Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  200  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66900662--66900886
47
4.8
48
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7
205
23
32
17
26
1.97
66900662--66900927
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26
1.97
66916972--66917044
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64
0
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30
1.16
66917078--66917150
28
2.7
26
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1
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2.0
40
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9
2
38
1.49
66927694--66927888
49
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49
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2
264
29
18
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28
1.98
66927696--66927894
100
2.0
100
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2
328
28
19
23
28
1.98
66936217--66936386
40
4.3
40
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229
28
28
19
23
1.98
66936208--66936386
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229
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19
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1.98
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4.2
10
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39
2
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2.1
227
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7
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1.61
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192
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0
0
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0
0
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27
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24
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1.90
66943376--66943579
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263
24
14
21
40
1.90
66943376--66943584
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2.6
80
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280
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0
80
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20
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1.88
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2.7
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13
148
22
21
28
28
1.99
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35
23
21
19
1.96
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25
2.8
25
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4
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33
23
19
22
1.97
66949978--66950058
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3.0
27
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110
23
22
19
34
1.96
66954300--66954476
40
4.4
40
82
4
216
25
26
22
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66957843--66958048
45
4.6
45
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3
285
23
22
28
26
1.99
66962349--66962384
16
2.2
16
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0
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13
25
13
1.80
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29
3.0
28
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122
27
13
28
29
1.94
66964176--66964261
45
1.9
45
88
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129
25
25
19
29
1.99
66985120--66985323
44
4.6
45
85
8
260
23
22
27
25
1.99
66985120--66985323
87
2.3
88
85
8
265
23
22
27
25
1.99
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0
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0
0
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1.61
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28
3.1
28
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28
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28
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1.94
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3.0
11
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50
50
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19
1.65
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30
25
25
18
1.98
67018495--67018571
36
2.1
36
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4
93
33
28
22
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1.94
67019724--67019820
28
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27
73
20
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6
35
1
57
1.30
67021529--67021575
17
2.8
17
83
0
58
8
8
4
78
1.07
67021518--67021581
11
5.6
11
75
15
51
10
9
3
76
1.12
67021529--67021581
23
2.3
23
83
0
61
9
9
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77
1.11
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21
2.0
20
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62
12
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22
1.89
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23
2.0
23
100
0
94
38
29
12
19
1.89
67041212--67041276
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2.1
31
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103
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13
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2.6
16
84
15
57
0
10
2
87
0.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67042565--67042605
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2
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2.0
20
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0
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0
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1.23
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9
4.1
9
85
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48
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1.71
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2.0
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20
40
0
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51
2
5
40
1.39
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0
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0
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0
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0
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21
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1.87
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2
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31
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29
1.87
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143
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30
29
1.87
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37
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1.97
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0
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266
29
28
23
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67122153--67122217
6
10.7
6
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105
16
1
0
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2.5
11
100
0
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14
0
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2.6
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59
30
0
15
54
1.41
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371
26
26
22
23
2.00
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40
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1
268
26
28
22
22
1.99
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2.0
30
83
0
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31
22
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1.84
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179
25
21
25
27
1.99
67140501--67140621
51
2.4
50
88
2
179
25
21
25
27
1.99
67140664--67140701
20
2.0
19
85
10
51
34
21
13
31
1.91
67140752--67140799
25
2.0
24
83
4
60
31
16
22
29
1.96
67145000--67145085
31
2.8
31
92
1
147
24
25
17
32
1.97
67145303--67145394
25
3.6
25
88
2
112
29
21
23
25
1.99
67154266--67154320
20
2.8
20
85
0
83
40
23
23
12
1.89
67154266--67154423
40
4.0
40
84
1
138
34
18
29
17
1.94
67154315--67154418
20
5.2
20
68
9
68
31
15
32
20
1.93
67154321--67154474
40
3.8
40
85
0
209
33
15
31
19
1.93
67155106--67155161
28
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7
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50
23
0
26
1.50
67156827--67156869
21
2.0
21
100
0
86
23
18
18
39
1.92
67166144--67166263
42
2.8
43
88
1
136
28
23
16
31
1.96
67166183--67166263
42
1.9
42
100
0
162
28
24
17
29
1.97
67168154--67168229
40
1.9
40
86
5
109
21
18
31
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67168238--67168314
28
2.8
28
87
0
109
31
11
27
29
1.92
67170944--67171129
41
4.6
41
87
3
243
24
26
23
24
2.00
67178722--67178773
9
6.0
8
77
22
52
80
1
3
13
0.93
67178741--67178767
14
1.9
14
100
0
54
81
0
0
18
0.69
67182938--67182990
26
2.0
26
92
0
88
16
16
16
49
1.81
67184102--67184134
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
67188702--67188865
42
3.9
43
77
9
158
29
23
14
31
1.94
67189699--67189727
12
2.3
13
94
5
51
20
6
13
58
1.58
67192819--67192892
37
2.0
37
97
0
139
21
25
16
36
1.94
67195420--67195478
23
2.5
24
88
2
84
37
16
20
25
1.93
67200200--67200241
20
2.1
20
90
0
66
35
7
11
45
1.69
67201880--67202052
46
3.8
46
95
0
292
23
32
9
34
1.87
67202079--67202153
22
3.3
22
68
17
62
26
28
10
34
1.90
67202056--67202269
47
4.6
47
89
1
286
26
27
11
34
1.91
67202076--67202269
94
2.1
94
92
0
316
25
26
12
35
1.92
67207880--67208051
93
1.8
93
92
0
290
26
30
22
20
1.98
67207872--67208047
46
3.8
46
81
4
210
27
30
21
20
1.98
67210441--67210520
30
2.6
31
81
11
94
55
15
18
11
1.69
67210443--67210520
15
5.2
15
75
9
70
55
15
17
11
1.69
67212437--67212614
27
6.6
27
81
3
169
29
28
15
26
1.96
67216761--67216935
46
3.8
46
77
7
201
27
28
21
22
1.99
67216769--67216940
93
1.8
93
91
0
281
26
29
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67216812--67216955
46
3.1
45
69
15
114
27
29
21
21
1.99
67226481--67226613
39
3.4
39
82
3
124
33
27
19
18
1.96
67226541--67226835
40
7.4
40
83
1
360
28
27
21
23
1.99
67242070--67242292
40
5.6
40
86
3
236
24
20
28
26
1.99
67242145--67242327
79
2.3
80
81
1
217
25
20
28
25
1.99
67249967--67250188
40
5.6
40
85
5
229
23
21
28
26
1.99
67252352--67252430
23
3.4
23
89
1
113
30
17
26
25
1.97
67252595--67252662
27
2.6
27
81
4
68
35
17
27
19
1.94
67255491--67255826
48
7.0
49
84
4
339
26
16
27
29
1.97
67255493--67255826
144
2.3
142
82
5
413
26
16
27
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320