Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  51  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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82
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149
9
8
8
73
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14999933--14999977
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22
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25
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1.30
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2.8
28
74
21
72
55
0
0
44
0.99
15008374--15008431
22
2.5
23
86
8
82
58
0
0
41
0.98
15008382--15008468
38
2.3
38
88
5
124
59
0
0
40
0.97
15008468--15008493
13
2.0
13
100
0
52
53
7
0
38
1.30
15008558--15008644
35
2.5
34
80
9
95
75
4
6
12
1.15
15009921--15009980
20
2.9
20
76
14
59
63
1
1
33
1.14
15011345--15011412
22
3.0
22
81
10
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35
14
22
27
1.93
15012227--15012269
22
2.0
22
85
0
59
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0
2
44
1.13
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0
36
0
63
0.95
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16
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17
72
12
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40
3
0
55
1.17
15019379--15019410
15
2.1
15
94
0
55
15
6
9
68
1.36
15023902--15023959
28
2.1
28
100
0
116
18
37
10
32
1.85
15031379--15031423
17
2.7
16
80
10
54
17
0
8
73
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15034119--15034166
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3.9
12
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2
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58
2
0
39
1.10
15039421--15039451
14
2.2
14
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0
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0
16
22
1.34
15039476--15039506
4
7.8
4
92
0
53
70
0
25
3
1.02
15043450--15043520
35
2.0
35
83
0
88
33
11
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28
1.91
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18
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0
0
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0
0
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1.00
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0
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2
32
1.65
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21
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0
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18
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4
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0
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0
0
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27
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0
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28
24
7
39
1.83
15077704--15077869
81
2.0
81
96
0
305
28
24
7
39
1.83
15077704--15077911
27
7.7
27
84
0
238
29
22
8
39
1.84
15077718--15077901
81
2.3
81
90
0
278
29
22
7
40
1.82
15077930--15078110
27
6.7
27
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3
222
41
21
7
28
1.81
15077905--15078110
54
3.8
53
80
5
209
42
21
7
28
1.80
15078040--15078163
27
4.5
27
77
11
108
45
17
6
30
1.74
15078088--15078173
27
3.1
27
79
14
86
40
13
10
34
1.80
15078227--15078303
27
2.9
28
81
11
90
33
18
23
24
1.96
15079037--15079067
16
1.9
16
93
0
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32
19
12
35
1.90
15079100--15079169
25
2.8
24
89
4
95
25
27
22
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15079100--15079182
25
3.4
24
85
8
87
28
24
22
24
1.99
15079317--15079407
41
2.2
42
96
2
166
30
15
20
32
1.94
15079431--15079514
31
2.7
31
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1
125
29
17
23
28
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5.4
5
100
0
54
59
0
0
40
0.98
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2.1
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35
0
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54
1.33
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2.0
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135
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1.92
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2.0
45
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135
29
25
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21
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0
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0
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1.58
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31
1.9
30
83
10
75
30
15
5
49
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316