Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  31  of  316  ( 37835 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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4.6
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11
32
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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35
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.91
9041386--9041488
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118
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27
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59
1.56
9075936--9075995
30
2.0
30
90
0
93
40
5
25
30
1.77
9081151--9081232
31
2.7
31
79
7
78
56
8
8
26
1.58
9082676--9082794
25
4.7
25
72
19
95
29
5
4
61
1.36
9082729--9082800
29
2.5
28
82
8
90
33
4
1
61
1.24
9082932--9082989
24
2.4
25
80
8
66
34
12
1
51
1.49
9082996--9083054
25
2.4
25
80
8
68
32
3
0
64
1.10
9083025--9083084
30
2.0
31
83
3
77
31
8
0
60
1.27
9083060--9083121
24
2.4
26
76
17
67
38
4
0
56
1.21
9083067--9083112
24
1.9
24
90
0
74
41
4
0
54
1.20
9086458--9086487
6
5.0
6
95
0
51
36
0
16
46
1.47
9086864--9086904
17
2.4
18
80
15
52
56
7
2
34
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9090677--9090761
39
2.2
38
93
4
145
47
8
4
40
1.54
9097417--9097449
17
2.0
16
94
5
57
66
0
21
12
1.23
9102619--9102654
13
2.5
15
91
8
58
19
0
0
80
0.71
9108466--9108491
13
2.0
13
100
0
52
15
7
23
53
1.67
9109142--9109243
30
3.4
31
86
5
131
29
21
3
45
1.70
9109619--9109689
3
22.0
3
88
11
97
66
0
33
0
0.92
9109620--9109700
28
2.7
30
88
5
112
70
0
29
0
0.88
9109620--9109699
22
3.5
22
85
11
99
70
0
30
0
0.88
9109742--9109784
18
2.3
18
84
4
50
30
51
16
2
1.57
9109962--9110007
24
1.9
24
86
8
67
80
0
19
0
0.71
9109976--9110018
17
2.5
17
88
7
61
81
2
16
0
0.79
9109962--9110020
25
2.4
25
83
8
68
79
1
18
0
0.81
9110171--9110198
5
5.6
5
100
0
56
35
0
0
64
0.94
9110162--9110226
27
2.4
27
78
2
67
26
1
0
72
0.94
9110556--9110674
35
3.4
35
80
10
136
31
10
5
52
1.59
9110549--9110670
18
6.9
18
71
14
76
31
10
7
50
1.64
9110755--9110801
17
2.5
19
76
16
53
38
8
8
44
1.65
9110763--9110960
17
11.3
17
72
11
116
33
12
8
45
1.72
9110993--9111040
17
2.6
19
83
9
64
35
14
6
43
1.71
9110993--9111037
18
2.5
18
85
7
56
35
15
6
42
1.73
9110810--9111074
36
7.3
36
72
15
111
33
14
8
43
1.76
9110997--9111093
37
2.6
39
73
14
103
35
16
9
39
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9111100--9111141
21
2.0
22
90
4
68
40
2
9
47
1.49
9111139--9111181
17
2.4
18
76
3
52
37
16
9
37
1.81
9111203--9111257
18
3.1
17
80
15
67
30
10
10
47
1.73
9122759--9122985
122
1.9
122
82
1
285
32
14
20
33
1.92
9122688--9123108
191
2.2
192
96
0
772
30
14
20
34
1.92
9123067--9123315
91
2.8
87
82
10
292
26
19
18
35
1.95
9123067--9123324
85
2.9
88
80
10
307
26
18
18
36
1.94
9123428--9123645
54
4.1
55
87
8
315
29
16
17
37
1.91
9123914--9124015
30
3.4
31
86
5
131
29
21
3
45
1.70
9124243--9124285
18
2.4
18
88
0
59
69
6
9
13
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316