Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  110  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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196
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28
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13
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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17
1
71
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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10
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1
20
2
75
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35808154--35808224
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3.3
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1
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0.97
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16
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45
12
16
25
1.83
35819171--35819252
30
2.7
31
81
5
96
65
1
21
10
1.30
35819176--35819245
24
2.9
24
74
6
61
62
1
24
11
1.36
35820921--35820988
12
5.4
12
74
19
50
73
4
7
14
1.21
35822052--35822085
18
1.9
18
88
5
52
52
2
35
8
1.47
35825772--35825868
30
3.2
30
76
2
97
29
26
14
28
1.95
35827625--35827672
20
2.4
20
67
0
51
33
18
27
20
1.96
35827999--35828055
20
2.8
20
81
2
69
29
35
12
22
1.91
35830667--35830772
48
2.2
47
85
9
135
59
1
24
14
1.45
35832433--35832489
20
2.8
20
81
2
69
28
35
12
24
1.91
35843963--35844015
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
35847335--35847396
10
5.9
10
76
10
61
35
32
1
30
1.68
35847335--35847397
21
3.0
21
90
2
90
34
33
1
30
1.67
35847714--35847755
11
3.9
11
84
3
59
83
0
4
11
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35847714--35847757
10
4.1
11
83
13
56
81
0
4
13
0.83
35847714--35847757
22
2.0
22
90
0
70
81
0
4
13
0.83
35848524--35848557
15
2.3
15
89
0
50
35
29
32
2
1.73
35852028--35852276
121
2.0
124
83
9
312
40
17
14
27
1.88
35854302--35854348
20
2.3
20
81
0
58
23
12
34
29
1.92
35854984--35855008
13
1.9
13
100
0
50
64
8
0
28
1.22
35855232--35855271
21
1.9
21
94
0
71
40
17
22
20
1.92
35857264--35857360
30
3.2
30
75
2
106
28
26
15
28
1.96
35859081--35859118
11
3.2
12
85
14
53
73
7
5
13
1.22
35859088--35859138
10
4.8
11
88
9
54
78
3
11
5
1.06
35859100--35859138
10
3.8
10
93
3
60
82
2
12
2
0.89
35859111--35859152
10
3.5
12
87
12
52
80
2
14
2
0.90
35859101--35859191
47
2.0
45
83
12
114
74
4
14
6
1.17
35860084--35860145
5
12.0
5
76
19
56
75
1
19
3
1.02
35860084--35860145
26
2.4
26
81
5
81
75
1
19
3
1.02
35860072--35860147
31
2.5
30
73
23
77
73
2
19
3
1.11
35860193--35860223
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
35862403--35862498
30
3.2
30
75
5
106
29
27
14
29
1.95
35865927--35865967
19
2.1
20
95
4
75
0
24
4
70
1.06
35875652--35875717
21
3.0
22
82
4
71
30
6
28
34
1.81
35877090--35877146
29
2.0
29
92
0
96
24
0
29
45
1.53
35882621--35882661
17
2.4
18
80
8
50
14
24
4
56
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35882590--35882645
24
2.3
25
79
14
64
10
23
3
62
1.43
35884852--35884880
15
1.9
15
100
0
58
13
6
6
72
1.26
35884860--35884892
12
2.6
13
90
4
50
12
9
3
75
1.14
35884859--35884894
13
2.7
14
87
12
58
11
8
5
75
1.19
35888471--35888526
30
1.9
28
85
7
76
12
30
3
53
1.55
35888621--35888654
12
2.8
12
90
0
50
20
20
8
50
1.75
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12
2.8
12
100
0
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12
0
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2.3
20
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1.91
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2.0
29
92
0
96
24
0
29
45
1.53
35898750--35898811
10
5.9
10
74
10
52
33
32
3
30
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320