Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  286  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
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2.2
226
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
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0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
91954120--91954163
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0
0
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2
0
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1
19
1.57
91965810--91965875
28
2.4
28
78
0
78
43
34
0
21
1.53
91965812--91965860
21
2.3
21
80
16
57
48
28
0
22
1.50
91965825--91965886
28
2.2
28
82
0
70
45
33
0
20
1.52
91967359--91967418
25
2.4
25
91
0
93
8
1
28
61
1.34
91967552--91967655
42
2.5
42
82
1
118
28
17
23
30
1.97
91971542--91971566
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
91971560--91971600
22
1.9
22
90
5
66
60
2
12
24
1.43
91971556--91971610
21
2.5
22
79
2
67
61
1
9
27
1.36
91972392--91972509
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2.2
55
95
1
211
52
5
21
20
1.67
91972897--91972929
14
2.4
14
100
0
66
81
0
18
0
0.68
91975381--91975506
38
3.2
38
69
14
103
30
19
15
34
1.94
91975430--91975640
86
2.5
86
91
0
343
33
23
13
30
1.93
91976952--91977160
90
2.4
83
82
10
217
35
19
15
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91977031--91977299
139
1.9
141
85
6
375
36
19
15
28
1.93
91977174--91977468
86
3.4
85
84
6
346
33
18
17
29
1.95
91976945--91977379
225
1.9
222
82
11
537
35
19
16
28
1.94
92003034--92003090
27
2.1
27
83
6
71
36
0
1
61
1.07
92003174--92003211
15
2.4
16
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8
51
57
7
5
28
1.49
92005780--92005818
18
2.2
17
86
13
53
33
0
20
46
1.51
92006044--92006141
23
4.3
23
90
2
162
20
21
26
31
1.98
92006046--92006134
45
2.0
45
95
0
160
19
22
26
31
1.97
92009674--92009726
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2.2
25
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6
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28
28
0
43
1.55
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2.1
34
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0
79
18
7
28
46
1.75
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34
2.0
35
82
2
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16
10
29
44
1.80
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93
3.9
94
78
8
350
29
21
27
21
1.99
92012251--92012613
47
7.7
47
74
11
221
29
21
27
22
1.99
92012303--92012611
47
6.5
47
77
9
227
29
21
26
22
1.99
92013375--92013481
55
1.9
56
88
1
162
20
22
32
24
1.98
92013376--92013494
55
2.1
56
84
4
152
21
23
31
23
1.99
92015672--92015714
23
2.0
21
86
9
59
65
6
0
27
1.18
92015955--92015995
17
2.5
17
88
4
57
65
4
4
24
1.32
92018012--92018150
53
2.6
53
83
3
179
25
19
21
33
1.97
92022773--92022983
54
3.9
54
86
0
242
20
29
24
25
1.99
92022949--92023061
39
2.9
39
93
0
181
16
30
28
24
1.97
92025281--92025540
129
2.0
129
96
0
475
48
9
8
34
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92025409--92025786
206
1.8
206
97
0
711
42
7
11
38
1.69
92026649--92028394
874
2.0
873
93
0
2981
31
16
20
31
1.95
92034730--92034907
53
3.3
54
82
7
218
28
22
16
32
1.96
92036764--92036939
46
3.8
45
85
7
230
22
31
19
26
1.98
92036764--92036939
94
1.9
92
87
9
259
22
31
19
26
1.98
92038140--92038164
13
1.9
13
100
0
50
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0
56
1.29
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7
4.3
7
91
8
51
34
0
0
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13
100
0
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0
0
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108
2.0
108
98
0
418
39
18
19
22
1.92
92050203--92050237
16
2.2
16
89
0
52
34
0
2
62
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320