Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  50  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Score
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24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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27
15
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14701692--14701740
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2.8
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18
21
28
1.97
14726626--14726666
20
2.2
20
82
8
50
36
0
2
60
1.10
14726632--14726722
3
30.7
3
69
20
50
31
4
0
63
1.14
14726634--14726753
13
8.9
13
67
21
52
31
5
0
62
1.22
14726684--14726720
14
2.7
14
87
4
58
29
2
0
67
1.04
14727245--14727301
13
4.4
12
74
12
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31
3
5
59
1.36
14737975--14738080
30
3.6
30
87
1
142
33
11
18
35
1.87
14742657--14742724
29
2.3
29
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5
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27
30
13
27
1.94
14742546--14742873
174
1.9
174
96
0
611
31
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14
29
1.94
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1.96
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29
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5
93
27
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13
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1.94
14750690--14751017
174
1.9
174
96
0
611
31
24
14
29
1.94
14750970--14751048
29
2.7
30
82
13
110
29
30
15
25
1.96
14773281--14773310
2
15.0
2
100
0
60
0
0
50
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14775579--14775686
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3.5
30
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37
10
4
47
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42
2.6
42
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5
137
16
25
15
42
1.88
14782748--14782825
5
15.4
5
75
15
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16
3
1
78
0.97
14782764--14782841
25
3.3
26
81
12
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17
5
1
75
1.05
14782749--14782832
29
2.8
29
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5
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17
3
1
77
0.98
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10
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6
4
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2.5
21
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0
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14795764--14795822
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100
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23
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2
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3.0
21
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0
1
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14828797--14828866
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21
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0
1
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1.08
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2.1
15
100
0
64
31
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14828870--14829078
100
2.1
96
81
14
271
36
2
4
55
1.36
14829057--14829091
15
2.3
15
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0
52
40
0
2
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1.14
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0
0
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15
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0
0
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0
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1
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0
0
37
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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