Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  90  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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137
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529
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206
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27410960--27411679
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14
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10
43
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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5
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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17
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16
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13
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18
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63
0
36
0
0.95
27451877--27451918
16
2.5
17
78
14
52
80
14
4
0
0.86
27452065--27452095
14
2.2
14
94
0
53
80
0
19
0
0.71
27452078--27452127
9
5.4
9
81
13
57
76
0
24
0
0.80
27452065--27452127
20
3.2
19
78
13
65
77
0
22
0
0.76
27452254--27452303
17
2.9
17
88
8
66
30
0
0
70
0.88
27452444--27452611
35
4.8
34
74
12
110
32
13
8
45
1.75
27452467--27452519
16
3.2
16
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10
54
35
13
9
41
1.76
27452456--27452950
17
28.8
17
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14
205
33
11
10
44
1.76
27452510--27452641
38
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10
104
32
12
9
44
1.76
27452512--27452683
73
2.4
73
81
3
177
36
12
8
42
1.74
27452623--27452704
35
2.4
34
83
6
101
35
13
8
42
1.75
27452664--27452949
16
17.2
16
68
14
91
32
10
11
44
1.76
27453715--27453892
7
24.9
7
69
13
67
42
34
0
21
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27455763--27455790
8
3.5
8
100
0
56
46
0
14
39
1.44
27469317--27469447
35
3.6
35
78
11
138
33
23
11
31
1.90
27472328--27472368
6
6.5
6
83
10
55
78
4
0
17
0.93
27472331--27472369
20
2.0
20
89
0
60
76
5
0
17
0.96
27472717--27472767
17
3.1
17
66
11
52
15
39
27
17
1.90
27475664--27475711
21
2.2
22
92
7
89
29
12
16
41
1.85
27475727--27475758
14
2.3
14
100
0
64
34
0
31
34
1.58
27477043--27477182
42
3.4
42
80
3
131
40
20
16
23
1.91
27478748--27478777
5
5.8
5
92
7
51
80
0
0
20
0.72
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0
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0
0
66
0.92
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2.0
31
100
0
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0
26
16
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35
2.8
35
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4
128
42
17
10
30
1.82
27486744--27486823
35
2.3
35
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4
90
45
16
11
27
1.81
27488524--27488561
12
3.0
13
84
7
51
36
0
0
63
0.95
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24
2.0
24
87
4
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74
0
10
14
1.07
27501208--27501375
84
2.0
84
100
0
336
23
21
21
33
1.97
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146
2.4
147
82
4
411
37
14
10
36
1.81
27509690--27509736
23
2.0
23
95
0
85
36
19
14
29
1.92
27519840--27519924
28
2.9
29
77
13
86
47
15
1
36
1.53
27528478--27528542
30
2.2
28
78
5
76
76
1
10
10
1.08
27528873--27529179
149
2.0
151
94
1
537
26
15
16
41
1.88
27531799--27531828
6
5.0
6
100
0
60
66
0
16
16
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27531975--27532062
26
3.4
26
95
3
151
40
12
17
29
1.86
27532502--27532608
53
2.0
53
98
0
205
21
12
16
49
1.78
27535042--27535105
30
2.1
30
97
0
119
23
34
26
15
1.95
27536184--27536230
15
3.3
13
88
11
58
25
2
0
72
0.96
27536622--27536661
20
2.0
20
85
9
55
27
12
12
47
1.77
27545308--27545632
39
8.3
39
93
2
426
19
21
28
29
1.98
27549650--27549774
51
2.5
51
81
5
146
28
28
16
28
1.97
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3.5
51
79
2
153
28
26
18
26
1.98
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50
2.8
51
83
1
180
28
27
19
24
1.99
27549745--27549915
50
3.4
50
81
2
144
30
27
18
23
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316