Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  297  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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27
1.82
Indices
Period
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Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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0
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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1.97
94745570--94745961
40
9.8
40
90
1
615
22
21
29
26
1.99
94747729--94747907
85
2.1
85
98
0
349
37
8
27
26
1.85
94749846--94750091
47
5.1
47
83
8
296
32
11
29
26
1.92
94749846--94750091
94
2.5
94
88
6
332
32
11
29
26
1.92
94750065--94750155
46
2.0
46
86
0
128
34
9
30
25
1.88
94750302--94750521
37
5.9
37
97
0
395
22
18
30
27
1.97
94751880--94751937
30
2.0
30
93
3
100
25
17
24
32
1.96
94755104--94755139
18
2.1
18
89
5
56
66
0
0
33
0.92
94755392--94755486
18
4.7
21
77
12
83
41
16
6
35
1.74
94755392--94755467
22
3.6
22
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16
72
42
17
5
35
1.72
94755428--94755501
19
3.9
19
92
3
132
37
16
9
36
1.81
94755405--94755501
37
2.4
38
88
10
133
39
16
8
36
1.79
94755620--94755659
21
2.0
20
85
5
53
10
2
15
72
1.21
94755865--94756125
45
5.8
45
75
7
242
26
28
16
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94756065--94756515
78
5.8
78
88
2
681
24
23
19
32
1.97
94756471--94757046
220
2.6
220
93
1
949
27
21
17
33
1.96
94762040--94762068
13
2.2
13
100
0
58
20
0
20
58
1.39
94764651--94764687
16
2.3
16
100
0
74
45
24
13
16
1.83
94764870--94765056
40
4.7
40
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6
218
25
26
21
25
2.00
94768783--94768814
5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
94768784--94768814
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
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19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
94772848--94772897
25
2.0
25
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0
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38
22
14
26
1.91
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11
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17
62
35
11
20
33
1.88
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20
3.2
20
97
0
121
33
10
20
35
1.87
94772940--94772992
9
5.4
9
75
16
52
33
7
20
37
1.81
94773048--94773166
23
5.1
23
92
2
202
26
21
21
31
1.98
94773381--94773444
31
2.1
31
93
0
110
37
15
23
23
1.93
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3
10.0
3
92
7
51
68
0
0
31
0.89
94783523--94783548
12
2.2
12
100
0
52
42
15
34
7
1.75
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19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
94786830--94786908
19
4.2
19
90
9
126
35
16
10
37
1.82
94786852--94786908
17
3.5
15
88
11
53
35
15
10
38
1.82
94786830--94786908
36
2.1
39
90
9
128
35
16
10
37
1.82
94787281--94787463
87
2.1
89
84
10
234
26
20
18
33
1.96
94787232--94788245
220
4.6
220
91
1
1557
27
21
17
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94789277--94789332
6
8.8
6
78
18
51
1
10
1
85
0.74
94789283--94789343
8
7.6
8
80
12
56
1
11
1
85
0.75
94789278--94789344
10
6.8
10
77
14
68
1
11
1
85
0.75
94789277--94789344
20
3.4
19
85
6
82
1
11
1
85
0.74
94789283--94789343
28
2.2
28
82
11
72
1
11
1
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29
2.0
29
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61
0
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30
1.26
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24
2.0
24
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2
4
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1.29
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20
24
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1.99
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27
6.6
27
83
3
205
27
14
27
30
1.95
94822332--94822512
82
2.2
81
83
4
231
27
14
27
30
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320