Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  44  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
100
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32
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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22
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42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.64
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233
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16
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0
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1.10
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17
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0
1
38
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12769098--12769287
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11.1
16
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1
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0
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14
65
73
0
15
10
1.09
12775668--12775700
16
2.1
16
88
11
50
27
0
6
66
1.15
12787804--12788176
44
8.6
42
72
11
204
31
20
21
26
1.98
12788027--12788188
87
1.9
87
84
2
218
29
20
24
25
1.99
12787851--12788292
218
2.0
213
80
7
473
30
19
22
26
1.98
12790210--12790334
61
2.1
57
80
11
137
37
6
6
49
1.54
12792112--12792170
30
2.0
30
86
6
84
20
49
11
18
1.79
12794499--12794534
17
2.1
17
100
0
72
27
22
13
36
1.92
12797138--12797180
22
2.0
22
86
9
61
39
0
2
58
1.11
12797571--12797620
7
7.4
7
73
8
50
30
0
4
66
1.10
12800112--12800171
29
2.1
28
81
9
68
56
8
1
33
1.39
12801854--12802212
179
2.0
179
86
2
506
33
10
7
48
1.65
12806746--12806786
19
2.1
19
86
9
55
63
0
4
31
1.15
12808325--12808740
44
9.5
44
66
13
219
20
22
22
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12808304--12809227
88
10.5
88
87
1
1217
20
23
20
34
1.97
12808373--12808864
44
11.2
44
63
18
148
21
21
21
34
1.96
12854708--12855026
40
8.5
39
69
20
173
30
20
21
27
1.98
12854712--12855051
35
9.1
35
70
18
206
30
20
21
27
1.98
12854671--12855140
75
6.3
75
88
1
564
30
21
22
25
1.99
12858177--12858226
25
2.0
25
100
0
100
44
0
24
32
1.54
12862203--12862254
6
8.7
6
85
8
61
9
17
38
34
1.82
12862200--12862254
18
3.1
18
84
10
76
10
16
38
34
1.84
12874895--12874942
19
2.6
19
83
3
62
33
2
16
47
1.58
12874956--12875048
43
2.2
43
90
3
143
26
6
15
51
1.67
12883937--12883966
12
2.5
12
94
0
51
46
0
6
46
1.29
12884051--12884097
17
2.8
17
78
15
53
61
8
0
29
1.25
12884308--12884389
3
27.0
3
73
22
50
64
1
3
30
1.18
12884313--12884389
18
4.3
18
76
12
70
64
1
3
29
1.19
12884308--12884382
24
3.2
23
75
16
73
64
1
4
30
1.20
12894489--12894517
14
2.1
14
100
0
58
31
13
27
27
1.94
12894558--12894790
79
3.0
78
81
7
280
15
18
16
49
1.79
12899673--12899734
32
1.9
32
87
6
90
45
12
17
24
1.84
12918495--12918532
20
1.9
20
88
0
58
34
5
7
52
1.53
12919177--12919235
29
2.1
28
84
15
77
52
0
0
47
1.00
12919177--12919235
28
2.1
30
84
15
81
52
0
0
47
1.00
12925947--12926085
3
48.3
3
71
14
80
28
4
2
64
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12928839--12928864
11
2.4
11
100
0
52
38
0
11
50
1.39
12930874--12930979
49
2.2
49
82
3
124
36
28
8
26
1.86
12931771--12931836
32
2.1
32
100
0
132
46
12
6
34
1.66
12932677--12932714
16
2.4
16
86
4
51
55
7
15
21
1.66
12934752--12934790
20
2.0
19
85
5
51
35
2
0
61
1.10
12934754--12934814
17
3.4
17
82
11
61
31
1
0
67
1.01
12944072--12944129
22
2.6
22
76
10
73
29
12
18
39
1.87
12947301--12947356
17
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16
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1
23
5
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1.18
12947372--12947428
5
11.4
5
100
0
114
59
0
0
40
0.97
12956932--12957067
57
2.4
56
80
12
154
22
16
3
56
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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