Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  319  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102387939--102388052
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0
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2.0
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1.93
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298
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4.0
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78
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59
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0
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16
27
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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21
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0
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28
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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0
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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18
77
16
69
58
0
6
35
1.24
102584555--102584621
37
1.9
35
85
11
93
56
0
7
35
1.27
102586229--102586485
132
1.9
132
85
3
347
31
23
17
28
1.97
102586523--102587172
88
7.4
88
89
1
903
24
24
23
27
2.00
102588234--102588280
21
2.2
21
84
0
58
27
38
8
25
1.85
102589278--102589307
8
3.6
8
95
4
51
13
0
13
73
1.10
102591886--102591934
19
2.5
20
80
6
57
42
12
18
26
1.85
102594249--102594302
18
3.0
18
89
5
83
57
0
7
35
1.27
102594249--102594317
37
2.0
34
83
13
88
56
0
7
36
1.27
102595676--102595829
51
3.0
51
96
1
274
45
18
8
27
1.78
102595775--102595885
33
3.4
34
81
10
106
43
17
9
30
1.79
102598916--102599658
120
6.2
120
97
0
1405
44
2
5
47
1.40
102599607--102599641
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
102599806--102599896
45
2.0
45
85
2
121
37
28
6
27
1.82
102599877--102599945
16
4.2
16
92
3
120
36
37
1
24
1.65
102599877--102599945
33
2.1
32
94
2
120
36
37
1
24
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102605718--102605838
59
2.0
60
84
4
156
39
16
22
21
1.92
102606066--102606090
12
2.1
12
100
0
50
8
0
16
76
1.02
102616329--102616396
16
4.2
16
90
7
102
27
0
33
38
1.57
102616329--102616396
32
2.1
32
94
0
118
27
0
33
38
1.57
102616526--102616835
157
2.0
157
93
0
530
44
3
4
47
1.41
102624996--102625122
62
2.0
62
100
0
254
26
9
15
48
1.76
102628519--102628616
51
1.9
50
89
2
151
41
3
12
42
1.57
102629709--102629773
17
4.1
17
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18
50
29
0
6
64
1.17
102629721--102629782
30
2.1
30
90
0
97
29
1
9
59
1.38
102631966--102632029
29
2.2
30
82
2
76
43
12
4
39
1.63
102642680--102642709
3
10.0
3
100
0
60
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0
0
33
0.92
102644373--102644451
37
2.1
39
90
4
126
29
2
7
60
1.37
102646661--102646701
21
1.9
22
85
5
57
39
9
2
48
1.49
102653419--102653666
123
2.0
123
100
0
496
31
14
23
31
1.94
102660859--102660899
21
2.0
21
90
9
66
39
0
0
60
0.96
102660859--102660903
11
4.1
12
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21
53
37
0
0
62
0.96
102661035--102661069
7
5.0
7
92
0
61
71
0
2
25
1.00
102663841--102663971
57
2.3
58
85
7
171
25
27
19
26
1.99
102670992--102671021
15
2.0
15
100
0
60
33
13
13
40
1.83
102675021--102675083
29
2.2
29
97
0
117
47
7
6
38
1.58
102682392--102682429
19
2.0
19
94
0
67
39
2
0
57
1.12
102682909--102682950
17
2.5
17
80
7
50
59
2
0
38
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102687838--102687895
27
2.2
26
96
3
107
53
0
13
32
1.40
102689286--102689357
35
2.1
35
97
0
135
44
6
5
43
1.54
102692883--102692941
21
2.8
22
80
7
61
22
0
8
69
1.15
102692912--102692961
26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
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1.18
102693532--102693574
18
2.4
18
84
7
52
37
0
2
60
1.10
102696222--102696298
26
3.0
26
79
5
68
71
5
1
22
1.13
102696242--102696275
18
2.0
16
88
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50
76
2
0
20
0.92
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2.0
25
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6
2
18
1.14
102696411--102696456
20
2.2
21
80
7
58
63
2
2
32
1.19
102702714--102702741
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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