Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  181  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59929815--59930508
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138
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59929815--59930508
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2.5
275
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12
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0
51
30
0
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20
1.49
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28
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80
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207
23
21
30
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80
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1
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13
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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203
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15
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14
14
17
53
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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28
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1.85
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2.0
65
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2.0
139
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1.97
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18
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16
11
1.67
60188151--60188319
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3.6
47
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4
180
30
27
17
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60194757--60194981
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27
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24
21
28
25
1.99
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119
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21
27
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8
0
26
1.23
60219299--60219395
11
8.8
11
87
0
122
51
34
11
3
1.53
60228920--60229086
46
3.6
47
74
13
166
30
31
18
19
1.96
60228928--60229099
93
1.8
93
88
2
265
29
30
19
20
1.97
60229172--60229439
46
5.8
45
70
15
188
31
28
17
22
1.97
60229225--60229387
47
3.5
47
72
14
165
31
30
17
20
1.96
60229178--60229443
93
2.9
93
90
0
424
30
29
18
22
1.97
60231205--60231422
40
5.5
40
85
2
262
26
27
22
22
1.99
60240156--60240331
48
3.7
48
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0
253
23
18
32
25
1.97
60240157--60240331
96
1.8
96
91
0
287
22
18
32
25
1.97
60240159--60240377
96
2.3
96
83
1
251
25
18
30
26
1.98
60243451--60243523
35
2.1
35
97
0
137
36
5
17
39
1.73
60244708--60244749
17
2.5
17
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11
50
33
0
19
47
1.49
60244920--60245055
43
3.2
43
93
0
227
11
22
34
30
1.90
60245212--60245311
29
3.4
29
68
10
87
24
21
25
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60245241--60245395
29
5.4
29
70
11
113
22
18
30
27
1.97
60245299--60245395
28
3.4
28
73
7
88
20
18
34
26
1.96
60245209--60245377
58
2.9
58
93
0
286
23
19
28
28
1.98
60249317--60249389
35
2.1
35
97
0
137
36
5
17
39
1.73
60256821--60256858
12
2.9
13
80
11
51
47
0
15
36
1.46
60256871--60257014
52
2.8
49
77
14
121
63
2
4
29
1.26
60256903--60257002
12
8.1
12
71
24
66
65
1
4
30
1.18
60256958--60256990
17
1.9
17
93
0
57
57
0
6
36
1.23
60261625--60261889
40
6.7
40
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351
25
26
21
25
2.00
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26
1.9
25
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4
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26
12
18
42
1.85
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4.7
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4
292
24
18
27
28
1.98
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49
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3
285
24
17
28
29
1.98
60286136--60286219
28
3.2
28
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25
74
23
17
29
28
1.97
60287943--60288223
48
5.8
48
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5
242
30
18
24
25
1.98
60287935--60288221
98
2.9
97
84
1
369
31
18
24
25
1.98
60289736--60289837
28
3.7
27
73
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26
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27
1.95
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2.2
16
89
0
52
17
20
17
45
1.85
60293452--60293575
43
2.9
42
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5
133
48
3
19
29
1.64
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134
1.9
133
85
4
351
36
24
18
21
1.95
60298554--60298622
33
2.1
34
94
2
122
52
2
31
13
1.55
60299853--60299877
11
2.3
11
100
0
50
36
20
16
28
1.93
60302053--60302379
48
6.8
48
81
4
381
27
19
28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60302112--60302382
144
1.9
145
92
2
456
26
19
28
25
1.99
60312265--60312422
68
2.3
68
77
11
160
20
28
15
34
1.94
60319066--60319490
48
8.9
48
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4
340
27
20
28
23
1.99
60319066--60319489
96
4.4
96
79
7
414
27
20
28
23
1.99
60319064--60319489
144
3.0
143
81
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430
27
20
28
23
1.99
60327542--60327692
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3.8
39
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196
23
25
28
22
1.99
60329248--60329296
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2.3
22
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27
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26
1.99
60336386--60336667
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2.9
96
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322
25
27
20
26
1.99
60336386--60336653
144
1.9
144
84
3
369
24
27
21
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320