Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  47  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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13551568--13551803
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1.8
128
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330
24
16
30
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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18
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22
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1
0
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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1.95
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23
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2.0
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20
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146
26
12
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15.0
7
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9
56
20
0
39
40
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13650372--13650457
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29
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10
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2.5
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97
0
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11
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28
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13
19
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20
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12
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1.89
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35
2.6
36
75
17
92
18
23
17
39
1.92
13661961--13661999
15
2.5
15
87
4
51
61
0
2
35
1.10
13662193--13662251
31
1.9
30
82
3
73
55
0
8
35
1.30
13663885--13664615
44
16.6
44
72
10
285
27
24
16
31
1.96
13663885--13664615
88
8.3
88
71
10
346
27
24
16
31
1.96
13664041--13664427
177
2.2
176
92
0
639
27
22
18
31
1.97
13664598--13664625
14
2.0
14
100
0
56
14
21
14
50
1.78
13675881--13676103
40
5.6
40
86
3
236
24
21
28
26
1.99
13675956--13676138
79
2.3
80
83
1
226
25
21
28
25
1.99
13678233--13678275
17
2.5
17
84
3
59
60
0
2
37
1.10
13678231--13678274
19
2.4
18
85
7
61
59
0
2
38
1.10
13678583--13678643
21
3.1
20
70
9
54
52
1
1
44
1.20
13682489--13682590
33
3.1
31
71
22
82
45
1
0
52
1.12
13682542--13682598
30
1.9
30
85
7
80
47
1
0
50
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13682783--13682824
13
3.3
13
80
3
50
42
19
2
35
1.64
13684250--13684395
48
3.0
48
86
4
197
19
16
29
34
1.94
13701040--13701072
6
5.5
6
96
0
57
15
3
0
81
0.80
13701040--13701079
18
2.2
18
86
0
53
17
5
0
77
0.94
13714845--13714883
19
2.1
19
90
0
60
38
2
25
33
1.70
13727250--13727304
22
2.5
22
73
11
58
30
21
18
29
1.97
13734216--13734284
23
3.0
23
86
0
93
23
23
17
36
1.95
13734254--13734328
22
3.4
21
88
5
96
34
20
17
28
1.95
13736252--13736404
56
2.7
55
79
4
164
20
17
32
29
1.95
13741103--13741259
43
3.7
44
80
10
157
31
24
18
24
1.97
13741103--13741265
44
3.8
43
78
12
165
32
24
18
24
1.97
13746401--13746530
35
3.6
35
75
13
145
33
22
13
30
1.93
13749446--13749478
10
3.3
10
95
0
57
57
0
18
24
1.40
13762642--13762758
51
2.3
51
86
1
162
25
25
7
41
1.82
13766692--13766867
46
3.8
46
78
15
200
22
21
27
28
1.99
13766689--13766860
93
1.8
93
92
0
290
23
21
27
27
1.99
13769812--13769855
15
2.9
15
80
12
54
11
15
15
56
1.66
13772256--13772430
46
3.8
46
79
10
212
21
21
29
27
1.99
13772252--13772422
93
1.8
93
94
0
306
21
22
29
26
1.99
13784361--13784535
46
3.8
46
79
10
212
21
21
29
27
1.99
13784357--13784527
93
1.8
93
94
0
306
21
22
29
26
1.99
13787234--13787321
25
3.6
25
77
9
83
22
22
21
32
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13800244--13800274
16
1.9
16
93
0
53
58
12
0
29
1.35
13808449--13808508
25
2.4
25
82
2
75
21
21
16
40
1.92
13808691--13808741
22
2.2
22
82
10
57
35
7
19
37
1.81
13817305--13817644
50
6.8
50
72
5
249
26
18
24
30
1.98
13817306--13817489
101
1.8
101
85
0
260
26
18
24
30
1.98
13817305--13817653
149
2.3
150
86
2
486
27
17
24
30
1.97
13817887--13817918
16
2.0
16
93
0
55
46
0
18
34
1.49
13823855--13824398
50
10.8
50
74
4
441
26
17
25
30
1.97
13823856--13824398
101
5.4
99
75
6
405
26
17
25
30
1.97
13823854--13824397
151
3.6
151
91
0
854
26
17
25
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316