Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  10  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2986921--2986994
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3.7
19
82
3
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38
8
0
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1.32
2987370--2987441
37
1.9
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97
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0
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0
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1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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19
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23
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8
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7
2
60
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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55
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2
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1.11
3121938--3122062
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3.2
39
95
3
225
36
2
0
61
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3121957--3122010
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1.9
28
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0
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1.14
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21
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0
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37
2
0
60
1.11
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2.8
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14
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40
1
3
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0
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20
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21
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15
22
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15
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0
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19
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31
86
3
84
45
1
22
30
1.62
3149303--3149338
18
2.1
18
90
10
58
36
5
5
52
1.48
3152650--3152701
20
2.7
20
77
11
63
38
5
3
51
1.44
3152706--3152769
19
3.5
18
85
12
78
37
3
0
59
1.13
3158911--3158976
31
2.1
31
85
2
87
24
4
7
63
1.40
3159913--3159954
20
2.0
21
86
9
59
50
4
0
45
1.23
3160729--3160894
91
1.8
91
86
2
244
22
13
19
43
1.86
3160796--3161180
106
3.8
100
79
7
418
26
11
20
40
1.87
3161131--3161236
56
1.9
56
88
3
160
24
9
22
43
1.83
3161032--3161319
156
1.8
155
82
3
362
28
10
19
41
1.85
3166976--3167002
13
2.1
13
100
0
54
37
0
14
48
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3179703--3179742
20
2.0
20
90
0
62
30
0
0
70
0.88
3180039--3180130
39
2.4
37
85
7
114
57
2
0
40
1.11
3183450--3183502
18
2.9
18
91
0
79
35
26
15
22
1.93
3183449--3183506
9
6.4
9
75
0
62
37
24
13
24
1.91
3183621--3183824
107
1.9
107
98
0
399
25
4
22
47
1.71
3184611--3184675
3
21.7
3
82
0
58
33
23
38
4
1.75
3184764--3184838
12
6.2
12
82
0
69
30
21
37
10
1.87
3184793--3184837
6
7.5
6
92
0
63
31
22
35
11
1.89
3184787--3184838
18
2.9
18
85
0
68
28
25
36
9
1.87
3185835--3185859
11
2.3
11
100
0
50
92
8
0
0
0.40
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3
11.7
3
100
0
70
34
0
31
34
1.58
3193080--3193256
61
2.9
59
80
9
187
48
14
15
22
1.81
3193097--3193198
31
3.3
31
70
21
81
45
14
14
25
1.83
3198991--3199018
14
2.0
14
100
0
56
42
14
7
35
1.73
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2
16.0
2
100
0
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0
50
0
50
1.00
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11
3.5
11
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14
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48
0
0
51
1.00
3221157--3221187
9
3.4
9
90
0
53
38
22
12
25
1.90
3222945--3223028
31
2.8
29
75
10
80
35
11
14
38
1.83
3226579--3226671
48
1.9
48
87
8
136
40
25
12
20
1.88
3227959--3227994
18
2.0
19
89
10
58
27
0
0
72
0.85
3235189--3235215
4
6.8
4
100
0
54
77
0
0
22
0.76
3236007--3236045
20
1.9
21
85
15
55
74
2
10
12
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3236149--3236182
16
2.1
16
94
0
59
35
17
20
26
1.95
3238228--3238257
10
3.0
10
90
0
51
36
0
13
50
1.42
3246837--3246873
19
1.9
20
94
5
67
70
0
0
29
0.88
3247471--3247553
28
2.9
28
73
22
91
30
0
6
63
1.18
3247481--3247552
19
3.8
19
74
9
58
30
0
5
63
1.17
3247518--3247552
18
1.9
18
88
0
52
31
0
5
62
1.18
3247482--3247575
29
3.3
28
77
14
95
32
1
7
58
1.33
3247492--3247636
19
7.5
19
70
13
75
32
1
4
61
1.26
3247587--3247636
18
2.5
20
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9
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28
2
0
70
0.99
3247768--3247817
7
6.9
7
88
8
73
32
0
0
68
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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