Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  260  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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80
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209
25
28
22
23
1.99
84786643--84786846
40
5.1
40
80
8
220
25
28
22
24
1.99
84794767--84794948
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4.6
40
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6
210
26
28
21
23
1.99
84794769--84794948
79
2.3
80
81
7
206
26
28
21
23
1.99
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2.0
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55
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0
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0
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18
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9
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40
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2.7
81
81
2
210
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20
18
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.78
84829226--84829403
81
2.2
81
82
2
214
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1.79
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0
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1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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3.2
17
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7
3
75
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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89
57
2
1
39
1.19
84911153--84911250
20
5.1
20
71
21
75
58
3
2
36
1.25
84911172--84911275
35
3.1
34
86
12
135
58
2
1
36
1.24
84911247--84911310
21
2.9
22
86
11
87
56
1
0
42
1.09
84923664--84923708
15
3.0
15
80
0
54
37
0
0
62
0.96
84923681--84923731
27
2.0
26
88
7
77
33
0
1
64
1.05
84924636--84924701
33
2.0
33
82
8
80
42
36
0
21
1.53
84924631--84924703
20
3.7
20
69
7
58
45
34
0
20
1.52
84924734--84924771
12
2.9
13
84
7
51
50
31
0
18
1.47
84927189--84927323
29
4.4
29
70
14
92
28
11
18
41
1.86
84927085--84927367
93
3.1
91
86
4
401
30
10
14
43
1.80
84927085--84927323
31
7.9
31
66
12
95
29
10
16
43
1.82
84932380--84932815
114
3.8
114
79
2
383
33
22
18
25
1.97
84938968--84939014
21
2.2
22
88
3
69
23
19
36
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84942017--84942073
15
3.7
15
74
9
53
40
0
3
56
1.17
84942083--84942154
24
3.0
24
82
10
76
56
1
1
40
1.16
84942096--84942137
17
2.3
19
88
8
61
57
2
0
40
1.12
84942097--84942156
25
2.5
24
84
12
79
55
1
1
41
1.20
84942865--84942911
17
2.8
17
86
0
58
14
6
4
74
1.17
84942926--84942970
13
3.7
13
80
14
51
22
0
2
75
0.91
84942908--84942968
17
3.5
17
76
14
54
19
1
1
77
0.95
84943007--84943097
21
4.7
20
71
19
84
41
1
1
56
1.14
84943159--84943215
17
3.6
17
71
23
61
49
1
0
49
1.11
84943188--84943228
13
3.1
13
82
6
55
56
0
0
43
0.99
84943317--84943390
12
5.8
12
70
16
51
43
0
2
54
1.14
84943368--84943515
21
7.8
20
67
22
95
57
2
1
39
1.19
84943387--84943492
35
3.1
35
89
6
155
58
2
1
36
1.24
84943456--84943533
22
3.4
22
82
12
95
56
3
0
39
1.18
84943539--84943597
23
2.5
24
78
15
70
74
5
1
18
1.09
84943632--84943668
11
3.5
11
88
3
58
72
0
13
13
1.11
84945127--84945188
30
2.1
30
100
0
124
30
19
30
19
1.96
84945314--84945361
24
2.0
25
91
4
80
22
0
25
52
1.48
84945319--84945374
25
2.3
24
87
3
76
26
1
19
51
1.57
84947553--84947613
15
4.0
15
75
10
52
65
4
0
29
1.13
84954189--84954325
40
3.5
40
90
3
215
23
22
29
24
1.99
84962299--84962435
40
3.5
40
93
3
233
22
23
29
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84964240--84964546
130
2.4
130
81
2
307
26
15
21
36
1.93
84968105--84968150
14
3.2
14
87
3
56
80
19
0
0
0.71
84968118--84968164
9
5.2
9
82
10
51
85
10
0
4
0.74
84968105--84968153
23
2.1
23
88
0
71
81
18
0
0
0.69
84968110--84968164
24
2.2
25
87
3
76
83
12
0
3
0.77
84968126--84968154
15
1.9
15
100
0
58
89
10
0
0
0.48
84970038--84970780
88
8.4
87
82
3
846
32
19
24
23
1.98
84970057--84970820
177
4.3
177
89
1
1104
31
19
25
23
1.98
84970793--84970892
41
2.4
41
86
6
130
34
25
20
21
1.97
84973692--84974009
130
2.5
130
84
2
392
27
17
21
33
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320