Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  26  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7300887--7301072
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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37
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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28
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118
25
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100
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27
44
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
65
29
18
18
32
1.96
7485481--7485527
21
2.2
22
92
3
78
21
38
19
21
1.94
7509135--7509281
71
2.1
71
92
2
242
15
13
27
43
1.84
7516934--7516989
23
2.6
22
72
13
55
42
25
7
25
1.80
7520119--7520160
13
3.2
13
77
12
50
30
23
19
26
1.98
7520320--7520434
45
2.6
45
81
4
133
39
21
18
20
1.93
7520362--7520450
45
2.0
45
81
0
106
40
19
15
24
1.90
7521057--7521519
28
16.5
28
77
10
238
55
6
15
22
1.63
7523339--7523376
16
2.4
17
82
8
53
60
0
0
39
0.97
7526293--7526345
18
2.8
20
88
5
74
33
0
28
37
1.58
7526297--7526345
20
2.6
19
87
6
64
32
0
28
38
1.57
7535091--7535768
176
3.8
176
86
1
896
29
16
24
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7535988--7536036
22
2.2
24
79
17
61
77
12
0
10
0.99
7537441--7537490
18
2.8
18
76
11
57
30
4
8
58
1.45
7541215--7541246
12
2.7
12
100
0
64
6
40
25
28
1.79
7541272--7541305
13
2.6
13
100
0
68
17
38
29
14
1.90
7542161--7542530
130
2.8
132
77
5
374
34
17
17
30
1.93
7543718--7543749
5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
7543719--7543749
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
7548582--7548865
148
1.9
149
81
5
342
52
3
10
34
1.53
7552637--7552676
20
2.0
20
100
0
80
25
30
20
25
1.99
7553521--7553560
19
2.2
18
90
4
62
57
5
0
37
1.21
7557020--7557166
75
2.0
76
94
2
262
59
6
3
31
1.38
7571295--7571356
17
3.5
17
69
26
56
46
16
8
29
1.75
7571281--7571355
37
2.0
37
100
0
150
46
13
8
32
1.72
7571452--7571507
18
3.2
18
76
2
60
37
14
10
37
1.81
7571545--7571729
18
10.3
18
73
11
128
39
14
10
36
1.80
7571563--7571609
19
2.6
18
83
6
60
44
8
10
36
1.70
7571545--7571729
54
3.4
52
75
8
156
39
14
10
36
1.80
7571546--7571729
72
2.6
72
79
6
221
39
14
10
35
1.80
7571887--7571985
45
2.2
45
90
0
153
41
21
19
18
1.91
7572341--7572365
9
2.8
9
100
0
50
52
12
0
36
1.39
7572317--7572363
22
2.1
22
84
11
60
48
14
0
36
1.44
7577355--7577418
34
1.9
33
84
15
87
57
1
3
37
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7577735--7577785
20
2.5
20
81
9
59
39
5
1
52
1.37
7577788--7577900
19
6.2
18
71
18
74
34
6
1
57
1.34
7587441--7587502
25
2.6
24
82
5
72
51
0
4
43
1.23
7592481--7592512
3
10.7
3
93
0
55
65
0
3
31
1.08
7594024--7594678
132
5.0
132
91
1
823
29
26
16
27
1.97
7594180--7594694
220
2.3
220
93
1
881
29
26
16
27
1.97
7606888--7606922
15
2.5
14
86
13
54
54
2
0
42
1.15
7606895--7606923
15
1.9
15
100
0
58
55
3
0
41
1.17
7606896--7606929
15
2.3
15
89
0
50
58
2
0
38
1.13
7607029--7607086
3
20.3
3
79
13
61
65
1
1
31
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320