Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  216  of  320  ( 38372 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72265964--72266236
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1.99
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2.4
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79
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1.99
72305488--72305651
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78
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5
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2.00
72313319--72313502
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24
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26
16
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.77
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2.0
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84
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22
5
35
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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26
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1.31
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10
3.5
10
84
8
52
35
0
2
61
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72477429--72477531
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0
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0
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35
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72503732--72503758
8
3.4
8
100
0
54
74
0
0
25
0.83
72514515--72514571
6
9.5
6
100
0
114
49
0
33
17
1.47
72516230--72516287
24
2.5
24
75
8
57
18
22
15
43
1.88
72519099--72519194
40
2.4
39
79
6
95
31
27
11
30
1.91
72523064--72523131
29
2.3
29
85
5
93
27
30
13
27
1.94
72523239--72523311
29
2.5
30
84
13
107
28
28
15
27
1.96
72525816--72525895
33
2.5
33
79
2
90
52
8
1
37
1.41
72527136--72527226
42
2.2
42
95
0
164
30
35
20
13
1.91
72527136--72527242
42
2.5
42
90
0
151
31
36
19
12
1.89
72529146--72529194
24
2.1
23
88
3
71
10
0
22
67
1.20
72530887--72530917
16
1.9
16
100
0
62
29
19
12
38
1.89
72534379--72534431
27
2.0
27
88
7
81
45
11
5
37
1.64
72535334--72535631
152
2.0
153
82
7
365
41
11
5
41
1.63
72540174--72540242
34
2.0
34
100
0
138
39
8
20
31
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72543817--72543879
31
2.1
31
90
3
101
42
9
9
38
1.70
72548537--72548590
26
2.1
26
100
0
108
18
35
7
38
1.79
72562554--72562671
51
2.3
51
91
0
182
33
15
22
28
1.95
72564126--72564172
24
1.9
25
86
4
69
53
4
10
31
1.55
72564119--72564179
25
2.4
26
81
10
72
52
3
13
31
1.56
72564213--72564259
21
2.1
22
84
7
60
48
0
4
46
1.21
72566337--72566451
23
4.9
23
70
12
90
17
29
21
31
1.96
72566417--72566464
23
2.0
23
84
4
60
18
22
25
33
1.97
72566837--72567018
46
4.0
46
89
1
240
40
14
23
21
1.90
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19
2.4
21
80
13
66
57
6
0
36
1.24
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23
2.3
22
83
12
61
50
9
3
35
1.54
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14
2.1
14
100
0
58
27
6
58
6
1.50
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160
4.2
161
81
9
728
34
19
16
29
1.94
72573038--72573173
71
1.9
72
89
3
211
30
22
15
31
1.95
72573264--72573293
14
2.1
14
100
0
60
60
6
13
20
1.55
72573102--72573445
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3.9
87
85
6
421
38
20
15
26
1.92
72585943--72585991
19
2.4
21
76
13
57
55
6
2
36
1.37
72586063--72586092
15
1.9
16
93
6
53
56
6
3
33
1.42
72586042--72586090
23
2.2
22
82
13
57
51
10
4
34
1.55
72586217--72586278
28
2.2
28
97
0
115
61
3
4
30
1.33
72587158--72587226
33
2.0
34
83
10
88
21
2
8
66
1.32
72587562--72587591
15
2.0
15
100
0
60
26
6
60
6
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72588506--72588613
37
2.8
38
78
12
114
35
23
15
25
1.94
72591305--72591368
30
2.1
30
82
0
74
34
23
6
35
1.80
72592004--72592357
178
2.0
179
95
0
638
36
18
11
33
1.87
72601270--72601302
10
3.2
11
87
12
52
60
9
0
30
1.27
72606786--72606827
7
6.0
7
97
0
75
14
26
0
59
1.35
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220
2.0
220
99
0
871
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1.84
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29
2.1
29
100
0
122
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39
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1
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1.23
72622802--72622846
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3.4
13
81
6
63
60
0
0
40
0.97
72622796--72622847
16
3.5
16
68
26
51
57
0
0
42
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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