Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  12  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3382594--3382626
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100
0
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2.0
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21
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3386144--3386480
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20
21
14
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0
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0
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0
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0
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0
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2.7
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2
2
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1.32
3430663--3430718
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2.2
26
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3
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2.0
39
100
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1.9
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2.8
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40
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3.0
28
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0
0
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4
5
51
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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65
0
0
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4
46
1.40
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3.4
63
69
21
192
42
3
6
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1.44
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120
2.4
120
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488
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2
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0
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3
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1.39
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2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
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118
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11
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0
50
24
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8
68
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3517079--3517158
26
3.1
26
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15
76
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0
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1.19
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5
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1.46
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2.0
23
96
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0
4
22
1.01
3523756--3523803
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12
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15
57
72
0
4
22
1.01
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3.0
32
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118
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19
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44
0.99
3542473--3542898
59
7.1
58
64
21
182
49
6
2
41
1.41
3542551--3542597
16
3.0
16
78
12
53
51
2
0
46
1.13
3542444--3542971
120
4.4
120
94
0
839
50
5
2
41
1.39
3542696--3542730
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
3542722--3542751
16
1.9
15
93
6
51
50
10
0
40
1.36
3542772--3542960
59
3.2
58
66
19
163
50
4
3
41
1.39
3542953--3543120
47
3.7
46
70
18
143
47
3
3
45
1.37
3542968--3543144
91
1.9
92
88
4
254
49
3
2
44
1.33
3543109--3543147
17
2.5
15
84
12
51
58
0
0
41
0.98
3559334--3559360
6
4.5
6
100
0
54
48
0
18
33
1.49
3559334--3559368
18
1.9
18
88
0
52
45
2
20
31
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3560387--3560424
20
1.9
19
89
5
58
52
13
2
31
1.54
3560582--3560862
91
3.1
89
83
3
328
35
17
12
34
1.87
3563486--3563535
19
2.6
19
81
12
66
28
6
0
66
1.15
3563558--3563616
28
2.1
28
81
6
66
30
3
3
62
1.28
3565381--3565693
85
3.6
84
84
6
369
35
8
17
37
1.81
3565381--3565693
171
1.8
173
82
8
404
35
8
17
37
1.81
3566217--3566324
39
2.8
39
80
9
114
44
21
7
26
1.78
3566216--3566365
19
7.8
19
72
3
102
44
22
7
25
1.78
3570043--3570151
26
4.2
26
93
0
191
35
23
7
33
1.83
3572277--3572332
3
18.7
3
78
14
62
37
0
0
62
0.95
3572276--3572332
17
3.4
17
92
7
89
38
0
0
61
0.96
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16
2.1
16
94
0
57
75
6
15
3
1.11
3572410--3572439
14
2.1
15
93
6
53
73
0
23
3
0.98
3573384--3573427
23
1.9
23
90
0
70
11
4
36
47
1.60
3575487--3575523
9
4.1
9
89
0
56
48
10
10
29
1.72
3576434--3576464
5
6.2
5
100
0
62
22
19
19
38
1.93
3578185--3578253
29
2.3
30
76
11
70
49
4
0
46
1.21
3578186--3578250
30
2.2
30
83
5
78
49
4
0
46
1.22
3582776--3582805
6
5.0
6
100
0
60
16
66
16
0
1.25
3586357--3586405
9
5.6
9
87
2
73
87
2
2
8
0.69
3586357--3586412
17
3.2
17
87
5
85
87
3
1
7
0.72
3586364--3586412
9
5.6
9
85
4
55
87
4
2
6
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3587725--3587868
60
2.4
61
80
12
147
33
3
8
54
1.47
3589807--3590045
41
5.8
41
87
5
288
27
19
24
28
1.99
3589817--3590045
123
1.9
123
85
5
320
27
19
24
28
1.98
3597442--3597680
82
2.9
80
84
7
293
28
19
24
28
1.98
3597452--3597680
123
1.9
123
84
5
311
27
18
24
28
1.98
3597442--3597638
41
4.8
41
92
3
283
26
19
24
28
1.99
3599177--3599202
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
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25
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62
1
1
34
1.15
3610274--3610328
21
2.6
21
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58
61
0
5
32
1.19
3615370--3615413
21
2.1
21
86
0
61
56
6
9
27
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320