Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  261  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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22
14
42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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85110848--85111028
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.98
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0.93
Indices
Period
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A
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(0-2)
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133
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10
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10.3
26
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10
109
59
4
5
30
1.39
85169460--85169511
11
4.9
11
83
9
72
28
28
0
42
1.56
85169454--85169511
20
2.7
21
86
10
82
31
27
0
41
1.56
85169538--85169568
15
2.1
15
93
0
53
22
6
0
70
1.09
85170670--85170696
7
3.9
7
100
0
54
25
0
14
59
1.36
85171722--85172103
116
3.3
116
93
2
644
39
3
8
47
1.52
85175119--85175656
126
4.3
126
88
2
803
27
21
16
33
1.95
85175747--85175776
15
2.0
15
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0
51
46
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0
16
1.47
85175751--85175955
96
2.1
96
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7
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40
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39
1.61
85179163--85179202
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2.0
20
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20
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1.98
85180485--85180569
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18
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1.86
85180473--85180566
36
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36
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6
145
37
14
12
35
1.85
85180755--85180846
44
2.1
44
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4
114
36
21
18
22
1.95
85181971--85182003
5
6.6
5
89
10
50
0
21
0
78
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85181971--85182007
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2.5
15
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16
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0
24
0
75
0.80
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11
2.4
11
100
0
52
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0
0
34
0.93
85187861--85187970
19
5.8
19
73
15
59
61
2
2
32
1.24
85188148--85188186
16
2.4
16
82
0
51
28
20
7
43
1.79
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27
2.0
27
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0
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35
7
1.83
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144
7.1
144
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5
1371
58
7
5
27
1.48
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32
1.9
32
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6
79
16
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18
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1.92
85197518--85197562
22
1.9
22
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2
17
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1.9
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2
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0
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2.1
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0
108
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3
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2.2
17
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0
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10
5.0
10
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70
2
6
22
1.20
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13
2.8
13
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4
58
44
13
0
42
1.43
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2.0
27
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0
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22
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1.97
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10
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2
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1.20
85222407--85222440
18
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17
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5
50
23
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58
1.55
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2.1
91
83
7
232
43
14
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29
1.82
85230240--85230272
17
2.1
16
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11
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30
0
0
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0.88
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2.0
24
88
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73
30
0
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64
1.18
85230637--85230701
28
2.3
28
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71
55
3
0
41
1.15
85231494--85231553
28
2.2
27
85
5
84
30
6
30
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1.83
85236915--85236974
28
2.1
28
87
0
84
33
6
28
31
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85237493--85237749
128
2.0
128
95
0
460
37
15
19
27
1.92
85239624--85239671
22
2.2
22
84
0
60
16
2
12
68
1.29
85239630--85239673
22
2.0
22
90
0
70
20
2
9
68
1.28
85239631--85239680
22
2.4
20
83
6
64
18
2
6
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27
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50
5
4
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162
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2.1
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0
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0
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19
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5
2
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1.39
85269890--85269930
21
2.0
21
85
0
55
31
21
26
19
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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