Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  294  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97111946--97112068
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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19
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36
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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26
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0
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0
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0
0
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2
0
41
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97223965--97224032
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18
110
30
3
0
64
1.17
97235593--97235667
26
3.0
23
81
11
71
33
2
1
62
1.17
97235691--97235741
26
1.9
27
88
4
77
29
7
0
62
1.23
97235807--97235842
17
2.1
17
94
5
63
13
5
5
75
1.17
97236064--97236183
50
2.5
48
78
16
124
32
8
0
58
1.34
97236222--97236252
11
2.7
11
95
5
53
38
0
6
54
1.26
97241068--97241132
32
2.0
32
96
0
121
26
21
16
35
1.95
97248181--97248210
11
2.7
11
100
0
60
63
0
20
16
1.31
97249305--97249389
38
2.4
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12
93
65
5
3
24
1.31
97249310--97249415
36
2.9
34
78
10
95
63
6
4
25
1.39
97254037--97254076
3
13.0
3
94
5
71
67
0
0
32
0.91
97254478--97254525
3
16.0
3
82
8
62
64
2
0
33
1.05
97254621--97254849
3
74.7
3
73
15
107
62
2
7
27
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97260682--97260719
12
3.2
12
88
7
60
36
0
0
63
0.95
97260685--97260720
11
3.2
11
92
4
54
38
0
0
61
0.96
97260834--97260898
30
2.2
30
94
0
112
60
15
1
23
1.44
97260928--97260970
22
2.0
22
85
0
59
55
9
11
23
1.64
97265838--97265882
24
1.9
23
82
13
56
33
4
0
62
1.15
97265902--97265957
20
2.7
20
83
5
67
30
3
7
58
1.42
97270399--97270442
22
2.0
22
86
13
63
52
6
4
36
1.49
97270907--97270967
19
3.3
19
93
6
108
37
8
16
37
1.78
97278095--97278201
26
4.2
26
91
2
180
32
7
24
35
1.83
97278095--97278201
51
2.1
52
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1
189
32
7
24
35
1.83
97281782--97282527
205
3.7
205
94
1
1279
31
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21
28
1.97
97283155--97283248
19
5.2
19
80
15
110
38
7
17
37
1.77
97283205--97283230
5
5.2
5
100
0
52
38
0
23
38
1.55
97283155--97283248
36
2.6
37
79
16
108
38
7
17
37
1.77
97287057--97287118
14
4.1
14
80
12
61
37
4
1
56
1.30
97287056--97287103
14
3.4
14
85
5
62
37
6
0
56
1.25
97289232--97289280
18
2.7
18
87
6
73
59
6
0
34
1.22
97291022--97291055
16
2.1
17
88
5
52
41
0
0
58
0.98
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21
3.2
19
80
15
72
31
0
3
65
1.09
97292117--97292152
19
1.9
18
88
5
54
47
0
0
52
1.00
97294471--97294511
20
2.0
20
100
0
82
29
12
14
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97298662--97298705
19
2.4
18
85
7
54
20
6
0
72
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97300010--97300666
326
2.0
326
97
0
1251
26
22
15
34
1.95
97316740--97316777
17
2.2
17
86
9
51
68
0
31
0
0.90
97320234--97320270
17
2.2
17
100
0
74
27
5
10
56
1.55
97320785--97321094
169
1.8
167
93
4
543
28
18
19
33
1.95
97321104--97321170
30
2.2
30
89
0
107
25
32
26
14
1.95
97321752--97321821
7
10.1
7
70
25
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22
1
2
72
1.05
97321750--97321809
22
2.7
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25
1
1
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1
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22
2
3
71
1.14
97321725--97321826
30
3.3
29
73
20
82
21
2
3
71
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316