Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103038859

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   

This is table  21  of  320  ( 38372 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5969555--5969652
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2.3
43
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2.2
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1.9
22
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0
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2.0
22
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22
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7
64
41
17
5
36
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6050123--6050177
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19
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10
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10
81
0
51
27
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2
62
1.35
6057868--6057917
20
2.5
20
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6
57
28
8
2
62
1.35
6058615--6058704
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2.2
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81
15
94
28
12
3
55
1.52
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2.0
49
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20
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2
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97
1.9
95
87
4
269
28
14
26
30
1.95
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14
3.2
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12
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73
0
0
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24
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16
1.95
6086071--6086121
26
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27
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70
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19
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1.88
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20
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19
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1
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2.5
24
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10
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62
0
1
35
1.05
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2.7
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3
0
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2.0
56
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10
100
0
56
60
0
0
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18
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35
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14
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0
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42
0
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140
44
2
11
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1.9
33
84
9
85
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3
3
25
1.18
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56
2.4
56
91
0
227
29
14
24
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
16
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0
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6
12
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1.69
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11
2.7
11
94
5
51
55
6
0
37
1.27
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5.0
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19
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5
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1.55
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5
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5
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81
0
18
0
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3.0
75
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32
21
16
30
1.95
6129475--6129634
73
2.2
72
86
3
223
38
21
14
25
1.91
6129324--6129620
160
1.8
161
88
2
454
34
22
15
27
1.94
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6.7
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70
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163
28
20
27
23
1.99
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27
2.9
28
74
17
80
41
29
3
24
1.72
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1.9
18
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52
32
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0
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0
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26
34
1.85
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10
3.3
10
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8
50
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1.51
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18
2.0
17
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52
11
2
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6
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16
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14
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28
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0
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14
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2.3
18
86
4
55
45
0
5
50
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6197487--6197531
20
2.3
20
84
3
56
48
0
2
48
1.13
6197505--6197564
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3.0
20
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7
59
58
0
5
36
1.20
6198938--6198989
16
3.1
16
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50
61
3
0
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1.14
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2.4
14
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8
11
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1.72
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39
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0
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14
1.92
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11
2.8
12
90
9
50
40
0
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28
1.57
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25
100
0
100
52
12
12
24
1.72
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2.0
29
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3
100
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13
10
20
1.66
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31
2.3
31
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1
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0
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0
0
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3.5
15
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15
53
38
10
15
35
1.82
6218322--6218400
36
2.1
38
90
9
126
37
10
16
35
1.82
6218322--6218400
19
4.2
19
90
9
126
37
10
16
35
1.82
6221479--6221503
12
2.1
12
100
0
50
76
0
24
0
0.80
6224054--6224083
6
5.0
6
100
0
60
83
0
0
16
0.65
6224938--6225306
175
2.1
175
92
1
614
30
18
24
27
1.98
6224943--6225416
132
3.6
132
88
2
607
31
17
23
26
1.97
6224938--6225388
44
10.3
44
75
8
366
31
17
23
27
1.97
6225250--6225416
88
1.9
87
82
6
212
35
16
21
26
1.95
6225378--6226324
206
4.6
205
94
0
1529
30
18
22
28
1.97
6226712--6226809
19
5.2
19
92
7
164
37
10
16
35
1.82
6226702--6226809
36
2.9
35
78
20
112
37
10
15
36
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6231216--6231270
29
1.9
28
82
10
67
50
0
1
47
1.11
6234031--6234059
5
6.0
5
92
8
51
20
0
0
79
0.74
6235382--6235419
13
2.8
14
84
8
51
23
2
5
68
1.23
6237880--6237961
41
2.0
41
85
0
110
25
29
21
23
1.99
6240775--6240811
19
2.0
20
89
10
60
35
0
5
59
1.20
6241836--6241885
20
2.5
20
78
15
57
52
10
10
28
1.67
6243798--6243853
28
2.0
28
100
0
112
57
14
7
21
1.61
6250245--6250386
27
5.3
26
80
4
113
36
21
23
18
1.95
6252003--6252112
26
4.2
26
96
0
184
35
24
5
34
1.79
6256732--6256792
16
3.7
17
70
27
51
36
1
1
60
1.16
6260494--6260586
40
2.3
40
98
0
177
44
21
6
27
1.77
6262791--6262828
20
2.0
20
89
5
60
39
15
10
34
1.82
6265822--6265881
17
3.5
17
74
21
63
65
0
1
33
1.03
6266364--6266535
18
9.6
18
89
5
260
36
15
11
37
1.82
6266364--6266535
35
4.8
36
92
4
251
36
15
11
37
1.82
6266364--6266535
53
3.2
53
94
3
283
36
15
11
37
1.82
6266367--6266535
88
1.9
89
95
3
295
37
14
11
36
1.82
6267311--6267922
83
7.4
83
95
0
1073
26
21
19
32
1.97
6267858--6267986
64
2.0
64
98
0
249
21
20
20
37
1.94
6268043--6268222
44
4.1
44
78
8
213
27
26
16
30
1.97
6268050--6268217
88
1.9
87
86
3
239
27
26
17
28
1.97
6269130--6269225
6
16.8
6
74
15
80
2
14
0
83
0.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6269131--6269223
5
18.8
5
77
12
70
2
15
0
82
0.76
6269130--6269225
11
8.4
11
76
10
86
2
14
0
83
0.74
6275413--6275554
35
4.0
35
95
4
241
35
14
11
38
1.82
6279887--6279929
3
14.3
3
100
0
86
32
0
0
67
0.91
6279982--6280020
17
2.4
16
86
4
51
28
0
5
66
1.12
6279991--6280024
11
3.2
11
91
4
52
26
0
5
67
1.13
6280060--6280109
26
1.9
26
87
0
73
32
2
4
62
1.25
6283735--6283773
10
3.8
10
86
6
60
74
7
5
12
1.20
6283735--6283772
11
3.5
11
85
7
60
76
7
5
10
1.15
6289797--6289895
28
3.5
29
86
9
125
27
15
28
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320