Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  19  of  316  ( 37835 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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60
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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21
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5
0
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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58
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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28
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0
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0
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18
90
5
58
51
2
0
45
1.15
5935055--5935133
22
3.7
21
67
11
52
45
27
1
25
1.61
5935306--5935353
23
2.1
22
85
11
62
27
0
22
50
1.50
5935394--5935717
41
7.9
41
91
2
438
20
23
22
33
1.97
5935748--5935773
12
2.2
12
100
0
52
46
30
15
7
1.74
5936519--5936807
84
3.3
86
81
8
253
39
16
9
34
1.81
5936560--5936827
84
3.1
85
82
9
319
38
19
8
33
1.82
5937036--5937266
87
2.6
87
86
4
293
35
9
18
36
1.84
5937059--5937318
87
2.9
88
83
5
258
34
10
16
39
1.82
5939098--5939155
26
2.1
28
81
6
66
55
5
8
31
1.52
5939681--5939710
12
2.5
12
94
0
51
56
0
6
36
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5939822--5939860
3
13.0
3
100
0
78
66
0
0
33
0.92
5941744--5941858
57
2.0
57
98
0
221
36
16
13
33
1.88
5942140--5942169
13
2.3
13
94
0
51
66
10
13
10
1.44
5941765--5942574
284
2.8
285
88
4
1143
38
18
14
28
1.91
5941765--5942507
141
5.3
141
90
2
1102
37
19
14
27
1.91
5942424--5942453
13
2.3
13
94
0
51
66
10
13
10
1.44
5943437--5943472
8
4.6
8
86
6
56
0
13
0
86
0.58
5943437--5943471
7
4.7
7
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10
52
0
14
0
85
0.59
5943437--5943471
15
2.3
15
95
0
61
0
14
0
85
0.59
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26
2.1
28
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6
66
55
5
8
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1.52
5955491--5955517
3
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3
100
0
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0
0
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0.92
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2.5
15
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4
58
32
0
0
67
0.91
5965333--5965509
50
3.5
49
91
3
273
36
15
22
26
1.93
5965485--5965594
31
3.5
31
91
0
175
28
20
28
23
1.99
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47
2.7
46
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2
149
28
14
27
29
1.95
5965721--5965835
42
2.7
42
81
9
144
32
14
25
27
1.95
5973135--5973252
47
2.5
46
80
4
139
33
21
18
26
1.96
5973135--5973269
46
2.9
46
82
3
155
33
18
22
25
1.97
5973651--5974015
44
8.2
44
68
12
131
29
16
22
31
1.96
5973714--5973950
44
5.4
44
73
5
147
28
20
20
30
1.97
5973668--5974004
89
3.8
89
71
8
265
28
17
21
31
1.97
5973743--5974072
176
1.9
176
87
0
480
29
19
20
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5974273--5974409
44
3.1
44
76
8
143
33
18
19
27
1.96
5974618--5974652
12
2.8
12
95
4
61
77
14
0
8
0.99
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15
2.1
15
93
6
53
36
0
0
63
0.95
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42
2.0
42
100
0
170
36
11
16
35
1.85
5982075--5982112
19
2.0
19
85
10
51
31
2
0
65
1.06
5983751--5983785
8
4.4
8
100
0
70
0
25
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11
1.28
5984314--5984367
15
3.3
17
80
16
53
35
0
5
59
1.21
5984322--5984368
18
2.7
18
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3
51
31
0
4
63
1.13
5984366--5984417
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5
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1.30
5984384--5984488
27
4.0
26
80
14
103
33
2
0
62
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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