Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  28  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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0
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27
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
22
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7
68
36
3
5
55
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8044686--8044743
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1.9
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89
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2.4
17
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1.66
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17
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1.97
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11
130
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26
19
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21
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4
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15
26
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33
0.92
8079813--8079971
42
3.7
43
77
13
136
30
26
18
24
1.98
8090186--8090224
20
2.0
20
85
10
53
46
0
7
46
1.31
8094797--8094829
14
2.2
16
89
10
52
18
3
0
78
0.87
8100800--8100847
25
1.9
25
83
8
62
56
4
0
39
1.19
8101234--8101277
18
2.4
18
92
0
70
43
9
27
20
1.82
8102841--8102892
25
2.1
24
82
10
61
69
1
0
28
0.99
8102897--8102925
7
4.3
7
95
4
51
55
0
0
44
0.99
8103083--8103126
21
2.1
21
82
0
52
38
2
25
34
1.68
8104883--8104920
13
2.8
13
88
4
58
42
0
13
44
1.43
8104934--8104985
10
5.1
10
83
2
50
25
5
1
67
1.23
8104934--8104983
20
2.5
20
80
6
57
24
6
2
68
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8106844--8106909
20
3.3
20
72
20
66
63
1
1
33
1.13
8107384--8107423
15
2.7
15
88
0
53
62
0
2
35
1.09
8107411--8107441
6
5.2
6
100
0
62
80
0
0
19
0.71
8110893--8110946
22
2.4
23
84
9
67
37
3
0
59
1.15
8116083--8116128
22
2.1
22
83
0
56
19
8
21
50
1.75
8116687--8116871
94
2.0
94
89
0
280
34
14
12
37
1.85
8120985--8121024
20
2.0
20
85
5
53
5
25
17
52
1.64
8129873--8129924
19
2.7
19
80
14
61
34
1
1
61
1.18
8131890--8131950
32
2.0
30
84
12
79
65
1
3
29
1.18
8131910--8131991
39
2.1
39
95
0
146
65
2
6
25
1.28
8135589--8135649
11
5.5
11
72
14
54
49
1
1
47
1.21
8135591--8135634
17
2.6
17
82
7
54
52
2
2
43
1.26
8135594--8135638
24
2.0
22
86
8
63
51
2
2
44
1.26
8135672--8135720
20
2.7
18
77
22
57
51
4
2
42
1.32
8137226--8137271
21
2.2
21
88
7
67
19
4
6
69
1.28
8138037--8138073
20
1.9
20
88
5
58
18
27
29
24
1.98
8141549--8141597
20
2.5
20
86
0
62
22
22
0
55
1.44
8142254--8142464
40
5.3
40
83
2
244
47
26
12
13
1.78
8146246--8146284
18
2.2
18
100
0
78
30
7
20
41
1.80
8149011--8149062
18
2.9
18
76
0
59
26
7
21
44
1.79
8149266--8149314
22
2.3
21
78
3
53
32
6
18
42
1.75
8151208--8151404
92
2.1
92
92
0
322
32
24
12
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8152219--8152298
23
3.2
23
65
19
61
33
13
1
51
1.50
8152206--8152313
52
2.1
52
100
0
216
32
12
1
52
1.50
8153132--8153170
17
2.3
17
86
8
53
33
7
15
43
1.75
8161317--8161372
12
5.0
11
78
10
60
64
3
0
32
1.11
8161317--8161372
21
2.8
20
80
20
71
64
3
0
32
1.11
8161322--8161387
12
5.2
13
72
22
52
68
3
0
28
1.05
8161317--8161383
33
2.1
32
91
2
107
65
4
0
29
1.12
8161330--8161388
18
3.1
18
81
13
57
67
3
0
28
1.06
8161416--8161466
25
2.0
26
88
7
77
62
3
0
33
1.13
8161409--8161468
29
2.0
30
81
9
70
60
3
1
35
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320