Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  25  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7105016--7105269
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0
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0
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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65
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12
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16
73
65
1
3
30
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1.17
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0
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25
22
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20
21
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1.96
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20
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20
21
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22
20
21
35
1.96
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2.8
134
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1
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20
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12
6.8
12
76
16
73
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3
30
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7196274--7196354
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4.4
18
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1.17
7196269--7196355
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27
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1
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1.16
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2.3
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60
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7229362--7229437
27
3.1
27
62
31
69
26
31
18
23
1.97
7229338--7229460
47
2.6
47
97
0
228
29
30
19
20
1.97
7235684--7235728
23
2.0
23
100
0
90
42
0
8
48
1.34
7235873--7235916
19
2.3
19
80
0
52
20
13
4
61
1.50
7240649--7240768
51
2.4
51
91
2
188
39
12
22
25
1.89
7247243--7247544
129
2.4
127
83
3
383
25
18
17
37
1.93
7247939--7247974
18
1.9
19
88
5
56
33
19
13
33
1.91
7250315--7250358
21
2.1
21
95
0
79
0
56
22
20
1.42
7255948--7256052
53
2.1
49
83
7
129
45
3
5
44
1.45
7256097--7256947
421
2.0
421
96
0
1589
39
10
13
36
1.79
7257139--7257167
15
1.9
15
100
0
58
48
20
6
24
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7260998--7261043
24
1.9
24
95
0
83
60
8
13
17
1.56
7262245--7262303
14
4.2
14
77
0
64
44
37
1
16
1.59
7262245--7262303
21
2.8
21
76
0
64
44
37
1
16
1.59
7262402--7262451
8
6.6
8
78
19
54
34
42
0
24
1.55
7262478--7262507
14
2.1
14
100
0
60
56
23
0
20
1.42
7262671--7262708
14
2.7
14
87
0
58
57
18
0
23
1.40
7262666--7262716
14
3.7
14
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12
52
52
25
0
21
1.47
7262942--7263316
156
2.4
155
78
4
355
28
20
21
30
1.98
7268309--7268333
7
3.6
7
100
0
50
24
0
0
76
0.80
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12
2.6
12
100
0
62
38
22
32
6
1.80
7281711--7281835
43
2.9
43
91
2
198
28
33
26
12
1.92
7281828--7281911
38
2.2
38
89
0
123
29
26
22
21
1.99
7288083--7288120
19
2.0
19
85
10
51
21
28
13
36
1.91
7288504--7288544
21
2.0
21
90
0
64
21
26
17
34
1.95
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12
2.1
12
100
0
50
72
0
8
20
1.10
7290719--7290770
22
2.4
22
78
9
54
51
3
7
36
1.49
7292278--7292381
54
1.9
54
92
0
172
27
18
16
37
1.92
7292340--7292630
44
6.7
44
71
7
189
27
23
18
30
1.98
7292841--7292979
44
3.2
44
67
8
138
28
23
21
26
1.99
7292702--7293037
88
3.9
88
89
3
466
23
21
23
31
1.99
7292885--7293023
44
3.2
44
67
8
138
23
20
25
29
1.99
7294104--7294150
21
2.2
21
84
0
58
27
38
8
25
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7295137--7295170
16
2.2
16
89
5
52
11
2
11
73
1.20
7297751--7297799
19
2.5
20
80
6
57
42
12
18
26
1.85
7299686--7299710
12
2.1
12
100
0
50
72
0
8
20
1.10
7299965--7300016
22
2.4
22
78
9
54
51
3
7
36
1.49
7302024--7302081
3
19.3
3
76
13
57
63
0
5
31
1.16
7302459--7302536
3
25.3
3
73
19
56
64
1
3
30
1.20
7302459--7302536
12
6.3
12
78
17
72
64
1
3
30
1.20
7302416--7302539
21
6.1
21
68
21
77
61
0
7
30
1.29
7302459--7302536
25
3.0
27
70
19
76
64
1
3
30
1.20
7303051--7303132
30
2.7
30
92
0
128
28
7
47
17
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316