Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  52  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15126195--15126364
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5
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26
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15126195--15126364
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214
27
29
17
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1.97
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54
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26
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26
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3
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29
2.1
29
82
5
72
29
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6
48
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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201
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62
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0
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1.48
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13
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0
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0
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21
0.92
15213884--15214423
151
3.6
150
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779
59
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5
27
1.48
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50
2.0
50
92
0
166
22
29
17
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
38
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3.2
17
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16
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2.7
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95
2
120
48
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8
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1.65
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2.1
23
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22
2.1
22
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58
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10
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2.1
21
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6
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1.31
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1.57
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15
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1.56
15245798--15246136
158
2.1
160
97
2
646
49
13
2
34
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15251895--15251927
18
1.9
17
88
11
50
30
15
12
42
1.83
15252586--15252722
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2.3
59
82
8
152
26
24
20
29
1.99
15253061--15253124
26
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28
15
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1.96
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44
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153
30
19
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18
92
0
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0
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19
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0
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1.89
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1.9
36
85
5
97
38
2
0
58
1.13
15266745--15266806
18
3.5
18
74
12
65
51
0
8
40
1.31
15268128--15268161
16
2.1
17
88
5
52
73
2
2
20
1.09
15268228--15268619
151
2.6
146
86
9
547
60
8
5
25
1.46
15268568--15268608
17
2.3
18
84
12
50
75
12
0
12
1.05
15270796--15270968
65
2.6
66
80
4
172
19
37
15
27
1.92
15270871--15270966
33
2.9
33
73
14
99
18
35
16
29
1.93
15277511--15277757
128
1.9
128
93
0
422
30
17
18
32
1.95
15284446--15284536
44
2.1
44
87
0
128
47
5
9
37
1.60
15284761--15284803
21
2.0
23
86
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44
2
2
51
1.27
15284755--15284807
23
2.3
25
75
18
60
43
1
3
50
1.30
15286665--15286746
42
2.0
42
82
4
103
47
18
19
14
1.82
15286748--15286815
21
3.2
21
72
12
59
41
13
22
23
1.89
15287322--15287419
49
2.0
49
100
0
196
22
28
6
42
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15288288--15288321
16
2.1
17
89
10
54
35
0
0
64
0.94
15294252--15294414
35
4.7
35
83
4
168
31
11
23
33
1.90
15294256--15294414
70
2.3
69
82
4
185
32
11
23
32
1.90
15301687--15301848
35
4.7
35
85
3
202
30
11
24
33
1.90
15301691--15301848
69
2.3
70
86
1
210
31
11
24
32
1.91
15312126--15312659
266
2.0
266
96
0
987
27
19
22
30
1.98
15313988--15314030
16
2.5
17
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14
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2
0
30
1.03
15326982--15327030
25
2.0
25
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0
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22
18
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1.96
15327916--15328012
42
2.3
42
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0
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1.95
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9
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47
0
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1.51
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2.0
16
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0
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1.90
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5.8
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315
23
19
27
29
1.98
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21
2.0
21
95
0
75
28
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1.92
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2.0
16
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0
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1.90
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2.2
28
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0
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12
17
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1.59
15341585--15341617
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14
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5
50
6
21
0
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1.05
15342238--15342268
16
2.0
16
93
6
55
29
0
0
70
0.87
15345008--15345047
18
2.2
19
95
4
73
32
5
0
62
1.17
15349069--15349315
134
1.8
134
98
0
476
47
12
15
24
1.80
15352404--15352465
24
2.6
24
85
7
81
33
27
16
22
1.95
15355888--15355979
30
3.2
30
65
20
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40
15
7
36
1.76
15355887--15356000
57
2.0
57
100
0
228
40
17
7
35
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15375119--15375173
16
3.4
16
94
0
92
34
7
29
29
1.84
15379038--15379067
14
2.1
15
93
6
53
70
3
0
26
1.03
15398361--15398430
35
2.0
35
88
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106
34
2
5
57
1.37
15398680--15398709
9
3.2
9
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9
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13
0
0
86
0.57
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4
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4
100
0
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76
0
0
23
0.78
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87
2
987
33
21
23
21
1.97
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46
2.1
46
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3
142
33
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0
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1.97
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1.9
135
90
0
403
35
20
24
20
1.96
15411179--15411286
45
2.4
45
87
0
162
31
21
20
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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