Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  248  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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13
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5
29
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.99
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48
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5
46
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
81348290--81348350
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50
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0
147
17
21
27
33
1.96
81361115--81361208
44
2.1
44
88
4
134
18
21
25
35
1.95
81362419--81362496
40
2.0
40
87
5
113
23
11
33
32
1.90
81365003--81365061
23
2.6
22
71
10
57
28
6
1
62
1.30
81366682--81366714
17
1.9
17
93
0
57
69
21
0
9
1.15
81367917--81367973
29
2.0
29
92
0
96
33
0
0
66
0.92
81367926--81368155
17
14.0
16
67
20
86
35
1
0
62
1.09
81367979--81368016
19
2.0
20
89
5
60
55
2
0
42
1.14
81368006--81368086
9
8.9
9
75
15
69
34
0
1
64
1.02
81368004--81368167
12
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12
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19
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33
1
1
64
1.10
81368026--81368159
10
14.8
9
70
20
75
32
1
0
64
1.08
81368046--81368173
50
2.6
48
75
18
120
32
1
0
64
1.08
81368034--81368162
55
2.3
57
86
4
181
33
1
0
65
1.02
81368659--81368787
66
2.0
66
80
11
149
28
5
14
51
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81370353--81370483
36
3.9
36
70
18
95
34
2
16
47
1.59
81370375--81370473
27
3.3
27
70
22
81
35
1
16
47
1.53
81370372--81370483
36
3.4
34
69
21
103
35
0
16
46
1.54
81370397--81370482
9
9.6
9
74
9
77
34
0
17
47
1.48
81370397--81370482
18
4.8
18
73
11
86
34
0
17
47
1.48
81370415--81370530
45
2.6
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10
134
36
0
14
48
1.50
81370406--81370490
27
3.1
27
78
6
91
34
1
16
48
1.54
81370389--81370527
54
2.5
53
79
10
154
35
0
14
48
1.49
81374399--81374454
28
2.0
29
89
3
87
44
33
0
21
1.52
81374405--81374475
15
4.9
15
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11
58
49
28
0
22
1.50
81374430--81374554
22
5.7
22
70
12
53
53
25
0
20
1.51
81374505--81374582
29
2.7
29
80
7
88
48
29
3
17
1.65
81377137--81377191
29
1.9
28
88
3
83
21
18
27
32
1.96
81379629--81379698
9
7.8
9
96
0
113
22
10
28
38
1.87
81380397--81380429
17
2.0
17
88
5
50
42
0
9
48
1.35
81384644--81384726
29
2.8
30
76
16
84
39
0
1
59
1.05
81387396--81387442
20
2.3
21
74
3
51
48
6
2
42
1.40
81387466--81387496
15
2.1
15
93
0
53
48
0
0
51
1.00
81387538--81387580
19
2.3
19
83
0
50
39
0
2
58
1.11
81401117--81401147
15
2.1
15
93
0
53
48
0
0
51
1.00
81401189--81401238
18
2.9
18
73
8
59
42
0
4
54
1.19
81406363--81406578
47
4.5
47
77
8
184
30
27
16
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81409064--81409143
15
5.5
15
83
4
101
60
13
16
10
1.59
81409064--81409147
44
1.9
44
85
4
116
58
16
15
9
1.62
81409076--81409152
15
5.2
15
77
10
70
57
15
15
11
1.66
81412351--81412566
47
4.5
47
77
8
184
30
27
16
25
1.97
81419214--81419269
24
2.3
24
78
6
60
60
0
7
32
1.24
81422705--81423027
176
1.8
175
87
4
481
28
23
17
29
1.97
81422886--81422980
43
2.2
45
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3
131
28
25
15
30
1.96
81422893--81423174
147
1.9
146
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386
27
25
14
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1.95
81423114--81423390
90
3.1
90
78
12
304
29
22
22
26
1.99
81423205--81423372
82
2.0
83
84
6
216
27
22
22
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320