Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  224  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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0
49
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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115
16
14
37
32
1.89
74725278--74725305
2
14.0
2
100
0
56
0
50
0
50
1.00
74725935--74726320
193
2.0
193
99
0
763
28
23
13
34
1.93
74741926--74741994
29
2.4
30
82
7
97
18
10
24
46
1.80
74744497--74744552
29
1.9
29
82
7
69
37
17
10
33
1.85
74746360--74746487
63
2.0
63
100
0
256
32
4
22
40
1.75
74756308--74756356
20
2.5
20
83
12
57
69
2
0
28
1.00
74756299--74756356
29
2.0
28
83
9
73
70
1
0
27
0.97
74765639--74765676
10
3.8
10
96
0
67
65
0
10
23
1.23
74765636--74765684
20
2.7
17
77
17
53
65
2
10
22
1.34
74765992--74766029
20
2.0
20
84
5
51
31
10
0
57
1.32
74768195--74768279
40
2.1
40
86
4
118
51
12
5
29
1.63
74775366--74775410
20
2.2
20
96
0
81
28
4
6
60
1.42
74778259--74778363
21
5.0
21
70
3
70
21
23
13
40
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74778271--74778386
42
2.8
42
81
5
144
20
25
12
41
1.88
74778929--74779052
30
4.1
30
93
1
203
25
24
6
43
1.78
74778939--74779046
15
7.2
15
67
12
78
25
22
7
44
1.79
74783623--74783716
30
3.1
30
90
1
143
25
24
6
43
1.78
74783633--74783710
15
5.2
15
67
11
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25
21
7
44
1.79
74790872--74790905
15
2.3
15
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0
50
61
0
2
35
1.11
74794227--74794262
16
2.2
16
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0
54
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0
2
50
1.15
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7
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7
100
0
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0
0
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0.89
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2.1
17
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11
20
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1.70
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2.0
75
100
0
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12
20
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1.90
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2.4
14
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0
57
36
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15
33
1.88
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2.0
17
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75
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0
6
1.00
74816631--74816766
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2.2
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7
195
34
18
11
36
1.86
74816930--74817045
60
1.9
59
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6
144
40
11
13
34
1.81
74816959--74817075
60
2.0
60
88
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175
38
11
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37
1.79
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21
1.9
21
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62
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2
0
45
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12
2.8
12
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4
50
63
9
15
12
1.51
74825553--74825745
28
7.3
27
82
11
224
37
15
23
22
1.93
74825554--74825745
52
3.7
52
86
6
241
38
15
23
22
1.93
74825546--74825733
80
2.4
80
90
3
285
38
15
23
22
1.93
74825769--74825915
50
2.9
51
88
6
219
31
14
24
29
1.94
74833660--74833778
51
2.3
53
89
4
179
40
21
21
17
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74833901--74833940
20
2.0
20
85
9
55
35
12
5
47
1.63
74835196--74835240
16
2.9
16
83
3
56
57
0
0
42
0.98
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22
3.3
21
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23
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29
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44
1.67
74839823--74839906
38
2.2
38
95
0
150
29
21
2
46
1.64
74841245--74841281
2
18.5
2
94
0
65
0
2
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1.15
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0
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0
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0
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0.90
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10
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0
0
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0
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0
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1.00
74851539--74851576
12
3.2
12
81
7
51
28
0
0
71
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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