Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  254  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Number
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Score
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133
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27
1.98
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19
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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3.6
21
77
14
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58
2
1
37
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82905295--82905381
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4.0
21
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11
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58
2
1
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5
6
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1.25
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0
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9
0.90
82906178--82906207
8
3.6
8
91
8
51
80
0
10
10
0.92
82908918--82908962
14
3.4
14
76
17
60
51
0
0
48
1.00
82908909--82908976
25
2.7
25
93
0
91
48
4
0
47
1.22
82908924--82908974
6
8.5
6
79
16
52
50
0
0
49
1.00
82909086--82909140
18
3.0
17
86
10
65
25
1
3
69
1.15
82909098--82909162
30
2.2
29
81
10
71
29
3
3
64
1.23
82916089--82916134
23
2.0
24
86
4
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32
4
2
60
1.28
82921915--82922001
33
2.6
33
90
0
138
33
18
10
37
1.85
82921987--82922063
32
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32
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4
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38
23
11
25
1.89
82923706--82923755
22
2.3
22
96
0
91
38
8
20
34
1.82
82940891--82940938
25
1.9
25
83
8
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56
4
16
22
1.58
82955091--82955137
23
2.0
23
84
12
60
27
2
0
70
0.99
82955190--82955236
24
2.0
24
82
0
58
40
4
0
55
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82962162--82962205
23
2.0
23
90
4
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25
9
27
38
1.86
82965231--82965260
15
2.0
15
93
0
51
30
6
0
63
1.20
82965461--82965516
24
2.3
24
85
11
71
51
0
8
39
1.33
82965449--82965523
30
2.6
30
75
10
75
56
0
8
36
1.29
82973083--82973230
43
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44
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15
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1.94
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12
100
0
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0
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0
0
58
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2.1
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0
4
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1.22
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2
0
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1.13
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2.0
21
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23
0
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1.9
24
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1.86
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2.5
28
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1
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1.39
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21
3.0
21
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4
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15
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18
1.90
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2.3
42
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3
2
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1.28
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5
0
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1.24
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5.7
15
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17
10
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17
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17
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50
38
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26
1.89
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21
1.9
22
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58
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2
7
1.38
83043536--83043569
18
1.9
18
88
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38
0
0
61
0.96
83045502--83045545
22
2.0
21
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12
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4
2
34
1.30
83045731--83045783
27
2.0
25
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60
1
1
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83048423--83048480
26
2.2
26
93
0
98
36
24
5
34
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83051612--83051650
21
1.9
20
89
5
60
33
0
20
46
1.51
83063875--83063932
21
2.7
22
76
7
66
25
34
22
17
1.96
83065232--83065287
30
1.9
29
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78
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7
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2
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2
100
0
100
0
0
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50
1.00
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2.0
20
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57
2
0
39
1.12
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2.1
17
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0
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23
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2
65
1.22
83078611--83078652
12
3.6
11
82
17
50
28
2
0
69
1.01

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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