Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  293  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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96902411--96902440
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2.5
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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3.3
43
72
12
143
26
15
20
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97015178--97015828
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7.6
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7
351
22
22
22
32
1.98
97015636--97015780
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3.3
42
70
15
116
24
17
20
37
1.94
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2.0
44
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19
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22
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1.97
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179
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691
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21
22
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1.98
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0
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15
16
29
1.90
97022553--97022589
19
2.0
18
94
5
65
64
0
2
32
1.07
97022580--97022697
62
1.9
63
84
8
163
61
5
5
27
1.40
97022975--97023010
18
2.0
18
88
0
54
16
2
58
22
1.51
97022989--97023063
39
1.9
39
94
0
132
17
1
54
26
1.51
97023032--97023094
29
2.2
29
88
5
92
19
1
47
31
1.59
97032674--97032710
16
2.4
16
90
4
58
62
0
0
37
0.96
97034055--97034111
26
2.1
27
90
3
89
47
8
19
24
1.77
97041879--97042074
98
2.0
98
95
0
356
44
6
21
26
1.77
97056882--97056916
18
1.9
18
94
0
61
48
0
14
37
1.44
97060323--97060370
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
97062698--97062722
12
2.1
12
100
0
50
52
0
16
32
1.44
97063153--97063195
21
2.0
21
100
0
86
44
0
18
37
1.50
97063157--97063202
21
2.2
21
92
0
74
43
2
19
34
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97069260--97069300
21
2.0
21
85
9
57
41
2
2
53
1.27
97070083--97070277
94
2.1
94
83
5
243
44
3
7
44
1.48
97070406--97070473
33
2.0
34
82
2
84
45
0
1
52
1.09
97070822--97070849
2
14.0
2
100
0
56
50
0
50
0
1.00
97087816--97087857
17
2.7
15
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20
50
69
4
2
23
1.20
97088013--97088051
12
3.2
12
85
0
60
76
0
7
15
0.99
97088013--97088056
18
2.4
18
92
3
70
75
0
6
18
1.02
97088013--97088056
6
7.2
6
86
2
52
75
0
6
18
1.02
97088155--97088193
20
2.0
20
85
10
53
64
2
2
30
1.21
97088493--97088546
26
2.1
26
100
0
108
68
0
7
24
1.15
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24
2.6
25
80
14
78
54
1
1
41
1.19
97102961--97103021
22
2.7
22
80
16
72
37
0
1
60
1.07
97102965--97103033
35
1.9
37
85
5
97
42
0
2
55
1.15
97103367--97103396
11
2.7
11
100
0
60
43
0
16
40
1.48
97108877--97108930
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1.9
28
92
0
90
12
16
20
50
1.78
97109016--97109069
27
2.0
27
100
0
108
22
7
25
44
1.79
97109019--97109076
27
2.1
27
93
0
98
27
6
25
39
1.81
97111192--97111250
26
2.3
26
87
0
82
20
5
18
55
1.61
97111187--97111250
13
5.0
13
84
1
67
18
6
18
56
1.62
97111233--97111368
9
14.7
9
72
17
91
29
2
12
55
1.48
97111202--97111384
13
15.0
13
65
21
67
27
2
14
55
1.52
97111255--97111314
20
3.0
20
74
13
59
30
5
11
53
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97111233--97111368
37
3.7
36
81
10
132
29
2
12
55
1.48
97111234--97111311
38
2.0
38
90
7
120
29
3
14
52
1.59
97111509--97111605
9
10.4
9
73
14
63
25
3
16
54
1.56
97111509--97111644
37
3.7
34
80
16
146
25
4
16
54
1.60
97111564--97111626
19
3.4
19
71
20
60
25
4
14
55
1.58
97111786--97111882
37
2.6
37
90
0
158
27
2
13
56
1.48
97111786--97111896
9
11.8
9
69
15
55
27
2
13
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1.50
97111219--97111881
276
2.4
273
88
4
970
25
6
18
49
1.71
97111867--97112072
20
10.3
19
83
15
151
21
1
20
55
1.51
97111869--97111960
25
3.5
28
80
18
101
19
3
18
58
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316