Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  270  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87460136--87460200
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30
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87460845--87460959
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2.0
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1.83
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2.1
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2.0
14
100
0
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57
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21
14
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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18
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4
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31
2
2
63
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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12
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0
47
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87569315--87569449
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1.32
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5
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52
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0
0
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12
21
1.88
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33
4.3
33
78
12
167
61
13
17
7
1.55
87574536--87574590
18
3.2
17
71
23
53
61
16
14
7
1.54
87575121--87575147
11
2.5
11
100
0
54
22
7
18
51
1.70
87576548--87576742
93
2.1
92
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4
286
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4
4
47
1.41
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2.0
17
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0
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5
0
50
1.26
87576775--87576813
17
2.4
16
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43
5
0
51
1.24
87576779--87576818
17
2.3
18
83
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47
5
0
47
1.24
87576898--87577032
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2
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51
1.32
87576774--87576992
120
1.8
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87577000--87577041
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0
2
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1.13
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1.9
156
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2
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5
3
44
1.40
87577141--87577175
18
2.0
17
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0
0
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28
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2
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1.71
87577421--87577477
16
3.6
16
95
0
87
33
36
0
29
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.6
16
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0
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29
0
36
33
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2.0
17
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5
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54
0
0
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0.99
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15
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52
2
0
45
1.13
87593771--87594068
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1.9
156
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2
528
44
2
5
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15
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3
2
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1.32
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154
2.0
155
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3
3
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1.38
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3
2
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1.8
119
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5
3
40
1.44
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17
2.5
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51
0
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1.24
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2.0
17
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0
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0
5
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1.26
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2.1
92
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11
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0
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28
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0
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29
0
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17
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0
0
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52
2
0
45
1.13
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156
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2
537
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3
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87601610--87601744
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3
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154
2.0
155
83
7
401
46
4
3
45
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87601670--87601760
44
2.1
43
81
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103
53
3
2
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1.29
87601650--87601868
120
1.8
119
89
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5
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1.44
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0
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0
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50
0
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0
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23
2.2
24
83
10
63
32
5
0
61
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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