Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  29  of  316  ( 37835 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8334415--8334507
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.0
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4
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2.0
21
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1
51
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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65
73
0
2
24
0.95
8533858--8533893
9
3.9
9
89
7
54
77
0
2
19
0.88
8533843--8533900
5
11.0
5
77
22
57
75
0
1
22
0.89
8537954--8537997
22
2.0
22
95
0
79
36
22
6
34
1.81
8547036--8547183
40
3.6
41
73
5
129
27
18
29
24
1.98
8557462--8557548
39
2.2
39
87
4
122
21
22
26
28
1.99
8557592--8557710
59
2.0
59
100
0
238
34
13
15
36
1.86
8565671--8565796
39
3.2
39
93
0
207
22
23
26
27
1.99
8567790--8567960
75
2.4
74
82
7
199
33
23
11
32
1.90
8567794--8567960
35
4.6
35
83
7
174
33
23
10
31
1.89
8571831--8571961
35
3.6
35
78
13
140
34
24
9
31
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8581686--8581714
12
2.3
13
94
5
51
75
0
0
24
0.80
8584731--8584878
74
2.0
74
95
0
269
41
14
9
33
1.79
8601528--8601595
10
6.5
11
74
5
52
30
4
1
63
1.23
8601537--8601604
32
2.1
32
86
5
93
32
5
1
60
1.30
8601571--8601666
39
2.5
37
83
11
104
35
6
0
58
1.23
8601633--8601672
21
1.9
21
84
0
53
40
5
2
52
1.37
8609317--8609498
75
2.4
73
82
7
213
25
22
23
28
1.99
8610173--8610225
22
2.4
22
93
0
88
30
52
3
13
1.57
8610500--8610553
26
2.1
25
86
10
74
9
5
3
81
0.97
8610496--8610553
13
4.5
13
72
20
50
8
6
3
81
0.98
8610496--8610541
19
2.4
19
77
3
56
8
6
4
80
1.01
8611524--8611575
20
2.7
19
82
11
54
23
13
3
59
1.50
8611872--8611902
15
2.1
15
100
0
62
32
6
0
61
1.21
8611985--8612038
3
18.3
3
78
3
56
29
5
0
64
1.16
8612884--8612952
25
2.8
25
95
2
122
49
2
14
33
1.58
8614104--8614158
26
2.1
26
100
0
110
30
10
14
43
1.80
8618233--8618299
26
2.6
25
80
2
80
55
1
5
37
1.34
8628728--8628954
46
4.9
46
92
1
339
23
25
12
38
1.90
8630951--8630998
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
8632431--8632538
24
4.5
24
81
5
83
31
23
21
24
1.98
8632446--8632538
24
3.9
23
83
7
96
33
21
21
23
1.97
8635777--8635803
14
1.9
14
100
0
54
37
14
11
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8637976--8638001
5
5.2
5
100
0
52
38
0
0
61
0.96
8648331--8648437
26
4.1
27
77
9
98
59
4
4
30
1.38
8648331--8648437
52
2.1
51
84
7
135
59
4
4
30
1.38
8648429--8648483
23
2.4
23
84
6
67
61
7
5
25
1.44
8648489--8648581
43
2.1
42
82
5
105
61
2
5
31
1.30
8653145--8653188
10
4.2
10
80
11
52
77
2
9
11
1.08
8653139--8653189
22
2.3
22
86
6
68
76
1
7
13
1.09
8653146--8653192
22
2.1
23
92
4
78
74
4
8
12
1.19
8654299--8654490
64
3.0
64
89
1
278
30
18
15
35
1.92
8654873--8654968
44
2.2
46
85
9
128
30
15
26
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316