Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  233  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
77127292--77128204
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29
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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26
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61
2.9
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288
26
26
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26
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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17
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1.96
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26
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1.99
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20
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77284499--77284523
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6
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0
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0
16
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1.95
77312773--77312820
17
2.8
17
69
12
53
25
0
6
68
1.12
77313805--77313839
18
2.1
16
89
10
52
37
0
0
62
0.95
77315827--77315860
17
2.0
17
100
0
68
35
23
5
35
1.79
77317835--77318349
258
2.0
256
82
3
631
27
15
15
41
1.87
77318613--77318694
43
1.9
43
84
0
110
26
9
10
52
1.68
77326699--77326752
9
5.7
9
82
10
63
35
1
0
62
1.06
77326701--77326752
20
2.7
20
87
3
79
34
1
0
63
1.06
77326699--77326797
11
8.7
12
73
19
79
34
3
1
61
1.18
77326726--77326797
14
5.4
14
71
18
55
33
2
1
62
1.18
77326752--77326837
25
3.6
25
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23
78
33
5
3
56
1.40
77327295--77327335
15
2.6
16
84
3
57
31
7
0
60
1.24
77339199--77339700
204
2.5
205
88
1
713
31
18
20
29
1.96
77339794--77339879
45
1.9
45
95
0
154
29
13
30
26
1.95
77341612--77341664
9
5.7
9
82
6
61
33
1
0
64
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77341608--77341708
29
3.7
27
75
15
77
33
2
1
61
1.22
77341635--77341749
25
4.9
24
73
18
100
33
4
2
59
1.31
77341614--77341709
11
8.5
11
72
15
56
33
3
1
62
1.18
77341664--77341749
45
1.9
45
83
9
113
33
5
3
56
1.40
77341995--77342046
26
2.0
26
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0
68
28
9
3
57
1.48
77343002--77343026
8
3.1
8
100
0
50
52
24
12
12
1.72
77343663--77343722
29
2.0
30
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3
77
41
3
8
46
1.50
77350882--77350920
20
1.9
21
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28
7
2
61
1.37
77351056--77351139
18
4.6
18
69
7
53
55
0
1
42
1.07
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2.0
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1
300
42
9
9
38
1.68
77354380--77354560
88
2.1
88
85
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242
44
9
9
36
1.69
77359619--77359648
11
2.7
11
100
0
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10
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30
2.0
30
93
0
102
25
1
15
58
1.46
77367848--77368004
62
2.6
57
79
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163
43
3
15
38
1.63
77367902--77368005
28
3.5
29
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13
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44
1
13
40
1.55
77373911--77373991
42
1.9
42
87
0
117
45
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13
1.84
77375911--77375951
20
2.0
20
85
0
55
36
4
0
58
1.20
77381019--77381102
39
2.0
40
84
8
107
35
22
2
39
1.67
77381441--77381475
17
2.1
17
89
10
54
5
0
11
82
0.82
77382051--77382243
44
4.4
44
84
2
235
31
21
15
32
1.94
77382163--77382282
39
2.9
39
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143
34
15
15
34
1.90
77382502--77382641
45
3.1
44
79
5
147
31
17
14
37
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77382630--77382655
12
2.2
12
100
0
52
34
0
26
38
1.57
77403768--77403812
18
2.5
18
81
0
54
37
15
11
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1.83
77403922--77403976
6
9.2
6
95
0
92
45
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18
18
1.86
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12
2.2
12
100
0
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7
0
15
0.99
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2.1
14
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0
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20
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0
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1.35
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28
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74
21
9
10
58
1.60
77424060--77424114
22
2.5
20
81
16
65
29
0
3
67
1.08

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320