Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  27  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7610711--7610765
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7624114--7624170
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2.1
27
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243
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104
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6
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1.34
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19
6.4
18
69
22
65
41
2
1
54
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
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2
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39
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7663144--7663292
69
2.2
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70
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40
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111
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25
1.97
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3.8
34
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15
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42
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33
85
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24
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22
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10
0
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0.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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230
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18
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0
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52
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9
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75
1.18
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1.9
125
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3
301
29
17
16
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7781514--7781980
233
2.0
231
97
0
889
34
16
16
33
1.91
7781909--7782032
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1.9
64
93
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16
16
37
1.90
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2.1
45
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19
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26
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2.0
133
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19
21
28
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175
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1117
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19
22
27
1.98
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45
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33
19
21
27
1.97
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354
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4
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31
19
22
27
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21
23
19
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21
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24
19
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44
3.3
43
70
14
134
34
22
22
20
1.97
7783495--7783627
44
3.0
45
68
11
121
34
21
21
22
1.97
7784349--7784381
14
2.4
14
90
10
50
9
9
9
72
1.28
7784500--7784542
21
2.1
21
91
4
70
30
2
9
58
1.42
7785199--7785432
125
1.9
125
83
1
308
30
16
17
35
1.92
7788345--7788382
19
2.0
19
94
0
67
34
10
23
31
1.89
7789265--7789303
19
2.1
19
90
9
62
74
2
7
15
1.15
7795463--7795561
52
2.0
52
80
11
118
45
6
2
46
1.39
7795518--7795551
17
2.0
17
94
0
59
44
5
0
50
1.26
7795523--7795570
17
3.0
16
79
17
55
45
6
2
45
1.40
7795567--7795745
54
3.1
54
65
22
137
41
2
7
49
1.43
7795563--7795750
61
3.1
61
68
14
190
41
2
6
49
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7795611--7795645
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2.0
17
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5
52
40
0
0
60
0.97
7795560--7795782
120
1.9
120
97
0
419
42
2
6
49
1.40
7795731--7795765
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
7795594--7795779
54
3.2
54
66
21
142
43
1
4
50
1.33
7795719--7795989
143
1.9
147
93
4
478
46
2
3
46
1.34
7795874--7795908
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
7796070--7796164
45
2.1
45
88
1
138
32
27
5
34
1.79
7796143--7796175
16
2.1
16
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0
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30
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0
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1.58
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21
2.0
21
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0
77
34
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0
27
1.57
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19
2.0
20
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33
2
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51
1.54
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2.1
23
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3
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50
10
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1.76
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2.3
11
100
0
50
40
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24
0
1.55
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3.4
93
80
10
323
20
19
30
29
1.97
7812560--7812875
140
2.3
140
100
0
632
20
19
30
29
1.97
7812560--7812876
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47
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14
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20
19
30
29
1.97
7818878--7819053
46
3.8
45
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12
214
19
19
30
30
1.97
7818874--7819045
93
1.8
93
94
0
308
19
20
31
29
1.97
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2.2
26
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9
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45
5
5
43
1.50
7832340--7832374
15
2.3
15
100
0
70
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22
0
8
1.16
7835133--7835170
20
2.0
20
89
5
60
65
2
0
31
1.06
7836541--7836588
22
2.2
22
85
3
62
27
2
2
68
1.11
7836613--7836653
19
2.2
19
91
4
66
36
2
4
56
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7837040--7837084
18
2.4
19
92
7
83
55
0
4
40
1.20
7837044--7837068
13
1.9
13
100
0
50
48
0
4
48
1.20
7842924--7843153
117
2.0
117
93
0
397
30
13
8
48
1.71
7855833--7855914
43
1.9
43
94
0
146
31
7
18
42
1.77
7857686--7857752
25
2.7
26
81
11
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14
25
20
38
1.91
7866241--7866374
35
3.8
35
84
0
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19
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1.93
7866233--7866374
70
2.0
70
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0
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16
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22
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4
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7871576--7871602
12
2.2
12
100
0
54
33
7
18
40
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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