
3
53
1.23
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2.4
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0
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21
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1.10
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1.48
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21
22
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38
1.73
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23
3.7
23
68
20
66
34
15
25
24
1.95
27832601--27832717
43
2.7
43
93
2
191
30
26
17
24
1.97
27833545--27833577
14
2.4
14
95
5
59
57
0
18
24
1.40
27837939--27837977
21
1.9
20
89
5
60
46
23
2
28
1.65
27843252--27843379
46
2.8
44
79
10
123
28
22
28
21
1.99
27844556--27844596
22
1.9
22
95
5
75
9
43
29
17
1.80
27848220--27848270
21
2.5
21
76
20
54
49
19
1
29
1.60
27850992--27851079
27
3.3
28
85
7
121
18
21
22
37
1.94
27853589--27853644
25
2.2
25
87
0
76
37
19
16
26
1.92
27859699--27859750
26
2.0
26
96
0
95
13
23
34
28
1.92
27866589--27866653
30
2.2
30
83
5
78
36
6
26
30
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27875266--27875372
50
2.1
50
84
3
135
37
25
14
23
1.92
27875632--27875672
20
2.0
20
95
0
73
12
26
39
21
1.89
27880172--27880258
41
2.1
41
97
0
165
25
18
11
44
1.83
27887865--27887983
55
2.2
55
78
3
123
16
28
28
26
1.97
27914084--27914308
49
4.5
49
83
3
263
30
27
16
25
1.97
27914084--27914308
99
2.3
101
84
3
287
30
27
16
25
1.97
27916352--27916415
15
4.2
15
74
4
65
60
15
12
10
1.58
27916351--27916411
30
2.0
31
83
3
79
62
16
11
9
1.54
27919214--27919445
27
8.6
27
85
0
286
40
20
8
30
1.81
27919214--27919446
54
4.3
54
87
2
317
40
20
8
30
1.81
27919214--27919472
54
4.8
54
82
7
258
40
20
8
30
1.81
27919214--27919506
81
3.7
78
83
4
273
40
20
8
31
1.82
27919293--27919500
27
7.7
27
79
8
147
40
20
8
30
1.83
27919538--27919867
27
12.3
27
86
1
439
34
19
20
25
1.96
27920294--27920358
22
3.0
22
75
8
60
21
21
23
33
1.97
27920517--27920618
27
3.8
27
87
5
134
18
23
21
36
1.95
27920766--27920822
25
2.3
25
93
0
96
17
21
15
45
1.85
27922520--27922744
49
4.5
49
86
3
281
29
27
17
25
1.98
27922507--27922744
98
2.4
100
85
3
311
29
26
18
25
1.98
27923890--27923923
13
2.6
13
100
0
68
23
0
5
70
1.09
27925505--27925611
55
1.9
55
90
0
169
13
30
29
26
1.93
27925505--27925629
55
2.3
55
85
2
162
13
32
29
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27931808--27931887
25
3.2
24
74
11
81
37
13
23
25
1.92
27934555--27934609
27
2.0
27
82
6
67
32
21
14
30
1.93
27940676--27940940
103
2.6
104
89
3
410
20
20
29
29
1.98
27948241--27948389
76
1.9
77
94
4
266
23
20
26
28
1.99
27948341--27948390
26
1.9
26
95
0
91
14
24
32
30
1.94
27961053--27961325
48
5.7
47
77
2
213
28
17
28
24
1.98
27961056--27961327
96
2.8
96
79
5
300
28
17
29
25
1.97
27962920--27962967
25
2.0
24
84
12
62
29
0
8
62
1.24
27962920--27962969
26
2.0
24
84
7
64
30
0
8
62
1.24
27965130--27965180
26
2.0
26
84
7
68
47
13
1
37
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290