Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  314  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
4.3
23
93
2
171
20
22
26
30
1.98
100489943--100490031
45
2.0
45
97
0
169
19
23
26
30
1.98
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21
2.0
21
90
0
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19
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21
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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0
1
41
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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23
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15
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54
0
6
40
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100692222--100692403
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0
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19
3.0
19
70
19
55
57
3
3
35
1.34
100711358--100711412
19
2.8
19
79
12
67
40
3
1
54
1.28
100711347--100711420
20
3.8
20
67
16
55
35
2
2
59
1.26
100711439--100711520
10
8.5
10
72
16
57
32
0
2
64
1.07
100711439--100711498
19
3.0
20
76
14
61
31
0
3
65
1.09
100711467--100711529
19
3.5
19
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6
69
33
0
1
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1.03
100714937--100715117
79
2.3
79
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1
265
24
11
28
35
1.90
100719084--100719125
21
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21
86
4
59
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2
23
7
1.28
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99
2.0
99
99
0
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20
19
1.84
100724367--100724411
23
2.0
23
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4
0
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0
49
1.20
100726368--100726423
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17
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3
0
33
1.12
100729061--100729103
15
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15
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0
50
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2
2
20
1.04
100729097--100729172
37
2.1
37
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0
143
53
13
3
28
1.57
100731248--100731272
13
1.9
13
100
0
50
52
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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0
32
0
68
0.90
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22
2.2
22
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7
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4
27
1.30
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2.1
12
100
0
50
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0
0
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17
2.0
17
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0
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0
5
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0
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3
11
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1.58
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2
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2
100
0
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0
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30
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0
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30
0
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3
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20
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0
5
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0
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24
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2.0
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2
1
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0
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21
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18
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0
30
0
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0.89
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3.0
13
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20
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2
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100855964--100856114
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2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
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46
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303
22
22
13
41
1.88
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53
3.6
53
80
3
207
27
20
17
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100863659--100863705
21
2.2
22
88
3
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40
2
0
57
1.11
100863850--100863899
22
2.3
23
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10
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52
6
2
40
1.38
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26
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0
100
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1.57
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3
100
0
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0
0
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0
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0
0
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2.6
28
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12
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4
0
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1.19
100896208--100896253
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2.0
24
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0
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3
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1.27
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10
0
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23
2.0
23
100
0
90
44
4
6
44
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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