Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  278  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
A
C
G
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(0-2)
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0
0.58
89864500--89864542
13
3.1
13
83
12
50
60
2
0
37
1.10
89864502--89864536
8
4.4
8
88
0
52
60
2
0
37
1.12
89864617--89864645
9
3.3
9
95
4
51
82
0
17
0
0.66
89865315--89865359
5
8.6
5
85
5
54
35
0
22
42
1.54
89865313--89865359
15
3.0
15
82
17
60
34
0
23
42
1.54
89867156--89867189
15
2.3
15
100
0
68
47
11
0
41
1.40
89871165--89871193
14
2.1
14
93
6
51
65
0
0
34
0.93
89875651--89875696
21
2.2
21
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65
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21
4
1.58
89878509--89878541
6
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0
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0
0
18
0.68
89878465--89878521
27
2.1
28
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3
71
52
3
1
42
1.28
89883450--89883479
8
3.8
8
100
0
60
10
0
10
80
0.92
89883442--89883479
16
2.4
16
90
0
58
7
5
7
78
1.07
89883606--89883836
118
2.0
118
92
0
381
28
30
17
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89884624--89884722
42
2.4
42
91
0
153
25
13
32
29
1.93
89884828--89884900
37
2.0
36
86
2
101
73
1
4
20
1.06
89884840--89884907
13
5.5
13
72
16
56
75
1
4
19
1.06
89912442--89912475
6
5.8
6
93
6
61
29
0
0
70
0.87
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17
2.6
16
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10
61
54
9
2
34
1.44
89917451--89917497
23
1.9
24
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12
60
51
4
8
36
1.52
89918625--89918680
3
18.7
3
100
0
112
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0
0
33
0.92
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6.3
6
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16
0
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0
0.64
89919310--89919347
11
3.4
11
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7
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18
0
81
0
0.69
89919310--89919346
17
2.1
18
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5
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16
0
83
0
0.64
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22
2.3
22
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0
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18
0
32
50
1.47
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3.8
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79
6
331
35
19
17
27
1.95
89920514--89920920
181
2.3
180
81
5
488
36
19
16
27
1.93
89920822--89921137
73
4.2
75
84
3
377
31
22
18
28
1.97
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30
3.2
30
90
0
145
25
48
5
21
1.70
89922019--89922153
25
5.6
25
69
17
81
35
5
2
55
1.39
89922019--89922071
24
2.3
23
83
9
63
37
3
0
58
1.16
89922087--89922158
25
2.8
26
81
6
94
36
6
2
54
1.42
89922116--89922199
28
3.0
28
76
10
93
32
5
3
58
1.39
89922297--89922352
25
2.3
24
79
14
62
37
16
3
42
1.65
89950712--89950806
42
2.3
42
90
0
154
34
17
18
28
1.94
89954823--89955047
49
4.5
49
80
4
245
29
26
16
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89959227--89959296
24
2.8
25
89
4
97
25
24
24
25
2.00
89959516--89959599
31
2.7
31
92
1
134
32
15
26
26
1.96
89963161--89963316
42
3.7
42
83
3
188
29
17
24
28
1.97
89963162--89963316
85
1.8
84
83
4
204
29
16
24
29
1.97
89966184--89966368
40
4.7
40
78
7
182
24
22
27
25
2.00
89966237--89966391
79
2.0
79
81
7
181
26
20
27
26
1.99
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10
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10
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25
40
0
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29
17
25
1.97
89971601--89971778
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55
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3
164
27
29
17
25
1.97
89979588--89979765
27
6.6
27
78
6
144
27
29
17
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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