Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  310  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98857567--98857610
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0
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1.22
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2.2
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48
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2
46
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98915254--98915327
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1.61
98922246--98922281
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2.8
14
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25
0
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1.52
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2.2
19
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0
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1.53
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28
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5
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0
0
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0
0
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13
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19
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3.2
18
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23
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22
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2
1
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2.4
24
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26
1.42
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2.9
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0
11
0
0.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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34
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69
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1.12
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1.96
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3.6
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100
0
50
0
12
0
88
0.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99020995--99022039
44
23.8
44
69
15
324
27
23
18
30
1.98
99021176--99022125
207
4.4
219
94
5
1518
27
23
18
30
1.98
99021272--99021552
144
2.0
141
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334
27
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18
30
1.97
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131
2.0
131
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356
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23
20
29
1.98
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1
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1.36
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74
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1
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1.27
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20
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0
64
1.15
99051365--99051395
6
5.2
6
96
0
53
12
64
0
22
1.27
99054004--99054031
14
2.0
14
100
0
56
42
14
7
35
1.73
99056880--99056990
47
2.4
47
83
6
145
36
23
15
25
1.94
99057751--99057827
4
18.8
4
76
5
64
5
25
3
64
1.31
99062825--99062911
18
4.8
18
88
0
129
27
22
16
33
1.95
99062819--99062911
36
2.6
36
91
0
150
27
22
16
33
1.95
99067070--99067153
42
2.0
42
100
0
168
23
14
23
38
1.92
99080322--99080364
20
2.2
20
87
8
61
46
0
2
51
1.13
99083278--99083315
18
2.2
18
85
4
51
7
10
5
76
1.15
99084233--99084677
114
3.9
113
89
5
655
31
1
15
51
1.51
99084471--99084722
111
2.3
106
80
14
296
30
0
16
52
1.49
99084735--99084766
15
2.1
16
94
5
57
37
0
6
56
1.25
99086827--99086904
33
2.4
32
76
18
79
15
47
14
23
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99088820--99088854
11
3.2
11
88
11
54
0
54
0
45
0.99
99089335--99089359
3
8.3
3
100
0
50
32
0
0
68
0.90
99089322--99089569
124
2.0
127
84
8
328
31
6
6
56
1.48
99102971--99103297
43
7.4
43
63
13
146
29
21
23
25
1.99
99102933--99103544
88
7.0
88
88
3
842
28
21
24
25
1.99
99105305--99105340
3
12.0
3
87
0
54
33
5
0
61
1.19
99105690--99105722
15
2.1
16
88
11
50
36
6
3
54
1.41
99105688--99105722
17
2.1
17
94
0
61
37
5
2
54
1.39
99110389--99110451
27
2.3
27
88
0
90
25
26
26
20
1.99
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21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
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10
3.7
10
96
0
65
13
10
0
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1.04
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28
2.2
28
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5
72
47
1
3
47
1.28
99131074--99131123
22
2.2
22
89
7
73
62
0
0
38
0.96
99131067--99131109
18
2.4
18
84
3
52
65
2
0
32
1.06
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24
2.2
23
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3
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54
3
11
29
1.54
99131764--99131830
33
2.0
33
97
0
125
32
28
14
23
1.95
99132115--99132159
22
2.0
22
100
0
90
28
17
0
53
1.44
99135155--99135198
22
2.0
21
86
4
61
36
2
0
61
1.09
99139518--99139571
22
2.4
23
81
9
67
40
16
25
16
1.89
99140752--99140846
7
14.1
7
71
16
58
48
1
1
49
1.15
99142563--99142866
49
5.8
53
82
6
277
36
18
24
21
1.95
99143058--99143088
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99145408--99145727
46
7.0
46
90
0
399
39
13
24
22
1.90
99146013--99146045
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
99156964--99157001
20
1.9
19
85
15
51
28
5
10
55
1.56
99162401--99162448
12
3.9
12
78
5
60
16
4
16
62
1.48
99175264--99175338
18
4.2
18
91
0
123
32
16
24
28
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99176229--99176284
25
2.3
26
82
11
66
25
14
1
58
1.45
99176425--99176463
19
2.0
20
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10
53
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2
10
20
1.33
99177434--99177466
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4.7
7
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14
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0
0
39
0.97
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10
59
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0
0
39
0.96
99177954--99177983
14
2.1
14
100
0
60
23
43
6
26
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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