Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  230  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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39
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1.99
75495196--75495442
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20
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1.99
75495144--75495442
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25
20
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1.99
75495223--75495475
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27
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25
1.99
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1.99
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2.1
119
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297
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1.99
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3.2
80
80
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25
21
28
24
1.99
75555722--75555795
29
2.6
29
84
4
87
27
16
32
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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27
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23
1.99
75565361--75565588
39
5.8
40
88
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277
27
27
21
24
1.99
75565345--75565588
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3.1
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283
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1.99
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40
5.8
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238
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21
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1.99
75573565--75573797
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2.9
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265
28
27
21
23
1.99
75589916--75590180
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40
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25
27
21
25
1.99
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44
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2.0
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10
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20
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3.7
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1.98
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2.0
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22
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53
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330
35
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23
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2.9
106
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24
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1.92
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159
1.9
159
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368
35
13
23
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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75651373--75651406
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2.2
24
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27
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27
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1.99
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252
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1.99
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250
26
27
21
25
1.99
75686140--75686362
120
1.9
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279
26
27
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25
1.99
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21
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0
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2
145
29
16
23
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75724353--75724400
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2.4
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17
15
38
1.91
75766629--75766697
35
1.9
36
85
2
95
73
1
4
20
1.07
75766651--75766700
20
2.4
22
86
6
68
74
0
2
24
0.93
75766670--75766699
16
1.9
15
93
6
51
73
0
0
26
0.84
75766651--75766712
20
3.0
20
79
9
54
70
1
4
22
1.14
75772058--75772090
17
1.9
17
93
0
57
30
0
3
66
1.06
75773183--75773253
34
2.1
34
94
0
124
30
23
4
40
1.74
75773380--75773422
18
2.2
20
84
8
54
44
16
9
30
1.79
75775671--75775789
35
3.4
34
68
13
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45
14
12
27
1.81
75779246--75779346
50
2.0
50
98
0
193
29
25
18
25
1.98
75779319--75779631
47
6.7
46
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12
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21
30
20
27
1.98
75779319--75779631
94
3.4
93
77
9
336
21
30
20
27
1.98
75786008--75786130
43
2.9
43
87
6
169
33
26
15
25
1.95
75792425--75792683
46
5.6
46
91
0
367
20
23
13
42
1.88
75795406--75795629
70
3.2
70
85
1
270
32
11
18
38
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75798797--75798931
43
3.2
43
86
5
175
18
12
23
45
1.84
75800350--75800388
20
2.0
20
100
0
78
15
28
10
46
1.78
75806248--75806431
40
4.6
40
83
4
237
24
26
23
25
2.00
75809775--75809846
25
2.8
26
75
21
80
22
4
4
69
1.23
75812151--75812280
42
3.1
42
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0
206
32
22
20
24
1.98
75814399--75814452
6
9.3
6
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2
76
16
0
3
79
0.87
75818837--75818890
26
2.1
26
96
0
99
42
7
1
48
1.42
75821197--75821266
34
2.1
34
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10
81
27
2
0
70
1.02
75821843--75821980
67
2.1
67
98
0
267
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20
17
22
1.92
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3.7
15
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22
62
45
0
0
54
0.99
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14
3.1
14
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6
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46
0
0
53
1.00
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2.3
29
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107
43
0
0
56
0.99
75822807--75822866
20
3.0
20
70
4
50
38
0
5
56
1.21
75823165--75823242
9
8.7
9
88
0
111
44
24
1
29
1.62
75828282--75828310
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2.1
14
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34
0
10
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1.34
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21
3.4
21
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0
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29
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1.65
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31
2.1
31
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0
87
18
9
19
53
1.71
75829194--75829556
43
8.5
43
88
0
476
26
30
15
26
1.96
75829194--75829561
129
2.9
129
90
0
558
26
30
16
26
1.97
75830714--75830740
11
2.5
11
100
0
54
51
0
7
40
1.30
75835872--75835907
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2.2
17
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38
11
0
50
1.38
75837274--75837335
28
2.2
28
85
0
79
33
17
16
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75837494--75837578
28
3.0
28
87
3
118
31
21
17
29
1.96
75841079--75841114
17
2.1
18
89
5
56
47
5
5
41
1.50
75843896--75844052
43
3.7
42
73
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131
25
17
28
28
1.98
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648
2.0
648
96
0
2401
28
8
21
41
1.82
75874282--75874430
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3.5
43
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8
142
28
16
24
30
1.97
75876513--75876604
45
2.0
45
95
0
166
42
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75881042--75881153
25
4.5
24
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7
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33
20
21
24
1.97
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34
20
22
22
1.97
75881042--75881254
99
2.2
99
86
0
291
34
20
21
23
1.97
75885404--75885809
41
10.0
41
86
5
486
34
23
21
19
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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