Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  315  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100913854--100913912
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230
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14
32
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
385
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0
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0
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32
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0
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2.0
104
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2
326
36
18
15
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2.0
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2.0
22
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0
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21
1.29
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2.1
21
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66
0
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38
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10
18
44
1.82
101141000--101141067
32
2.2
32
97
2
129
42
17
5
33
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101155442--101155466
9
2.8
9
100
0
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0
0
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0.99
101167784--101167912
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199
35
16
22
25
1.94
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1.99
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29
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14
26
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2.5
23
86
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73
14
7
40
38
1.73
101173505--101174118
128
4.8
129
96
1
1079
29
26
16
27
1.97
101173505--101174118
257
2.4
257
94
1
1077
29
26
16
27
1.97
101185959--101186049
37
2.5
35
75
10
92
48
1
13
37
1.49
101198229--101198268
3
13.0
3
94
5
71
65
0
0
35
0.93
101199546--101199580
16
2.2
16
89
0
52
2
14
8
74
1.17
101199583--101199642
13
4.6
13
78
15
54
50
1
0
48
1.11
101199584--101199665
16
5.3
16
66
27
52
51
1
0
47
1.08
101199613--101199664
20
2.6
20
79
8
61
50
1
0
48
1.12
101199620--101199658
21
1.9
20
84
5
51
46
2
0
51
1.14
101206220--101206266
23
2.0
24
83
4
60
61
6
4
27
1.39
101212474--101212500
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
101212625--101212675
3
17.3
3
75
4
50
58
3
1
35
1.28
101214141--101214423
95
3.0
95
94
2
487
28
22
20
28
1.99
101214406--101215179
44
17.9
44
75
12
617
29
26
16
27
1.97
101214527--101215185
132
5.2
131
92
5
1088
30
26
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101214551--101215185
256
2.5
262
93
5
1120
30
26
16
26
1.97
101219767--101219949
61
3.0
62
92
1
305
33
4
20
40
1.74
101223424--101223480
23
2.5
23
86
8
73
14
7
40
38
1.73
101225774--101225843
33
2.2
31
85
7
88
45
10
10
34
1.71
101230142--101230176
16
2.2
16
94
0
61
31
25
31
11
1.91
101247780--101247858
28
2.8
29
75
11
83
60
7
3
27
1.41
101250378--101250432
15
3.7
15
75
2
58
52
3
7
36
1.47
101255204--101255249
9
4.7
10
79
12
51
52
0
0
47
1.00
101255655--101255714
31
1.9
31
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0
93
25
11
8
55
1.63
101256056--101256136
31
2.7
30
81
9
85
32
8
12
46
1.72
101256082--101256145
29
2.2
28
75
8
65
28
9
12
50
1.71
101281910--101281954
23
2.0
23
90
0
72
82
0
8
8
0.85
101281924--101281953
15
2.1
15
93
6
53
86
0
6
6
0.70
101281957--101282000
21
2.1
21
100
0
88
36
0
22
40
1.54
101282503--101282585
40
2.0
41
88
6
125
53
7
1
38
1.37
101285030--101285118
45
2.0
45
97
0
169
33
22
21
22
1.97
101289453--101289486
16
2.1
16
94
0
59
70
0
0
29
0.87
101291914--101291944
16
1.9
16
93
0
53
25
16
19
38
1.92
101295554--101295623
29
2.4
30
80
2
79
51
1
4
42
1.30
101302486--101302524
13
3.0
13
84
0
51
23
0
17
58
1.38
101307555--101307581
11
2.5
11
100
0
54
48
22
0
29
1.51
101308375--101308405
3
10.3
3
92
0
53
0
29
35
35
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101317075--101317112
14
2.8
14
80
4
51
10
13
0
76
1.02
101320876--101320916
16
2.3
18
80
16
50
58
0
4
36
1.20
101321563--101321931
183
2.0
182
98
0
711
28
18
11
40
1.86
101325188--101325225
16
2.5
15
91
8
67
36
0
0
63
0.95
101328509--101328533
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
101328914--101328943
12
2.5
12
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0
51
70
13
0
16
1.18
101329755--101329855
50
2.0
50
100
0
202
40
15
5
37
1.72
101330064--101330112
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1.9
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46
2
4
46
1.33
101332168--101332233
32
2.1
32
100
0
132
59
9
6
25
1.51
101344532--101344561
3
10.0
3
92
0
51
33
33
3
30
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320