Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  281  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Period
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Period
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Number
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Score
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11
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Indices
Period
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Score
A
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(0-2)
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103
15
1
3
80
0.93
90849552--90849639
40
2.2
40
86
8
117
11
2
2
84
0.81
90849558--90849639
18
4.4
18
76
14
69
10
2
2
84
0.82
90849553--90849626
1
74.0
1
78
0
58
9
2
1
86
0.73
90849635--90849683
23
2.2
21
86
13
64
22
0
4
73
1.00
90861499--90861736
87
2.7
87
93
1
379
30
21
22
25
1.99
90861493--90861735
131
1.9
131
80
3
292
30
21
23
25
1.99
90861275--90861735
44
10.6
44
73
9
272
31
21
21
26
1.98
90861738--90861894
83
1.9
83
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0
188
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1.96
90863285--90863372
3
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3
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29
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60
1.37
90863290--90863372
12
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12
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8
85
30
8
2
59
1.40
90871980--90872026
21
2.2
22
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3
69
23
19
36
21
1.95
90875622--90875666
20
2.2
20
84
7
56
33
0
2
64
1.06
90876433--90876466
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90881071--90881104
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
90882122--90882148
14
1.9
14
100
0
54
37
7
3
51
1.48
90884928--90884954
4
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4
100
0
54
25
0
22
51
1.48
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41
2.2
41
91
0
142
35
20
21
22
1.96
90887746--90887868
41
3.0
41
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4
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35
20
21
22
1.96
90888425--90888478
28
1.9
28
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0
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35
37
9
18
1.83
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5
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44
22
1
31
1.60
90888385--90888646
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133
79
10
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24
1.69
90888650--90888686
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2.5
15
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1.66
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26
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32
1.68
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23
2.2
23
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0
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13
13
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1.84
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9
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9
75
10
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20
0
31
1.56
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39
3.0
39
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21
0
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1.52
90892930--90893085
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3.3
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177
45
21
0
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1.57
90892932--90893083
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57
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175
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22
0
30
1.57
90892919--90893070
39
4.1
37
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193
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21
0
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1.56
90894271--90894540
137
2.0
137
96
1
497
32
24
18
25
1.97
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26
3.2
26
91
0
141
36
25
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1.77
90897976--90898084
41
2.6
41
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4
139
41
21
18
19
1.91
90898266--90898356
7
12.4
7
71
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56
26
1
26
46
1.60
90898267--90898351
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3.9
21
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11
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27
1
27
44
1.62
90898274--90898367
46
2.0
46
97
0
179
28
2
26
42
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90898394--90898491
7
14.0
7
71
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56
21
0
39
38
1.54
90899235--90899292
5
10.8
5
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12
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43
0
1
55
1.10
90899236--90899293
8
6.7
9
74
21
61
43
0
1
55
1.10
90899238--90899293
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
90900606--90900644
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
90900884--90901018
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74
8
103
22
20
28
28
1.98
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19
2.2
19
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0
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209
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13
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34
13
15
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1.86
90905419--90905460
22
1.9
22
100
0
84
35
11
14
38
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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