Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  10  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2956750--2956793
23
1.9
23
95
0
79
52
15
2
29
1.55
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5.6
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0
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25
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2
30
1.69
2958108--2958153
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3.3
14
90
0
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1.83
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2.0
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3
0
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306
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18
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3
70
38
2
0
59
1.10
2985727--2985896
84
2.0
84
87
0
241
44
17
16
21
1.87
2986240--2986276
17
2.2
17
100
0
74
21
18
21
37
1.94
2990852--2990904
27
2.0
25
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7
61
11
15
7
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1.44
2991461--2991485
11
2.3
11
100
0
50
28
0
0
72
0.86
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22
2.0
22
84
8
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34
4
4
57
1.38
2995210--2995261
7
7.6
7
76
4
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7
7
1
0.91
2995210--2995261
21
2.5
20
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9
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82
7
7
1
0.91
2996869--2996997
64
2.0
65
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1
188
29
17
15
37
1.90
2997236--2997985
133
5.6
133
86
4
969
29
21
22
27
1.99
2997236--2998006
268
2.9
268
90
3
1139
28
21
22
27
1.99
2997904--2998224
133
2.4
133
92
0
527
30
18
21
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2999181--2999233
27
2.0
25
82
7
61
11
15
7
66
1.44
3000068--3000122
22
2.4
22
84
9
65
34
5
5
54
1.46
3004821--3004877
27
2.1
27
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0
105
42
8
28
21
1.82
3014467--3014523
22
2.6
21
75
8
60
29
22
17
29
1.97
3015919--3015952
17
2.0
17
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0
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0
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1.34
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2.0
101
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0
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14
17
22
1.85
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22
2.6
21
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8
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29
22
17
29
1.97
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11
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0
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2.0
231
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0
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15
18
27
1.91
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1.9
22
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4
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1.66
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2.1
16
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6
6
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9
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0
14
20
1.26
3036342--3036376
17
2.0
18
88
5
54
65
0
14
20
1.26
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22
2.6
22
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2
91
16
18
25
38
1.92
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2
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19
19
20
40
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10.7
18
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15
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1.84
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36
7.6
36
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13
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36
11
14
37
1.83
3037669--3037951
54
5.4
53
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16
169
36
11
14
37
1.83
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18
3.4
18
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0
86
37
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14
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2
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0
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0
0
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1.00
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5
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0
15
17
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3042285--3042327
13
3.3
13
87
9
61
69
0
11
18
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3042293--3042327
17
2.0
18
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5
63
68
0
11
20
1.20
3042293--3042327
9
4.0
9
92
7
63
68
0
11
20
1.20
3042753--3042801
5
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5
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0
80
40
0
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1.55
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5.3
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0
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17
18
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10.6
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12
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12
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7.6
36
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14
182
36
12
15
36
1.85
3043618--3043820
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2.8
71
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232
35
11
15
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18
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0
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2.6
12
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0
53
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0
25
0
0.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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