Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  256  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83486848--83486899
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0
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0
0
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3.6
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2.1
13
100
0
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0
14
0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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1.97
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2.5
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3
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1
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1.62
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0
0
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29
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63
1.34
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24
2.3
24
82
5
71
32
6
3
56
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83658096--83658152
10
5.5
10
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15
53
33
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1
38
1.67
83658097--83658152
22
2.7
20
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15
60
33
26
1
37
1.67
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27
3.3
26
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29
5
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1.31
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49
2.0
49
90
0
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6
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1.37
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0
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2.2
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28
35
19
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1.93
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2.3
55
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12
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6
59
42
0
0
57
0.99
83664231--83664276
16
2.6
17
86
10
58
52
32
0
15
1.43
83669487--83669514
13
2.2
13
100
0
56
64
0
14
21
1.29
83670380--83670444
25
2.6
25
82
2
87
21
26
16
35
1.95
83671231--83671331
50
2.0
50
90
3
159
19
13
14
51
1.76
83679912--83680004
18
5.2
18
85
0
132
33
16
22
27
1.95
83679912--83680004
36
2.6
36
89
0
150
33
16
22
27
1.95
83686765--83686825
27
2.3
27
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5
70
62
0
3
34
1.12
83690221--83690254
16
2.1
16
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50
41
2
20
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1.68
83694074--83694402
164
2.0
163
92
0
550
34
18
16
29
1.93
83700060--83700099
18
2.2
18
86
8
55
67
12
0
20
1.22
83700183--83700245
30
2.1
29
94
2
108
58
9
3
28
1.45
83701261--83701307
22
2.1
22
96
0
85
31
4
40
23
1.74
83705578--83705622
19
2.4
19
92
0
72
6
13
2
77
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83707814--83707838
13
1.9
13
100
0
50
16
8
0
76
1.02
83708153--83708199
22
2.1
22
96
0
85
31
4
40
23
1.74
83712368--83712423
2
28.0
2
96
0
103
50
1
48
0
1.11
83714736--83714761
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
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75
2.0
77
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3
260
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14
12
27
1.80
83736458--83736485
3
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3
100
0
56
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0
0
67
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83736816--83736846
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2.1
15
100
0
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45
0
6
48
1.28
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40
5.6
40
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1
246
23
20
27
28
1.99
83744255--83744470
79
2.7
80
82
3
231
23
20
28
27
1.99
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5.3
40
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4
212
23
19
27
29
1.99
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28
2.1
28
100
0
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3
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1.61
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28
2.6
27
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10
103
34
13
2
48
1.57
83767614--83767644
4
8.0
4
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7
55
51
0
0
48
1.00
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2.1
15
100
0
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15
100
0
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1.72
83779611--83779701
44
2.1
44
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0
164
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7
12
43
1.71
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20
2.0
20
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0
53
37
15
12
35
1.85
83787190--83787250
24
2.5
24
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5
79
19
16
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34
1.94
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17
2.0
17
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50
63
0
0
36
0.95
83793691--83793741
25
2.0
25
88
0
75
39
7
17
35
1.79
83798364--83798411
25
1.9
25
86
0
69
41
4
14
39
1.65
83800970--83801028
7
8.4
7
73
19
52
49
15
13
22
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83800977--83801028
21
2.5
21
100
0
104
50
15
15
19
1.79
83800977--83801028
6
7.7
6
76
23
50
50
15
15
19
1.79
83803601--83803957
178
2.0
178
96
0
660
38
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15
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1.92
83806722--83806767
17
2.7
18
80
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53
67
0
6
26
1.15
83806744--83806820
22
3.5
22
79
8
79
66
5
6
22
1.35
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3
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3
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11
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2
7
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2.4
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83807130--83807172
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0
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3
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0
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0
0
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0.92
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3
9.7
3
92
7
51
63
0
0
36
0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320