Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  273  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Indices
Period
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Number
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Score
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1.77
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Period
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A
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(0-2)
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1.65
88215343--88215398
19
3.0
18
76
19
53
23
7
21
48
1.74
88218970--88219358
203
1.9
203
96
0
724
26
18
24
29
1.98
88222711--88222739
14
2.1
14
100
0
58
13
27
13
44
1.82
88232420--88232448
14
2.0
15
93
6
51
37
0
0
62
0.96
88232697--88232741
22
2.2
20
84
8
54
51
0
2
46
1.13
88232702--88232738
19
2.1
17
90
10
56
51
0
0
48
1.00
88244288--88244356
27
2.5
28
88
6
106
31
2
4
60
1.31
88247123--88247190
16
4.2
16
88
3
93
29
0
35
35
1.58
88247131--88247192
32
1.9
32
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0
115
30
0
35
33
1.58
88247178--88247268
44
2.0
44
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2
119
35
5
27
31
1.80
88247176--88247280
44
2.5
40
73
16
113
34
5
28
31
1.81
88247406--88247447
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
88247415--88247456
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
88247490--88247533
21
2.1
21
83
8
54
56
6
0
36
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88253096--88253428
131
2.6
130
84
3
415
32
17
14
34
1.91
88256797--88256852
29
1.9
29
89
7
87
25
16
7
51
1.69
88262827--88262852
4
6.5
4
100
0
52
50
26
0
23
1.50
88265890--88265935
24
1.9
24
90
0
74
36
2
0
60
1.09
88265908--88265945
17
2.2
17
86
9
51
44
2
0
52
1.14
88274217--88274259
20
2.2
20
91
8
70
76
4
2
16
1.05
88274313--88274546
113
2.1
113
87
5
339
50
7
6
35
1.57
88277686--88278037
183
2.0
174
84
7
456
34
17
22
26
1.95
88279684--88279751
9
7.6
9
78
6
57
44
16
7
32
1.75
88279770--88279810
6
6.5
6
83
10
55
17
0
4
78
0.93
88293068--88293114
20
2.5
18
83
16
60
59
2
2
36
1.21
88294034--88294093
30
2.0
31
86
3
86
48
8
8
35
1.63
88294839--88294887
23
2.0
24
84
15
64
34
0
4
61
1.15
88300079--88300137
30
2.0
30
100
0
118
40
3
22
33
1.70
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21
3.0
23
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21
72
64
0
5
29
1.17
88302079--88302194
29
4.0
28
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20
78
64
0
7
27
1.21
88302131--88302176
15
2.9
15
90
6
65
67
0
6
26
1.15
88302156--88302196
14
2.8
15
75
20
50
60
0
9
29
1.28
88302131--88302191
15
4.1
14
80
16
54
67
0
6
26
1.15
88302169--88302233
20
3.1
20
68
25
53
64
3
6
26
1.32
88314312--88314345
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
88314977--88315031
27
2.1
26
83
10
67
29
3
7
60
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88319328--88319362
17
2.1
16
89
5
52
37
0
2
60
1.12
88319273--88319395
63
1.9
64
93
1
212
35
3
4
56
1.37
88326548--88326628
27
3.0
26
83
10
83
54
2
2
40
1.27
88327205--88327246
6
7.2
6
86
5
59
69
0
0
30
0.89
88327205--88327246
17
2.4
17
88
4
57
69
0
0
30
0.89
88327182--88327266
11
8.0
11
70
12
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61
1
1
36
1.12
88347241--88347302
30
2.1
30
84
0
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59
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1.44
88347280--88347310
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1.22
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21
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14
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1.90
88353440--88353485
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320