Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  301  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2.5
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2.0
73
98
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2.0
30
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0
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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0
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1.11
99391177--99391252
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0
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1.9
157
94
2
542
48
5
2
43
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
157
94
1
555
43
3
5
47
1.41
99405309--99405350
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
99405318--99405359
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
99405312--99405604
120
2.4
121
94
2
502
50
4
3
41
1.39
99405438--99405479
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
99409141--99409169
6
4.8
6
100
0
58
31
0
68
0
0.89
99412867--99412910
22
2.0
22
91
8
72
38
0
0
61
0.96
99415152--99415215
31
2.1
31
88
2
94
34
14
10
40
1.80
99423384--99423539
60
2.5
60
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7
179
17
14
18
49
1.80
99433392--99433562
85
2.0
85
81
2
200
28
13
18
39
1.89
99435906--99435951
19
2.3
20
82
14
60
47
8
6
36
1.60
99438504--99438691
64
3.0
63
82
3
243
44
6
6
42
1.56
99440771--99440808
16
2.3
17
90
4
60
57
2
0
39
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99441186--99441265
35
2.2
37
82
8
94
50
6
1
42
1.35
99448073--99448117
19
2.4
19
80
0
54
42
2
2
53
1.25
99448118--99448163
19
2.5
19
89
3
67
52
2
0
45
1.13
99448065--99448180
43
2.6
44
80
14
114
49
1
1
47
1.22
99449267--99449310
22
2.0
22
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0
70
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0
0
45
0.99
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13
2.9
14
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13
50
54
0
0
45
0.99
99449334--99449370
16
2.3
16
86
13
58
59
0
0
40
0.97
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2.2
26
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0
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34
5
24
36
1.78
99456388--99456564
50
3.5
50
87
2
257
34
16
22
26
1.95
99456542--99456781
31
7.7
31
90
0
354
28
19
25
26
1.99
99456780--99456812
7
4.7
7
100
0
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45
15
27
12
1.81
99460491--99460534
18
2.3
20
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18
58
31
15
0
52
1.44
99477503--99477992
44
11.1
45
81
4
469
28
16
25
29
1.97
99477498--99477940
132
3.3
132
95
0
778
28
15
25
30
1.96
99480179--99480222
18
2.3
20
81
18
58
31
15
0
52
1.44
99489835--99489893
29
2.0
30
90
3
93
50
13
5
30
1.63
99495711--99495877
35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
99495706--99495877
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
99499383--99499435
18
2.8
19
88
8
81
49
1
3
45
1.31
99499383--99499434
19
2.8
18
91
5
77
48
1
3
46
1.31
99502590--99502644
22
2.5
22
87
3
74
27
21
3
47
1.68
99510880--99511268
73
5.1
75
78
11
387
28
15
20
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99512903--99512955
3
18.3
3
75
21
51
30
1
0
67
1.01
99512890--99512955
22
3.0
21
77
12
71
27
1
0
71
0.95
99512899--99512955
18
3.2
18
75
9
64
29
1
0
68
1.00
99513086--99513696
23
26.3
23
65
23
147
33
5
5
55
1.47
99513093--99513276
65
2.8
63
72
17
160
33
3
5
57
1.39
99513478--99513525
25
1.9
25
82
0
60
31
12
8
47
1.71
99513631--99513670
21
2.0
21
90
5
64
35
10
2
52
1.48
99518997--99519045
21
2.4
20
82
3
53
55
12
2
30
1.48
99519097--99519162
24
2.7
24
77
15
64
62
7
1
28
1.32
99519129--99519173
23
2.0
22
83
8
56
60
6
4
28
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316